More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_1274 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  62.46 
 
 		 603 aa  761    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  62.44 
 
 		 660 aa  843    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  64.72 
 
 		 612 aa  816    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  58.12 
 
 		 611 aa  748    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  67.37 
 
 		 660 aa  930    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  60.18 
 
 		 626 aa  685    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  62.59 
 
 		 660 aa  842    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  57.79 
 
 		 611 aa  741    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  62.9 
 
 		 660 aa  845    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  58.12 
 
 		 613 aa  748    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  64.83 
 
 		 656 aa  861    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  71.66 
 
 		 630 aa  928    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  62.97 
 
 		 660 aa  838    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  78.39 
 
 		 622 aa  1031    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  69.92 
 
 		 626 aa  914    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  69.71 
 
 		 632 aa  907    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  64.89 
 
 		 612 aa  828    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  70.21 
 
 		 629 aa  892    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  100 
 
 		 658 aa  1354    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  69.75 
 
 		 629 aa  909    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  63.04 
 
 		 656 aa  807    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  61.55 
 
 		 655 aa  788    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  69.87 
 
 		 625 aa  912    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  65.39 
 
 		 634 aa  863    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  62.72 
 
 		 626 aa  798    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  69.55 
 
 		 630 aa  905    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  65.14 
 
 		 659 aa  848    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  57.95 
 
 		 611 aa  746    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  53.65 
 
 		 591 aa  639    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  77.29 
 
 		 621 aa  1023    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  59.78 
 
 		 631 aa  802    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  70.03 
 
 		 625 aa  904    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  70 
 
 		 629 aa  888    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  70 
 
 		 629 aa  890    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  70.73 
 
 		 629 aa  900    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  63.01 
 
 		 660 aa  839    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  71.82 
 
 		 630 aa  929    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  67.41 
 
 		 632 aa  877    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  71.34 
 
 		 630 aa  914    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  71.5 
 
 		 630 aa  907    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  60.38 
 
 		 643 aa  687    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  66.02 
 
 		 612 aa  845    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  62.99 
 
 		 602 aa  783    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  70.16 
 
 		 629 aa  891    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  70 
 
 		 629 aa  890    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  77.89 
 
 		 619 aa  1003    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  69.18 
 
 		 625 aa  912    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  70.16 
 
 		 629 aa  907    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  69.71 
 
 		 632 aa  907    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  69.84 
 
 		 629 aa  887    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  63.17 
 
 		 626 aa  784    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  67.62 
 
 		 630 aa  891    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  66.5 
 
 		 626 aa  862    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  58.12 
 
 		 611 aa  744    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  62.1 
 
 		 626 aa  795    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  69.6 
 
 		 632 aa  906    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  52.64 
 
 		 595 aa  631  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2946  metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold, C-terminus  58.79 
 
 		 487 aa  612  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  51.92 
 
 		 593 aa  589  1e-167  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7017  amidohydrolase 3  53.21 
 
 		 629 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0592148 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1477  amidohydrolase 3  52.17 
 
 		 661 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272178  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6351  amidohydrolase 3  52.17 
 
 		 661 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  46.4 
 
 		 618 aa  558  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6793  Amidohydrolase 3  47.3 
 
 		 546 aa  483  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0124  Amidohydrolase 3  38.03 
 
 		 557 aa  336  5.999999999999999e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1702  putative amidohydrolase family  33.64 
 
 		 566 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0262541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1581  putative amidohydrolase family  33.46 
 
 		 566 aa  263  4.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1571  putative amidohydrolase family  33.27 
 
 		 566 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0884579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1640  putative amidohydrolase family  33.46 
 
 		 566 aa  262  2e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  0.936326 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1871  putative amidohydrolase family protein  33.09 
 
 		 566 aa  260  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0576549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.5 
 
 		 549 aa  214  2.9999999999999995e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  30.36 
 
 		 546 aa  213  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  31.65 
 
 		 545 aa  207  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  28.6 
 
 		 539 aa  197  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.19 
 
 		 557 aa  196  1e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  29.82 
 
 		 556 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  26.98 
 
 		 564 aa  174  3.9999999999999995e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  29.8 
 
 		 543 aa  163  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  28.11 
 
 		 601 aa  161  3e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.28 
 
 		 553 aa  160  6e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  27.9 
 
 		 584 aa  160  6e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  27.24 
 
 		 583 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  26.2 
 
 		 583 aa  157  8e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  28.37 
 
 		 538 aa  155  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  26.01 
 
 		 532 aa  154  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  27.84 
 
 		 579 aa  153  8e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  26.33 
 
 		 543 aa  153  8.999999999999999e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  24.82 
 
 		 520 aa  152  1e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  27.64 
 
 		 541 aa  147  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  26.91 
 
 		 549 aa  147  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  26.81 
 
 		 574 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  27.07 
 
 		 530 aa  147  9e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  30 
 
 		 539 aa  146  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  26.63 
 
 		 564 aa  146  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  28.52 
 
 		 548 aa  145  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0715  amidohydrolase 3  26.08 
 
 		 564 aa  145  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.993176  decreased coverage  0.000630389 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.62 
 
 		 575 aa  143  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  25.69 
 
 		 569 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  26.36 
 
 		 575 aa  142  1.9999999999999998e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  26.19 
 
 		 560 aa  141  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>