More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2501 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  99.62 
 
 
530 aa  1035    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  76.17 
 
 
526 aa  684    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  100 
 
 
530 aa  1040    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  69 
 
 
534 aa  642    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  100 
 
 
530 aa  1040    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  73.55 
 
 
526 aa  706    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  58.35 
 
 
541 aa  554  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  59.07 
 
 
552 aa  537  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  59.09 
 
 
518 aa  529  1e-149  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  58.25 
 
 
520 aa  501  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  50.19 
 
 
553 aa  424  1e-117  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  51.01 
 
 
546 aa  419  1e-116  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  46 
 
 
558 aa  394  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  46.08 
 
 
551 aa  378  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  46.28 
 
 
521 aa  372  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  45.45 
 
 
539 aa  370  1e-101  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  46.73 
 
 
548 aa  366  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  45.93 
 
 
542 aa  365  1e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  49.05 
 
 
547 aa  362  1e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  47.59 
 
 
498 aa  355  1e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  50.64 
 
 
513 aa  348  1e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  43.47 
 
 
512 aa  337  2.9999999999999997e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  41.14 
 
 
541 aa  326  7e-88  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  41.08 
 
 
559 aa  324  3e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  44.21 
 
 
563 aa  318  1e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  38.01 
 
 
522 aa  251  2e-65  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  28.1 
 
 
520 aa  195  2e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  34.36 
 
 
540 aa  193  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  34.73 
 
 
539 aa  169  8e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  29.76 
 
 
553 aa  167  5.9999999999999996e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.32 
 
 
583 aa  156  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  32.25 
 
 
530 aa  156  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  32.01 
 
 
556 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  31.86 
 
 
568 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  24.68 
 
 
505 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.5 
 
 
544 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.01 
 
 
543 aa  140  7e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  28.71 
 
 
543 aa  140  7.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  29.49 
 
 
540 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  23.19 
 
 
533 aa  129  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  29.83 
 
 
565 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.45 
 
 
527 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  30.75 
 
 
554 aa  127  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.66 
 
 
565 aa  125  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.71 
 
 
556 aa  124  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  28.87 
 
 
532 aa  123  8e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  25.37 
 
 
452 aa  121  3e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.37 
 
 
544 aa  120  7e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  25.45 
 
 
543 aa  120  7.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  28.04 
 
 
547 aa  119  9e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  23.02 
 
 
574 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  25.46 
 
 
546 aa  119  9.999999999999999e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  27.07 
 
 
541 aa  119  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.03 
 
 
560 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  25.11 
 
 
548 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  26.65 
 
 
553 aa  116  8.999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  22.95 
 
 
539 aa  113  7.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  30.44 
 
 
545 aa  112  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  25.05 
 
 
550 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  26.96 
 
 
619 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  29.78 
 
 
544 aa  111  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  26.88 
 
 
535 aa  111  3e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  27.15 
 
 
549 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  26.67 
 
 
569 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  27.62 
 
 
562 aa  109  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  25.4 
 
 
543 aa  108  3e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  30.06 
 
 
536 aa  107  4e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.94 
 
 
538 aa  107  5e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  29.1 
 
 
550 aa  106  9e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  29.26 
 
 
550 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  30.18 
 
 
475 aa  104  3e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  31.01 
 
 
492 aa  104  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  31.83 
 
 
547 aa  104  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  29.11 
 
 
543 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  24.17 
 
 
552 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  25.23 
 
 
541 aa  103  7e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  26.92 
 
 
485 aa  103  7e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  21.43 
 
 
522 aa  102  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  29.74 
 
 
477 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  29.48 
 
 
505 aa  102  2e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  26.55 
 
 
537 aa  101  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  22.43 
 
 
563 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  30.19 
 
 
551 aa  101  3e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  29.62 
 
 
522 aa  101  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  23.56 
 
 
539 aa  100  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  29.2 
 
 
552 aa  100  6e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  26.68 
 
 
542 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  23.05 
 
 
522 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  25 
 
 
557 aa  99  2e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  23.47 
 
 
520 aa  98.6  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  29.07 
 
 
525 aa  99.4  2e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  31.79 
 
 
532 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  22.58 
 
 
522 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  23.43 
 
 
557 aa  98.2  3e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  25.37 
 
 
556 aa  97.8  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  28.44 
 
 
508 aa  98.2  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  29.66 
 
 
549 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.29 
 
 
542 aa  97.8  5e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  26.92 
 
 
484 aa  97.4  6e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  21.25 
 
 
522 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>