More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_12089 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1050    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  69.91 
 
 		 526 aa  643    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  69 
 
 		 530 aa  654    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  69 
 
 		 530 aa  652    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  69 
 
 		 530 aa  652    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  65.79 
 
 		 526 aa  641    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  55.78 
 
 		 541 aa  532  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  56.8 
 
 		 552 aa  522  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  56.47 
 
 		 518 aa  517  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  53.11 
 
 		 520 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  47.57 
 
 		 553 aa  403  1e-111  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  48.7 
 
 		 546 aa  404  1e-111  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  46.14 
 
 		 551 aa  370  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  46.24 
 
 		 548 aa  368  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  44.69 
 
 		 558 aa  369  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  44.81 
 
 		 542 aa  350  4e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  47.26 
 
 		 547 aa  347  2e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  44.76 
 
 		 521 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  42.44 
 
 		 512 aa  338  9.999999999999999e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  48.27 
 
 		 513 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  41.25 
 
 		 541 aa  332  1e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  43.39 
 
 		 539 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  39.82 
 
 		 563 aa  321  3e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  45.14 
 
 		 498 aa  313  4.999999999999999e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  38.97 
 
 		 559 aa  300  5e-80  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  38.04 
 
 		 522 aa  243  7e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  34.03 
 
 		 540 aa  179  9e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  27.35 
 
 		 520 aa  172  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  23.45 
 
 		 505 aa  160  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  32.26 
 
 		 539 aa  159  1e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  29.26 
 
 		 553 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  29.12 
 
 		 546 aa  145  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  27.2 
 
 		 583 aa  144  4e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  30.21 
 
 		 568 aa  143  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.02 
 
 		 530 aa  143  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  24.53 
 
 		 574 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  31.32 
 
 		 556 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  31.12 
 
 		 543 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  27.94 
 
 		 541 aa  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  22.66 
 
 		 533 aa  134  3.9999999999999996e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  26.59 
 
 		 543 aa  134  3.9999999999999996e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.57 
 
 		 527 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  33.26 
 
 		 492 aa  130  7.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  28.16 
 
 		 562 aa  128  2.0000000000000002e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  27.39 
 
 		 549 aa  128  3e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  30.06 
 
 		 540 aa  126  1e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  29.26 
 
 		 554 aa  125  1e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  27.03 
 
 		 544 aa  125  2e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  25.62 
 
 		 452 aa  124  3e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  29.22 
 
 		 532 aa  124  5e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  22.77 
 
 		 522 aa  124  6e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  25.71 
 
 		 548 aa  123  7e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2930  amidohydrolase 3  26.91 
 
 		 606 aa  123  8e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.143401 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  28.13 
 
 		 547 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  23.51 
 
 		 520 aa  121  3e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  27.62 
 
 		 546 aa  120  7e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3318  twin-arginine translocation pathway signal  29.02 
 
 		 543 aa  120  7.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  22.88 
 
 		 522 aa  120  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  28.71 
 
 		 538 aa  120  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3380  amidohydrolase 3  29.18 
 
 		 583 aa  120  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.121577 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3329  amidohydrolase 3  29.18 
 
 		 583 aa  120  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.842  normal  0.159954 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  23.21 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  23.02 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  29.05 
 
 		 620 aa  118  3e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  23.21 
 
 		 522 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  32.1 
 
 		 505 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.29 
 
 		 565 aa  117  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  26.83 
 
 		 543 aa  117  5e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  22.97 
 
 		 522 aa  117  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  22.73 
 
 		 522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  30.72 
 
 		 565 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  22.82 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  22.82 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  25.26 
 
 		 556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24 
 
 		 540 aa  115  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  22.4 
 
 		 522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  26.64 
 
 		 543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  31.21 
 
 		 545 aa  114  5e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  28.19 
 
 		 535 aa  114  5e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  31.63 
 
 		 536 aa  114  5e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.51 
 
 		 544 aa  113  8.000000000000001e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  28.07 
 
 		 537 aa  113  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  27.05 
 
 		 545 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  31.03 
 
 		 544 aa  110  7.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  29.84 
 
 		 522 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  24.61 
 
 		 569 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  22.54 
 
 		 557 aa  109  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  24.76 
 
 		 550 aa  108  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  29.31 
 
 		 579 aa  108  2e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  24.8 
 
 		 556 aa  108  3e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  24.19 
 
 		 552 aa  107  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  28.54 
 
 		 552 aa  107  5e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  30.5 
 
 		 538 aa  107  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  28.28 
 
 		 499 aa  107  8e-22  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  24.86 
 
 		 560 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  26.4 
 
 		 619 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  23.68 
 
 		 539 aa  105  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  29.8 
 
 		 508 aa  105  3e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2780  amidohydrolase  26.2 
 
 		 576 aa  104  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  24.15 
 
 		 563 aa  103  7e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>