More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2388 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  60.03 
 
 		 629 aa  754    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  63.89 
 
 		 603 aa  790    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  66.19 
 
 		 660 aa  854    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  65.85 
 
 		 612 aa  822    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  59.9 
 
 		 611 aa  770    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  60.7 
 
 		 656 aa  746    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  60.8 
 
 		 629 aa  758    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  67.41 
 
 		 626 aa  853    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  60.23 
 
 		 660 aa  781    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  66.83 
 
 		 660 aa  860    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  59.74 
 
 		 613 aa  769    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  95.05 
 
 		 626 aa  1227    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  61.97 
 
 		 622 aa  813    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  59.42 
 
 		 632 aa  746    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  61.07 
 
 		 632 aa  771    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  59.21 
 
 		 630 aa  754    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  66.5 
 
 		 612 aa  837    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  62.56 
 
 		 658 aa  798    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  59.07 
 
 		 629 aa  749    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  61.16 
 
 		 625 aa  787    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  59.03 
 
 		 625 aa  750    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  59.58 
 
 		 625 aa  755    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  66.67 
 
 		 660 aa  855    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  65.81 
 
 		 656 aa  837    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  63.61 
 
 		 634 aa  826    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  100 
 
 		 626 aa  1297    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  59.35 
 
 		 630 aa  755    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  59.52 
 
 		 611 aa  768    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  62.32 
 
 		 631 aa  832    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  61.87 
 
 		 621 aa  808    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  65.48 
 
 		 659 aa  830    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  66.67 
 
 		 660 aa  858    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  60.94 
 
 		 632 aa  771    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  60.83 
 
 		 629 aa  757    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1477  amidohydrolase 3  60.42 
 
 		 661 aa  709    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272178  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  60.29 
 
 		 629 aa  755    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  61.07 
 
 		 632 aa  771    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  59.11 
 
 		 629 aa  768    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  59.9 
 
 		 611 aa  769    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  59.21 
 
 		 630 aa  754    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  59.81 
 
 		 626 aa  759    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  59.27 
 
 		 630 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  59.24 
 
 		 630 aa  744    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  67.57 
 
 		 643 aa  862    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  65.85 
 
 		 612 aa  829    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  81.49 
 
 		 626 aa  1049    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  60.83 
 
 		 629 aa  759    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  60.29 
 
 		 629 aa  755    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6351  amidohydrolase 3  60.42 
 
 		 661 aa  709    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056207  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  64.98 
 
 		 602 aa  813    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  60.19 
 
 		 629 aa  757    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  61.14 
 
 		 619 aa  790    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  65.85 
 
 		 660 aa  835    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  59.42 
 
 		 611 aa  765    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7017  amidohydrolase 3  63.07 
 
 		 629 aa  713    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0592148 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  58.7 
 
 		 630 aa  753    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  64.1 
 
 		 626 aa  827    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  60.73 
 
 		 655 aa  789    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  52.38 
 
 		 591 aa  630  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  53.51 
 
 		 593 aa  627  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2946  metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold, C-terminus  61.13 
 
 		 487 aa  623  1e-177  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  51.75 
 
 		 595 aa  619  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  46.26 
 
 		 618 aa  556  1e-157  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6793  Amidohydrolase 3  49.54 
 
 		 546 aa  505  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0124  Amidohydrolase 3  39.93 
 
 		 557 aa  360  4e-98  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1702  putative amidohydrolase family  34.63 
 
 		 566 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0262541  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1571  putative amidohydrolase family  34.44 
 
 		 566 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0884579 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1581  putative amidohydrolase family  34.44 
 
 		 566 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737211 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1640  putative amidohydrolase family  34.44 
 
 		 566 aa  290  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  0.936326 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1871  putative amidohydrolase family protein  34.26 
 
 		 566 aa  286  5e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0576549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  28.77 
 
 		 557 aa  222  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  30.25 
 
 		 545 aa  214  4.9999999999999996e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  30.2 
 
 		 546 aa  212  2e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  29.1 
 
 		 549 aa  209  2e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  30.87 
 
 		 556 aa  206  8e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  27.5 
 
 		 539 aa  205  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  29.2 
 
 		 543 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  26.19 
 
 		 522 aa  177  7e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  31.43 
 
 		 541 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  26.51 
 
 		 522 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  25.87 
 
 		 522 aa  173  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  25.87 
 
 		 522 aa  173  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  25.63 
 
 		 564 aa  170  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  26.33 
 
 		 522 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  25.68 
 
 		 522 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  25.68 
 
 		 522 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.66 
 
 		 548 aa  169  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  25.68 
 
 		 522 aa  168  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  29.17 
 
 		 537 aa  167  4e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  25.87 
 
 		 522 aa  167  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  28.19 
 
 		 549 aa  167  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.46 
 
 		 522 aa  167  8e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  23.9 
 
 		 520 aa  167  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  27.5 
 
 		 583 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  27.69 
 
 		 556 aa  164  6e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  27.22 
 
 		 532 aa  164  7e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  27.87 
 
 		 543 aa  162  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  28.44 
 
 		 579 aa  160  7e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  27.89 
 
 		 556 aa  160  8e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  27.18 
 
 		 550 aa  160  9e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>