270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_14070 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  100 
 
 		 522 aa  1030    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  42.28 
 
 		 521 aa  302  1e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  39.41 
 
 		 553 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  39.52 
 
 		 551 aa  283  4.0000000000000003e-75  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  42.61 
 
 		 498 aa  283  5.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  39.69 
 
 		 518 aa  280  4e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  37.82 
 
 		 558 aa  277  3e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  39.96 
 
 		 512 aa  272  1e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  39.06 
 
 		 539 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  39.21 
 
 		 552 aa  266  7e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  38.85 
 
 		 513 aa  263  6e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  35.45 
 
 		 548 aa  259  8e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  41.98 
 
 		 547 aa  259  1e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  37.53 
 
 		 563 aa  255  1.0000000000000001e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  39.64 
 
 		 559 aa  254  3e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  36.71 
 
 		 526 aa  246  9e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  38.01 
 
 		 530 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  38.01 
 
 		 530 aa  245  9.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  37.8 
 
 		 530 aa  244  3.9999999999999997e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  38.52 
 
 		 520 aa  236  6e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  36.67 
 
 		 546 aa  236  6e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  36.79 
 
 		 542 aa  231  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  37.86 
 
 		 534 aa  228  2e-58  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  35.02 
 
 		 541 aa  225  1e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  33.78 
 
 		 541 aa  212  1e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  36 
 
 		 526 aa  209  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  31.11 
 
 		 520 aa  207  4e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  33.86 
 
 		 540 aa  173  6.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  25.96 
 
 		 505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  33.03 
 
 		 568 aa  147  6e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  32.94 
 
 		 539 aa  146  1e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  31.26 
 
 		 540 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.9 
 
 		 565 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.39 
 
 		 583 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  25.9 
 
 		 552 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.83 
 
 		 560 aa  132  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  29.62 
 
 		 553 aa  131  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  26.05 
 
 		 533 aa  129  1.0000000000000001e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  30.36 
 
 		 544 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  25.37 
 
 		 520 aa  127  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  25.67 
 
 		 550 aa  128  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  27.29 
 
 		 548 aa  127  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  29.42 
 
 		 532 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  27.76 
 
 		 579 aa  124  4e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  28.94 
 
 		 562 aa  122  9.999999999999999e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  31.1 
 
 		 565 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  28.78 
 
 		 546 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  25.8 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.37 
 
 		 556 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  26.21 
 
 		 539 aa  120  4.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.32 
 
 		 522 aa  120  6e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  24.95 
 
 		 522 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  24.95 
 
 		 522 aa  120  7.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  24.95 
 
 		 522 aa  119  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  28.38 
 
 		 556 aa  119  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  27.98 
 
 		 553 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.44 
 
 		 530 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  25.38 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  23.75 
 
 		 522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  31.93 
 
 		 554 aa  117  5e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.76 
 
 		 543 aa  114  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  24.03 
 
 		 452 aa  115  3e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  24.58 
 
 		 522 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  27.23 
 
 		 557 aa  114  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  25.14 
 
 		 522 aa  113  7.000000000000001e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  31.14 
 
 		 536 aa  113  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  25.16 
 
 		 556 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  29.53 
 
 		 538 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  27.78 
 
 		 484 aa  109  1e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  26.61 
 
 		 556 aa  109  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  25.05 
 
 		 527 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  29.76 
 
 		 525 aa  108  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  30.17 
 
 		 541 aa  107  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  26.1 
 
 		 543 aa  106  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  28.28 
 
 		 499 aa  104  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  23.9 
 
 		 539 aa  103  6e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  31.14 
 
 		 536 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  29.58 
 
 		 508 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  28.89 
 
 		 485 aa  102  2e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  26.16 
 
 		 619 aa  100  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  26.27 
 
 		 552 aa  97.8  4e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  26.32 
 
 		 537 aa  96.3  1e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  27.06 
 
 		 543 aa  95.5  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  30.81 
 
 		 537 aa  94.7  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  26.24 
 
 		 560 aa  92.4  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  27.74 
 
 		 539 aa  92  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  26.83 
 
 		 537 aa  91.3  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  25.74 
 
 		 543 aa  91.3  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  29.09 
 
 		 532 aa  90.1  8e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  27.6 
 
 		 549 aa  89.7  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.76 
 
 		 544 aa  89  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  25.15 
 
 		 520 aa  87.8  4e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  23.9 
 
 		 557 aa  87.4  6e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  22.26 
 
 		 544 aa  86.7  9e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  25.14 
 
 		 569 aa  86.7  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  26.23 
 
 		 569 aa  86.7  9e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  26.3 
 
 		 522 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  21.66 
 
 		 435 aa  85.5  0.000000000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  25.95 
 
 		 543 aa  84.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>