28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlut_11990 on replicon NC_012803
Organism: Micrococcus luteus NCTC 2665



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_11990  hypothetical protein  100 
 
 
361 aa  670    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.340317  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  48.72 
 
 
558 aa  96.7  6e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  36.48 
 
 
552 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  32.52 
 
 
541 aa  89.7  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  35.74 
 
 
520 aa  86.3  7e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  38.75 
 
 
551 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  37.18 
 
 
526 aa  80.1  0.00000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  35.71 
 
 
518 aa  78.6  0.0000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  37.71 
 
 
553 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  45.37 
 
 
539 aa  77  0.0000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  36.87 
 
 
534 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  54.84 
 
 
542 aa  74.7  0.000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  32.74 
 
 
541 aa  74.7  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  36.09 
 
 
530 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  36.09 
 
 
530 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  36.09 
 
 
530 aa  73.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  36.67 
 
 
547 aa  72.4  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  53.23 
 
 
559 aa  69.7  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  42.73 
 
 
546 aa  67.4  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  37.83 
 
 
526 aa  63.5  0.000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15990  hypothetical protein  40.31 
 
 
266 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229387  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  33.8 
 
 
548 aa  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  31.14 
 
 
512 aa  51.6  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  43.55 
 
 
521 aa  50.1  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  30.77 
 
 
498 aa  50.1  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  36.59 
 
 
513 aa  48.1  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  40 
 
 
537 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  40.32 
 
 
563 aa  43.1  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>