More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5320 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5320  Amidohydrolase 3  100 
 
 
553 aa  1082    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  52.12 
 
 
521 aa  490  1e-137  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  53.47 
 
 
518 aa  473  1e-132  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  50.46 
 
 
552 aa  461  9.999999999999999e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  52.49 
 
 
498 aa  447  1.0000000000000001e-124  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  50.83 
 
 
548 aa  442  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2484  Amidohydrolase 3  48.72 
 
 
541 aa  429  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  48.69 
 
 
512 aa  428  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2538  amidohydrolase 3  50.09 
 
 
530 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0749351  normal  0.795605 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2501  amidohydrolase 3  50.19 
 
 
530 aa  422  1e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.264254  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2546  amidohydrolase 3  50.19 
 
 
530 aa  422  1e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.799273  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1889  Amidohydrolase 3  51.3 
 
 
547 aa  408  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0946427  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2198  Amidohydrolase 3  49.53 
 
 
520 aa  401  9.999999999999999e-111  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  46.06 
 
 
558 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3420  amidohydrolase 3  48.22 
 
 
526 aa  398  1e-109  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0103675  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1929  Amidohydrolase 3  46.32 
 
 
551 aa  395  1e-109  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000140849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4173  amidohydrolase 3  45.52 
 
 
563 aa  398  1e-109  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.000539132  normal  0.473952 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  48.81 
 
 
542 aa  394  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  46.31 
 
 
539 aa  386  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3116  amidohydrolase 3  50.19 
 
 
526 aa  384  1e-105  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0541679  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  47.57 
 
 
534 aa  381  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2936  Amidohydrolase 3  47.83 
 
 
546 aa  378  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000940592  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  49.68 
 
 
513 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1776  Amidohydrolase 3  40.46 
 
 
559 aa  335  2e-90  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.312253  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  39.82 
 
 
541 aa  330  3e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  39.78 
 
 
522 aa  307  3e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  28.72 
 
 
520 aa  214  3.9999999999999995e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  33.15 
 
 
540 aa  187  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  25.86 
 
 
505 aa  182  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  33.52 
 
 
532 aa  179  2e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  30.75 
 
 
583 aa  177  5e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  33.08 
 
 
539 aa  169  9e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  31.72 
 
 
530 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  31.7 
 
 
579 aa  166  1.0000000000000001e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  30.29 
 
 
543 aa  165  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  33.54 
 
 
556 aa  165  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  29.48 
 
 
553 aa  158  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  26.26 
 
 
533 aa  148  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  33.7 
 
 
537 aa  147  7.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  31.38 
 
 
535 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  29.92 
 
 
542 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  28.71 
 
 
527 aa  143  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  31.07 
 
 
568 aa  140  7.999999999999999e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  28.62 
 
 
562 aa  137  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  26.1 
 
 
539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  32.18 
 
 
544 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  24.8 
 
 
522 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  31 
 
 
522 aa  132  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  34.51 
 
 
549 aa  131  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  25.24 
 
 
522 aa  131  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.74 
 
 
544 aa  130  7.000000000000001e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.81 
 
 
522 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  24.62 
 
 
520 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  25.4 
 
 
522 aa  130  7.000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  29.56 
 
 
537 aa  130  9.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0778  amidohydrolase 3  30.24 
 
 
499 aa  130  9.000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.674672  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.29 
 
 
522 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  25.49 
 
 
522 aa  128  3e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  32.81 
 
 
565 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  25 
 
 
522 aa  127  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  25.29 
 
 
522 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  25.29 
 
 
522 aa  126  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  27.72 
 
 
541 aa  125  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2425  Amidohydrolase 3  32.58 
 
 
545 aa  125  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0524757 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  29.09 
 
 
551 aa  125  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  25.45 
 
 
543 aa  125  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  29.52 
 
 
547 aa  125  3e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  26.46 
 
 
553 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  26.57 
 
 
569 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  26.24 
 
 
452 aa  124  5e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  25.87 
 
 
544 aa  123  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  28.08 
 
 
583 aa  122  9.999999999999999e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  25.25 
 
 
546 aa  123  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  24.6 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.69 
 
 
540 aa  122  1.9999999999999998e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.64 
 
 
556 aa  121  3e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  28.81 
 
 
542 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  29.82 
 
 
540 aa  120  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  25.36 
 
 
550 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  25.52 
 
 
548 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  28.09 
 
 
537 aa  118  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  28.15 
 
 
505 aa  118  3e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.3 
 
 
560 aa  117  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  26.52 
 
 
556 aa  117  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  26.11 
 
 
619 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  30.17 
 
 
554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  24.13 
 
 
552 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  26.68 
 
 
543 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  23.16 
 
 
574 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.84 
 
 
565 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  26.49 
 
 
539 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  25.62 
 
 
557 aa  111  4.0000000000000004e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  31.27 
 
 
536 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  28.89 
 
 
548 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  26.04 
 
 
555 aa  109  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  25.7 
 
 
541 aa  109  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  25.72 
 
 
543 aa  108  2e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  29.79 
 
 
543 aa  109  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  29.21 
 
 
501 aa  108  2e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  27.7 
 
 
484 aa  108  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>