More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2383 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  100 
 
 
521 aa  1014    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  88.55 
 
 
498 aa  810    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  56.07 
 
 
512 aa  514  1e-144  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  51.93 
 
 
553 aa  469  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  48.53 
 
 
552 aa  400  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  48.78 
 
 
518 aa  399  1e-109  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  47.15 
 
 
548 aa  375  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  46.28 
 
 
530 aa  352  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  46.28 
 
 
530 aa  352  8.999999999999999e-96  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  46.1 
 
 
530 aa  351  2e-95  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  43.2 
 
 
558 aa  344  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  44.51 
 
 
563 aa  342  1e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  45.1 
 
 
551 aa  335  1e-90  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  48.71 
 
 
513 aa  333  5e-90  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  45 
 
 
526 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  43.06 
 
 
559 aa  327  3e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  42.81 
 
 
541 aa  317  4e-85  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  45.74 
 
 
526 aa  315  9.999999999999999e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  44.53 
 
 
520 aa  315  1.9999999999999998e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  42.75 
 
 
542 aa  310  2.9999999999999997e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  45.07 
 
 
547 aa  309  6.999999999999999e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  42.3 
 
 
539 aa  308  1.0000000000000001e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  44.76 
 
 
534 aa  305  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  42.57 
 
 
546 aa  299  6e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  42.28 
 
 
522 aa  293  4e-78  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  38.54 
 
 
541 aa  267  4e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  26.42 
 
 
520 aa  181  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  25.17 
 
 
505 aa  168  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  32.38 
 
 
540 aa  162  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  30.36 
 
 
532 aa  152  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.4 
 
 
583 aa  145  1e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  30.21 
 
 
553 aa  145  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.28 
 
 
543 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  30.26 
 
 
556 aa  139  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  29.23 
 
 
527 aa  138  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  27.75 
 
 
452 aa  136  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  29.83 
 
 
535 aa  134  3e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  29.78 
 
 
530 aa  134  6e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  30.87 
 
 
568 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  31.36 
 
 
539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  29.07 
 
 
537 aa  130  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  31.1 
 
 
485 aa  129  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  32.03 
 
 
544 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  27.16 
 
 
562 aa  125  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  25.38 
 
 
533 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  30.59 
 
 
540 aa  123  9e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  29.33 
 
 
542 aa  122  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  32.38 
 
 
492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  25.5 
 
 
539 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  30.63 
 
 
565 aa  118  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  29.05 
 
 
522 aa  117  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  27.31 
 
 
555 aa  117  6e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  31.63 
 
 
548 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  31.83 
 
 
543 aa  116  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  28.6 
 
 
537 aa  114  3e-24  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  28.36 
 
 
556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  32.28 
 
 
536 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  26.44 
 
 
553 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  29.41 
 
 
538 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  27.29 
 
 
583 aa  111  3e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  29.56 
 
 
579 aa  109  1e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  29.31 
 
 
547 aa  109  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  28.51 
 
 
543 aa  108  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  27.71 
 
 
541 aa  108  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.74 
 
 
540 aa  108  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.1 
 
 
565 aa  108  3e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.47 
 
 
560 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  25.81 
 
 
550 aa  104  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  24.69 
 
 
556 aa  103  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  30.36 
 
 
505 aa  103  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  27.21 
 
 
484 aa  102  1e-20  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  32.89 
 
 
536 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  31.34 
 
 
548 aa  103  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  24.02 
 
 
546 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  30.87 
 
 
536 aa  102  2e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  28.69 
 
 
553 aa  101  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  29.14 
 
 
525 aa  101  4e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.75 
 
 
541 aa  99.4  1e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.87 
 
 
544 aa  99  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  26.89 
 
 
542 aa  98.6  3e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  25.58 
 
 
541 aa  98.2  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.56 
 
 
575 aa  97.4  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.56 
 
 
575 aa  97.4  6e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  32.75 
 
 
532 aa  97.4  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  26.62 
 
 
619 aa  97.4  6e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  26.03 
 
 
557 aa  97.1  7e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  25.16 
 
 
544 aa  96.3  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3425  Amidohydrolase 3  30.07 
 
 
491 aa  96.3  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0036735  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  23.73 
 
 
548 aa  96.3  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  24.08 
 
 
574 aa  95.9  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  28.04 
 
 
501 aa  95.9  2e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  27.87 
 
 
584 aa  94.7  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.14 
 
 
549 aa  94  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  26.08 
 
 
543 aa  93.6  8e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  26.88 
 
 
538 aa  92.8  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  29.62 
 
 
545 aa  92.4  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  24.31 
 
 
543 aa  92  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  29.04 
 
 
537 aa  92  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  24.55 
 
 
522 aa  91.7  3e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  26.89 
 
 
565 aa  90.9  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>