262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_2198 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  100 
 
 
520 aa  1011    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  55.6 
 
 
541 aa  521  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  58.44 
 
 
530 aa  509  1e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  58.25 
 
 
530 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  58.25 
 
 
530 aa  505  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  55.53 
 
 
552 aa  501  1e-141  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  56.95 
 
 
526 aa  489  1e-137  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  54.73 
 
 
518 aa  482  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  53.11 
 
 
534 aa  452  1.0000000000000001e-126  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  57.36 
 
 
526 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  49.53 
 
 
553 aa  411  1e-113  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  48.98 
 
 
546 aa  389  1e-107  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  48.13 
 
 
548 aa  364  2e-99  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  45.45 
 
 
512 aa  355  1e-96  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  44.53 
 
 
521 aa  344  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  46 
 
 
542 aa  344  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  42.67 
 
 
558 aa  340  4e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  42.99 
 
 
551 aa  339  8e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  45.12 
 
 
498 aa  322  9.000000000000001e-87  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  43.98 
 
 
539 aa  322  9.999999999999999e-87  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  46.33 
 
 
547 aa  320  5e-86  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  40.75 
 
 
559 aa  298  2e-79  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  41.17 
 
 
563 aa  290  6e-77  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  45.49 
 
 
513 aa  281  2e-74  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  37.77 
 
 
541 aa  273  4.0000000000000004e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  37.99 
 
 
522 aa  243  7e-63  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  28.39 
 
 
520 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  24.85 
 
 
505 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  32.75 
 
 
540 aa  147  6e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  32.05 
 
 
539 aa  132  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  28.39 
 
 
583 aa  130  5.0000000000000004e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.41 
 
 
553 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  28.9 
 
 
535 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  28.68 
 
 
562 aa  120  7.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.85 
 
 
556 aa  116  8.999999999999998e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.13 
 
 
530 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  27.48 
 
 
541 aa  108  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  29.61 
 
 
543 aa  108  3e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  29 
 
 
532 aa  106  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  29.94 
 
 
551 aa  105  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  27.86 
 
 
537 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  24.21 
 
 
574 aa  103  8e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.22 
 
 
527 aa  103  1e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  25.53 
 
 
452 aa  103  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  29.96 
 
 
545 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  25 
 
 
533 aa  102  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  28.12 
 
 
568 aa  99.8  1e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  28.1 
 
 
542 aa  99.8  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  23.15 
 
 
539 aa  99.4  1e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  28.72 
 
 
541 aa  99  2e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  29.69 
 
 
540 aa  98.2  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  27.66 
 
 
555 aa  97.1  8e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  30.22 
 
 
525 aa  97.1  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11990  hypothetical protein  35.74 
 
 
361 aa  94.7  3e-18  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.340317  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.49 
 
 
560 aa  93.6  9e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  26.01 
 
 
556 aa  93.2  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  26.43 
 
 
580 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  21.54 
 
 
435 aa  92  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  28.76 
 
 
538 aa  92.4  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  29.02 
 
 
475 aa  91.3  3e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  27.36 
 
 
547 aa  91.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  21.99 
 
 
522 aa  91.7  3e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  26.92 
 
 
544 aa  91.7  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  27.12 
 
 
543 aa  90.5  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  25.6 
 
 
546 aa  90.1  9e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  23.09 
 
 
522 aa  89.7  1e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  21.43 
 
 
522 aa  89.4  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  26.68 
 
 
544 aa  88.6  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  24.35 
 
 
550 aa  89.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  21.19 
 
 
522 aa  89  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  28.23 
 
 
522 aa  87.8  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  28.81 
 
 
536 aa  87.8  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26 
 
 
565 aa  88.2  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  21.68 
 
 
520 aa  87.8  5e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  27.31 
 
 
537 aa  87.4  5e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  33.19 
 
 
547 aa  87.4  5e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15990  hypothetical protein  43.85 
 
 
266 aa  87.4  6e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.229387  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06500  conserved hypothetical protein  25.53 
 
 
513 aa  87.4  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  33.62 
 
 
547 aa  86.7  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  22.9 
 
 
522 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  22.9 
 
 
522 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  25.52 
 
 
604 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  24.95 
 
 
548 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  22.52 
 
 
522 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  21.62 
 
 
522 aa  84.7  0.000000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06300  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  29.45 
 
 
504 aa  84.3  0.000000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  32.54 
 
 
544 aa  84.3  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0603  amidohydrolase 3  24.02 
 
 
434 aa  84  0.000000000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.294083  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0589  amidohydrolase 3  24.02 
 
 
434 aa  84  0.000000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.016128  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  24.86 
 
 
575 aa  84  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  24.86 
 
 
575 aa  84  0.000000000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  24.39 
 
 
543 aa  83.6  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  23.99 
 
 
603 aa  83.6  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  28.06 
 
 
554 aa  83.6  0.000000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  21.8 
 
 
522 aa  82.8  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1596  amidohydrolase 3  22.2 
 
 
436 aa  82.8  0.00000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  27.64 
 
 
552 aa  83.2  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  25.51 
 
 
556 aa  82  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  26.72 
 
 
543 aa  82  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  21.24 
 
 
522 aa  81.6  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>