More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09430 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09430  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 506 aa  984    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392423  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  52.26 
 
 		 508 aa  451  1e-125  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  49.41 
 
 		 536 aa  343  5.999999999999999e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  46.06 
 
 		 492 aa  334  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06300  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  44.74 
 
 		 504 aa  333  6e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  42.42 
 
 		 484 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  42.8 
 
 		 505 aa  304  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3965  amidohydrolase 3  40.9 
 
 		 509 aa  263  4e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3425  Amidohydrolase 3  37.78 
 
 		 491 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0036735  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06500  conserved hypothetical protein  33.53 
 
 		 513 aa  230  4e-59  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.65 
 
 		 527 aa  170  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  32.11 
 
 		 530 aa  163  8.000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  32.59 
 
 		 568 aa  158  2e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  30.55 
 
 		 532 aa  155  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  31.29 
 
 		 556 aa  150  6e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.96 
 
 		 553 aa  147  6e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  26.79 
 
 		 556 aa  139  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.29 
 
 		 583 aa  137  5e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  29.52 
 
 		 522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.68 
 
 		 543 aa  131  2.0000000000000002e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  27.97 
 
 		 546 aa  128  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.73 
 
 		 556 aa  128  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  31.61 
 
 		 477 aa  128  3e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  29.46 
 
 		 548 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  29.4 
 
 		 554 aa  127  5e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  31.95 
 
 		 565 aa  127  7e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.04 
 
 		 520 aa  127  7e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  29.56 
 
 		 553 aa  123  7e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.53 
 
 		 522 aa  123  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  31.49 
 
 		 501 aa  123  8e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  28.17 
 
 		 540 aa  120  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 537 aa  120  7.999999999999999e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  25.96 
 
 		 619 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  28.94 
 
 		 547 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  24.76 
 
 		 522 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  30.17 
 
 		 499 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  25.47 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.33 
 
 		 560 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  24.16 
 
 		 539 aa  118  1.9999999999999998e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  25.38 
 
 		 522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  25.87 
 
 		 550 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  28.82 
 
 		 552 aa  115  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  26.22 
 
 		 557 aa  114  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  23.63 
 
 		 533 aa  114  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  28.35 
 
 		 548 aa  115  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  27.26 
 
 		 543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  25.63 
 
 		 520 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1596  amidohydrolase 3  25.52 
 
 		 436 aa  110  8.000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  26.11 
 
 		 581 aa  109  1e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.91 
 
 		 540 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.66 
 
 		 565 aa  108  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  27.94 
 
 		 550 aa  108  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  25 
 
 		 553 aa  108  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  27.07 
 
 		 550 aa  107  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  29 
 
 		 539 aa  107  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  25.15 
 
 		 541 aa  107  6e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.62 
 
 		 542 aa  106  9e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  23.31 
 
 		 452 aa  106  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  23.61 
 
 		 505 aa  106  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  25.25 
 
 		 549 aa  105  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.37 
 
 		 544 aa  105  2e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  25.65 
 
 		 552 aa  104  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  27.95 
 
 		 549 aa  104  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  31.37 
 
 		 536 aa  104  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  25.37 
 
 		 544 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  29.7 
 
 		 475 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  22.3 
 
 		 526 aa  102  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  24.28 
 
 		 603 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  25.74 
 
 		 569 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  31.64 
 
 		 536 aa  100  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.87 
 
 		 538 aa  100  7e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  22.75 
 
 		 435 aa  100  8e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  23.62 
 
 		 539 aa  100  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  28.74 
 
 		 522 aa  99.4  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  28.74 
 
 		 522 aa  99.8  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  28.63 
 
 		 520 aa  98.6  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  22.73 
 
 		 581 aa  97.8  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  27.7 
 
 		 546 aa  97.8  4e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  25.59 
 
 		 563 aa  97.4  5e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  26.34 
 
 		 545 aa  97.4  5e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  28.17 
 
 		 542 aa  97.1  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  28.35 
 
 		 522 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  29.62 
 
 		 544 aa  97.1  8e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  28.39 
 
 		 579 aa  96.7  9e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  28.35 
 
 		 522 aa  96.7  9e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  27.97 
 
 		 522 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  27.97 
 
 		 522 aa  95.9  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  25.3 
 
 		 584 aa  95.9  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.62 
 
 		 541 aa  95.5  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  25.82 
 
 		 562 aa  94.7  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  26.19 
 
 		 542 aa  94.4  4e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  27.77 
 
 		 537 aa  94.4  4e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  24.76 
 
 		 527 aa  94.4  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0603  amidohydrolase 3  26.52 
 
 		 434 aa  93.2  9e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.294083  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0589  amidohydrolase 3  26.52 
 
 		 434 aa  93.2  9e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.016128  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  27.22 
 
 		 547 aa  93.2  9e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  27.55 
 
 		 512 aa  92.8  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  28.34 
 
 		 543 aa  92  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  36.05 
 
 		 485 aa  92  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  27.09 
 
 		 542 aa  90.9  5e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>