More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2956 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2956  Amidohydrolase 3  100 
 
 
492 aa  927    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.757705  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3662  Amidohydrolase 3  64.71 
 
 
536 aa  483  1e-135  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.565379  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3750  Amidohydrolase 3  50.89 
 
 
505 aa  399  9.999999999999999e-111  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1394  putative metal-dependent hydrolase  46.52 
 
 
484 aa  359  5e-98  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3425  Amidohydrolase 3  50.2 
 
 
491 aa  346  7e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0036735  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09430  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  46.27 
 
 
506 aa  342  1e-92  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392423  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3965  amidohydrolase 3  49.68 
 
 
509 aa  334  2e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4491  amidohydrolase 3  46.02 
 
 
508 aa  323  5e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0710602  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06300  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  45.64 
 
 
504 aa  313  3.9999999999999997e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL06500  conserved hypothetical protein  35.14 
 
 
513 aa  278  1e-73  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  35.18 
 
 
532 aa  199  7.999999999999999e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  30.97 
 
 
527 aa  197  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  35.05 
 
 
556 aa  197  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  33.88 
 
 
522 aa  195  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  34.16 
 
 
530 aa  191  2e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  30.84 
 
 
543 aa  187  4e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  31.47 
 
 
556 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  32.66 
 
 
568 aa  167  4e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  29.19 
 
 
550 aa  167  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  25.37 
 
 
533 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1988  amidohydrolase 3  32.7 
 
 
535 aa  161  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.118371  normal  0.562077 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  29.49 
 
 
546 aa  157  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  32.59 
 
 
553 aa  156  8e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  31.17 
 
 
556 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  34.5 
 
 
553 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  27.99 
 
 
548 aa  152  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  32.77 
 
 
540 aa  149  9e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  28.49 
 
 
619 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2198  amidohydrolase 3  33.79 
 
 
501 aa  146  7.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.309934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  28.57 
 
 
553 aa  144  3e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  33.02 
 
 
542 aa  144  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  33.2 
 
 
539 aa  143  6e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  25.64 
 
 
539 aa  143  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6024  putative amidohydrolase  30.9 
 
 
537 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148196  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  26.81 
 
 
583 aa  140  4.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.07 
 
 
560 aa  139  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06920  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.71 
 
 
542 aa  137  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.256585 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  31.6 
 
 
579 aa  137  5e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1652  Amidohydrolase 3  31.7 
 
 
477 aa  137  6.0000000000000005e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.1922  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.73 
 
 
565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1537  Amidohydrolase 3  24.8 
 
 
452 aa  133  6e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.232374  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09320  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  28.43 
 
 
544 aa  133  9e-30  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.112209  normal  0.40819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  26.65 
 
 
557 aa  132  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0463  amidohydrolase 3  28.02 
 
 
552 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2264  amidohydrolase 3  32.29 
 
 
498 aa  131  3e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000406056  normal  0.180306 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  27.29 
 
 
537 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18490  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  33.19 
 
 
539 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0105695  normal  0.337181 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  30.04 
 
 
554 aa  127  3e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  29.81 
 
 
551 aa  127  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1746  Amidohydrolase 3  29.57 
 
 
552 aa  127  6e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.717309  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  32.03 
 
 
565 aa  126  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.660482 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  26.78 
 
 
541 aa  124  3e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  31.69 
 
 
544 aa  124  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2050  Amidohydrolase 3  32.88 
 
 
536 aa  124  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  29.32 
 
 
547 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  25.89 
 
 
543 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  28.24 
 
 
569 aa  123  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  32.38 
 
 
521 aa  123  8e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3223  amidohydrolase 3  30.17 
 
 
538 aa  123  8e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10795  conserved hypothetical protein  26.09 
 
 
549 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  26.94 
 
 
541 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.64 
 
 
540 aa  121  3e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  22.01 
 
 
574 aa  121  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  29.46 
 
 
542 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2467  Amidohydrolase 3  29.68 
 
 
475 aa  118  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2120  Amidohydrolase 3  32.88 
 
 
536 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0885752  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12089  hypothetical protein  33.67 
 
 
534 aa  118  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.300172  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0751  amidohydrolase 3  26.69 
 
 
575 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.696305 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.54 
 
 
522 aa  117  5e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF04180  conserved hypothetical protein  26.54 
 
 
589 aa  117  6e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2928  Amidohydrolase 3  27.95 
 
 
562 aa  117  6.9999999999999995e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.548866  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  29.38 
 
 
569 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  28.22 
 
 
520 aa  116  1.0000000000000001e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1932  amidohydrolase 3  26.83 
 
 
522 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  26.65 
 
 
527 aa  114  4.0000000000000004e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.65 
 
 
522 aa  114  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  24.76 
 
 
563 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  25.19 
 
 
522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  25.34 
 
 
522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1810  amidohydrolase 3  34.31 
 
 
532 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.295245  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  24.95 
 
 
522 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  24.95 
 
 
522 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  28.25 
 
 
542 aa  111  4.0000000000000004e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  25.52 
 
 
583 aa  110  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  28.01 
 
 
620 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  30.65 
 
 
518 aa  109  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  28.44 
 
 
538 aa  109  1e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  24.26 
 
 
520 aa  108  2e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  23.87 
 
 
522 aa  107  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  28.78 
 
 
601 aa  107  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_2257  predicted protein  28.02 
 
 
485 aa  107  7e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00414592 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  23.6 
 
 
520 aa  106  9e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  26.25 
 
 
616 aa  106  9e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  26.32 
 
 
581 aa  106  1e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2273  amidohydrolase 3  33.33 
 
 
548 aa  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000251209  hitchhiker  0.000881388 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  24.02 
 
 
581 aa  105  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2070  amidohydrolase 3  25.65 
 
 
560 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  23.44 
 
 
544 aa  106  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  24.54 
 
 
522 aa  105  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  25.91 
 
 
552 aa  106  1e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.747715 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>