205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmob_0247 on replicon NC_010003
Organism: Petrotoga mobilis SJ95



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010003  Pmob_0247  amidohydrolase 3  100 
 
 
429 aa  875    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0227591  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  33.14 
 
 
435 aa  152  1e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  31.03 
 
 
522 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  31.03 
 
 
522 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  31.43 
 
 
522 aa  144  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  30.77 
 
 
522 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  30.61 
 
 
522 aa  144  3e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  30.5 
 
 
522 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  30.91 
 
 
522 aa  143  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  30.43 
 
 
522 aa  140  6e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  28.57 
 
 
537 aa  139  7e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  30.34 
 
 
522 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  29.18 
 
 
520 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  30.08 
 
 
522 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0589  amidohydrolase 3  30.34 
 
 
434 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.016128  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0603  amidohydrolase 3  30.34 
 
 
434 aa  136  7.000000000000001e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.294083  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  27.57 
 
 
539 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  28.68 
 
 
533 aa  120  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  28.06 
 
 
499 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1596  amidohydrolase 3  28.53 
 
 
436 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  27.48 
 
 
619 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  27.63 
 
 
553 aa  114  3e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  28.46 
 
 
526 aa  110  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  29.13 
 
 
546 aa  110  4.0000000000000004e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.49 
 
 
560 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  28.36 
 
 
543 aa  107  4e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  27.11 
 
 
548 aa  107  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.78 
 
 
565 aa  106  9e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  23.41 
 
 
541 aa  103  5e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.6 
 
 
540 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  27.75 
 
 
583 aa  102  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  26.72 
 
 
557 aa  101  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  27.47 
 
 
543 aa  101  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  23.99 
 
 
475 aa  100  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.47 
 
 
544 aa  100  6e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  27.97 
 
 
553 aa  99.8  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  27.68 
 
 
550 aa  99.4  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  24.94 
 
 
568 aa  98.2  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  23.86 
 
 
579 aa  98.2  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  24.81 
 
 
520 aa  97.8  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  26.3 
 
 
556 aa  97.4  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  25.53 
 
 
565 aa  97.8  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  24.93 
 
 
477 aa  96.7  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  24.01 
 
 
532 aa  94  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  23.08 
 
 
512 aa  92.4  1e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  25.71 
 
 
552 aa  91.7  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  28.57 
 
 
540 aa  91.3  3e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  27.2 
 
 
543 aa  91.7  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.07 
 
 
520 aa  91.3  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  32 
 
 
536 aa  90.1  7e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  25.69 
 
 
552 aa  89.4  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  25.53 
 
 
527 aa  88.2  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  24.27 
 
 
543 aa  88.6  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  24.29 
 
 
556 aa  86.7  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  24.27 
 
 
544 aa  86.7  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  22.52 
 
 
551 aa  85.9  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  26.45 
 
 
522 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.18 
 
 
527 aa  85.5  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  24.34 
 
 
553 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  20.5 
 
 
553 aa  84.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  32.5 
 
 
513 aa  84  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  24.21 
 
 
547 aa  84  0.000000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  26.33 
 
 
563 aa  84  0.000000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  22.28 
 
 
530 aa  83.6  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  25.27 
 
 
543 aa  83.2  0.000000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  22.72 
 
 
501 aa  82.4  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  24.44 
 
 
452 aa  82  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  23.65 
 
 
536 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  23.37 
 
 
556 aa  80.9  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  23.86 
 
 
512 aa  80.5  0.00000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  25.26 
 
 
539 aa  80.1  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  24.53 
 
 
505 aa  79.3  0.0000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  23.54 
 
 
549 aa  79  0.0000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  23.5 
 
 
548 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2017  amidohydrolase 3  23.64 
 
 
532 aa  78.2  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.636522  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  24.07 
 
 
551 aa  77  0.0000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  23.78 
 
 
522 aa  77  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  22.17 
 
 
548 aa  76.6  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  23.63 
 
 
485 aa  76.6  0.0000000000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  23.82 
 
 
604 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  22.84 
 
 
569 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  23.97 
 
 
522 aa  75.1  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  21.96 
 
 
541 aa  74.7  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  23 
 
 
540 aa  74.7  0.000000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  24.63 
 
 
546 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09430  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  21.71 
 
 
506 aa  73.2  0.000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392423  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  21.91 
 
 
585 aa  72.4  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  30.29 
 
 
532 aa  73.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  23.75 
 
 
563 aa  72.4  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  23.08 
 
 
498 aa  72.8  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  24.33 
 
 
548 aa  72.4  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_006681  CNL06500  conserved hypothetical protein  29.84 
 
 
513 aa  70.9  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  22.28 
 
 
574 aa  71.2  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06300  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  22.67 
 
 
504 aa  70.5  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  29.94 
 
 
525 aa  70.5  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  22.99 
 
 
581 aa  70.9  0.00000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  31.41 
 
 
508 aa  70.5  0.00000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  22.25 
 
 
518 aa  70.1  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  23.35 
 
 
556 aa  70.1  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  22.75 
 
 
601 aa  69.7  0.00000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>