268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0589 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0603  amidohydrolase 3  100 
 
 
434 aa  884    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.294083  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0589  amidohydrolase 3  100 
 
 
434 aa  884    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.016128  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  41.91 
 
 
435 aa  360  3e-98  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1596  amidohydrolase 3  42.14 
 
 
436 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0247  amidohydrolase 3  30.34 
 
 
429 aa  143  8e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0227591  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  25.24 
 
 
533 aa  125  2e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  25.32 
 
 
539 aa  121  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  24.76 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  24.76 
 
 
522 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  24.53 
 
 
522 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  24.57 
 
 
522 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  24.2 
 
 
522 aa  117  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  25.05 
 
 
522 aa  116  6e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  24.81 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  24.2 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  24.53 
 
 
522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  24.34 
 
 
522 aa  113  6e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  24.48 
 
 
550 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  23.74 
 
 
556 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  25.05 
 
 
579 aa  110  7.000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  26.13 
 
 
526 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  23.81 
 
 
553 aa  108  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  25.51 
 
 
568 aa  108  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  24.24 
 
 
619 aa  107  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  26 
 
 
452 aa  106  9e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  24.7 
 
 
542 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  23.9 
 
 
548 aa  105  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  25.55 
 
 
520 aa  105  2e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  24.22 
 
 
541 aa  105  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09430  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.52 
 
 
506 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392423  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  25.62 
 
 
484 aa  105  2e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  25.57 
 
 
544 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  30 
 
 
499 aa  102  1e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  25.79 
 
 
537 aa  100  5e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  23.47 
 
 
552 aa  100  5e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  26.01 
 
 
477 aa  100  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  24.15 
 
 
520 aa  99  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.85 
 
 
560 aa  98.6  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  27.96 
 
 
553 aa  98.6  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  25.2 
 
 
563 aa  98.2  2e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  22.5 
 
 
546 aa  98.2  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  27.57 
 
 
475 aa  97.4  4e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  26.09 
 
 
522 aa  97.4  4e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0992  hypothetical protein  22.97 
 
 
583 aa  96.7  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1053  hypothetical protein  22.36 
 
 
583 aa  96.3  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  24.8 
 
 
569 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  23.35 
 
 
574 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06500  conserved hypothetical protein  33.48 
 
 
513 aa  95.1  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3425  Amidohydrolase 3  26.92 
 
 
491 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0036735  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  22.82 
 
 
530 aa  95.5  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  23.92 
 
 
527 aa  95.1  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.1 
 
 
540 aa  94.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.25 
 
 
565 aa  94.4  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  24.33 
 
 
554 aa  93.2  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  25.54 
 
 
543 aa  92.4  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  24.09 
 
 
543 aa  92.8  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  26.24 
 
 
562 aa  91.7  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  25.43 
 
 
583 aa  92  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4693  amidohydrolase 3  25.1 
 
 
565 aa  91.7  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.141664 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06300  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.66 
 
 
504 aa  90.9  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  23.5 
 
 
505 aa  90.9  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  25.83 
 
 
541 aa  90.5  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  23.44 
 
 
556 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  24.48 
 
 
492 aa  89.4  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  27.37 
 
 
520 aa  89  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  24.04 
 
 
543 aa  89  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  24.64 
 
 
557 aa  87.8  3e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  22.4 
 
 
532 aa  87.8  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  23.32 
 
 
537 aa  87.4  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  24.58 
 
 
544 aa  87.8  4e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  25.54 
 
 
501 aa  87  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  23.86 
 
 
552 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  27.17 
 
 
508 aa  85.1  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  24.02 
 
 
520 aa  84.7  0.000000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  24.9 
 
 
539 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  22.85 
 
 
576 aa  84.3  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  23.66 
 
 
538 aa  83.6  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  23.83 
 
 
535 aa  83.6  0.000000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  24.03 
 
 
485 aa  83.6  0.000000000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  25.31 
 
 
565 aa  83.2  0.000000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  24.73 
 
 
518 aa  82.8  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  27.73 
 
 
505 aa  83.2  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  25.84 
 
 
540 aa  82.4  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  22.78 
 
 
569 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  23.31 
 
 
563 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  24.13 
 
 
556 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  24.48 
 
 
521 aa  80.9  0.00000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  21.38 
 
 
563 aa  80.9  0.00000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  28.02 
 
 
585 aa  80.1  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  25.88 
 
 
512 aa  79.7  0.00000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  24.47 
 
 
548 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  25.68 
 
 
498 aa  79  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  23.29 
 
 
543 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  20.91 
 
 
604 aa  79  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  22.71 
 
 
552 aa  79  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  27.06 
 
 
580 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  23.45 
 
 
544 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  27.06 
 
 
580 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  23.06 
 
 
620 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  29.81 
 
 
536 aa  77.8  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>