More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4491 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  100 
 
 		 508 aa  991    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09430  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  52.26 
 
 		 506 aa  468  9.999999999999999e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392423  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  45.11 
 
 		 536 aa  335  1e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  44.92 
 
 		 492 aa  324  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06300  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  46.86 
 
 		 504 aa  322  8e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  45.23 
 
 		 505 aa  317  4e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  40.61 
 
 		 484 aa  291  3e-77  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3965  amidohydrolase 3  42.8 
 
 		 509 aa  270  2.9999999999999997e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3425  Amidohydrolase 3  41.37 
 
 		 491 aa  259  5.0000000000000005e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0036735  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06500  conserved hypothetical protein  31.75 
 
 		 513 aa  204  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  30.65 
 
 		 527 aa  183  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 543 aa  180  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  34.45 
 
 		 530 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  32.82 
 
 		 556 aa  171  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  34.84 
 
 		 522 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  32.76 
 
 		 568 aa  165  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  31.26 
 
 		 532 aa  151  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  28.05 
 
 		 546 aa  145  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 554 aa  141  3e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.1 
 
 		 556 aa  140  7e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  33.05 
 
 		 565 aa  137  5e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  28.02 
 
 		 550 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  28.78 
 
 		 548 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  31.53 
 
 		 553 aa  134  3e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  33.27 
 
 		 539 aa  134  3.9999999999999996e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.11 
 
 		 560 aa  134  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.68 
 
 		 583 aa  133  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  27.35 
 
 		 452 aa  133  6.999999999999999e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.42 
 
 		 544 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  32.19 
 
 		 538 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  32.2 
 
 		 540 aa  130  7.000000000000001e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  32.29 
 
 		 542 aa  126  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.97 
 
 		 542 aa  126  1e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  28.36 
 
 		 547 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  27.43 
 
 		 619 aa  123  9e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  25.9 
 
 		 557 aa  122  1.9999999999999998e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  23.97 
 
 		 505 aa  121  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  26.54 
 
 		 522 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  29 
 
 		 537 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  31.03 
 
 		 535 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  30.34 
 
 		 544 aa  120  7e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  26.24 
 
 		 522 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  24.71 
 
 		 520 aa  120  7.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  32.82 
 
 		 499 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  28.1 
 
 		 562 aa  118  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  27.74 
 
 		 549 aa  117  6.9999999999999995e-25  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.74 
 
 		 575 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.74 
 
 		 575 aa  116  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.35 
 
 		 556 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  26.77 
 
 		 522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  27.96 
 
 		 525 aa  112  1.0000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  29.55 
 
 		 540 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  32.55 
 
 		 501 aa  111  2.0000000000000002e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  26.42 
 
 		 552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  26 
 
 		 522 aa  111  3e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  23.42 
 
 		 533 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  29.71 
 
 		 553 aa  107  4e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  27.75 
 
 		 550 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  24.49 
 
 		 544 aa  106  9e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  27.67 
 
 		 584 aa  106  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.16 
 
 		 565 aa  105  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  27.92 
 
 		 550 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  30.51 
 
 		 537 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  27.23 
 
 		 543 aa  104  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  26.64 
 
 		 543 aa  104  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  27.2 
 
 		 527 aa  102  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 548 aa  102  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  26.03 
 
 		 543 aa  101  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.46 
 
 		 540 aa  101  4e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  25.86 
 
 		 553 aa  101  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  26.38 
 
 		 603 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  29.07 
 
 		 485 aa  100  6e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  29.17 
 
 		 539 aa  99.8  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  31.82 
 
 		 475 aa  99.4  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  28.37 
 
 		 549 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  24.25 
 
 		 541 aa  99  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  28.75 
 
 		 537 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  30.65 
 
 		 522 aa  98.6  2e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  21.83 
 
 		 526 aa  98.6  2e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1596  amidohydrolase 3  24.81 
 
 		 436 aa  97.8  4e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  30.27 
 
 		 522 aa  97.8  4e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  26 
 
 		 563 aa  96.7  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  28.12 
 
 		 552 aa  96.7  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  24.59 
 
 		 555 aa  96.7  9e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  30.53 
 
 		 522 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  30.53 
 
 		 522 aa  95.5  2e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.72 
 
 		 552 aa  95.9  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  27.82 
 
 		 546 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  34.22 
 
 		 547 aa  95.1  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  38.2 
 
 		 538 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  25.4 
 
 		 625 aa  95.5  2e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  24.7 
 
 		 520 aa  94.7  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.48 
 
 		 522 aa  95.1  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  30.53 
 
 		 522 aa  95.1  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  23.34 
 
 		 564 aa  94.4  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  27.22 
 
 		 542 aa  94.4  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  24.13 
 
 		 435 aa  94  5e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  29.28 
 
 		 521 aa  93.2  9e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  30.15 
 
 		 522 aa  93.2  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  28.21 
 
 		 556 aa  93.2  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>