More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0124 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0124  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 557 aa  1120    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194416  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  39.51 
 
 		 656 aa  376  1e-103  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  39.93 
 
 		 626 aa  373  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  40.04 
 
 		 626 aa  374  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  41.51 
 
 		 612 aa  371  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  39.85 
 
 		 612 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  39.89 
 
 		 626 aa  372  1e-101  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  39.34 
 
 		 660 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  39.34 
 
 		 660 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  38.79 
 
 		 660 aa  366  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  38.97 
 
 		 660 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  39.89 
 
 		 656 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  40.11 
 
 		 622 aa  365  2e-99  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  40.22 
 
 		 643 aa  363  6e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  40.33 
 
 		 626 aa  362  1e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  38.96 
 
 		 660 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  38.56 
 
 		 612 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  36.11 
 
 		 631 aa  355  1e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  38.48 
 
 		 634 aa  354  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  38.03 
 
 		 658 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  38.92 
 
 		 603 aa  353  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  38.73 
 
 		 621 aa  353  4e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  38.38 
 
 		 659 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  38.97 
 
 		 632 aa  352  7e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  38.97 
 
 		 632 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  39.48 
 
 		 602 aa  352  1e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  38.97 
 
 		 632 aa  352  1e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  38.4 
 
 		 655 aa  351  2e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  38.05 
 
 		 611 aa  350  3e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  37.55 
 
 		 630 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  37.68 
 
 		 611 aa  348  2e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  37.36 
 
 		 630 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  37.55 
 
 		 630 aa  348  2e-94  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  38.4 
 
 		 619 aa  348  2e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  37.36 
 
 		 630 aa  347  2e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  38.08 
 
 		 630 aa  347  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  37.68 
 
 		 613 aa  347  3e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  37.32 
 
 		 611 aa  346  7e-94  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  37.18 
 
 		 629 aa  346  7e-94  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  37.32 
 
 		 611 aa  346  8e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  37.04 
 
 		 629 aa  345  8.999999999999999e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  36.49 
 
 		 660 aa  344  2e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  37.23 
 
 		 629 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  37.23 
 
 		 629 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  37.8 
 
 		 625 aa  343  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  37.31 
 
 		 629 aa  342  1e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  36.48 
 
 		 626 aa  341  2e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  37.23 
 
 		 629 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  37.8 
 
 		 625 aa  340  4e-92  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  37.23 
 
 		 629 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  37.23 
 
 		 629 aa  340  5.9999999999999996e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  37.38 
 
 		 626 aa  339  7e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  36.53 
 
 		 593 aa  338  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  36.78 
 
 		 591 aa  339  9.999999999999999e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  36.8 
 
 		 625 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  38.45 
 
 		 629 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  36.6 
 
 		 630 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  37.13 
 
 		 632 aa  330  4e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7017  amidohydrolase 3  39.44 
 
 		 629 aa  326  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0592148 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6351  amidohydrolase 3  39.44 
 
 		 661 aa  323  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1477  amidohydrolase 3  39.44 
 
 		 661 aa  322  9.000000000000001e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272178  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  34.7 
 
 		 595 aa  318  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  33.73 
 
 		 618 aa  317  5e-85  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6793  Amidohydrolase 3  39.52 
 
 		 546 aa  313  3.9999999999999997e-84  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1581  putative amidohydrolase family  35.82 
 
 		 566 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737211 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1571  putative amidohydrolase family  35.82 
 
 		 566 aa  310  4e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0884579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1640  putative amidohydrolase family  35.82 
 
 		 566 aa  310  5e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  0.936326 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1702  putative amidohydrolase family  35.63 
 
 		 566 aa  309  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0262541  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1871  putative amidohydrolase family protein  35.63 
 
 		 566 aa  309  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0576549  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2946  metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold, C-terminus  37.2 
 
 		 487 aa  257  4e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  31.79 
 
 		 545 aa  213  7.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  29.66 
 
 		 557 aa  208  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  29.43 
 
 		 546 aa  194  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  29.76 
 
 		 549 aa  193  8e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  24.95 
 
 		 539 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  29.56 
 
 		 541 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  29.18 
 
 		 538 aa  157  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  23.86 
 
 		 520 aa  156  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  28.06 
 
 		 584 aa  154  5.9999999999999996e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  29.91 
 
 		 601 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  29.5 
 
 		 553 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  26.99 
 
 		 527 aa  148  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  26.94 
 
 		 564 aa  145  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  26.56 
 
 		 526 aa  145  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3346  amidohydrolase family  26.63 
 
 		 568 aa  144  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  27.7 
 
 		 564 aa  144  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  27.99 
 
 		 532 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  29.13 
 
 		 535 aa  141  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  30.31 
 
 		 542 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  27.72 
 
 		 583 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.03 
 
 		 543 aa  138  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.64 
 
 		 527 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  28.75 
 
 		 569 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  28.47 
 
 		 569 aa  137  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  30.18 
 
 		 574 aa  137  7.000000000000001e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  28.93 
 
 		 537 aa  136  8e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  25.31 
 
 		 574 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  27.08 
 
 		 543 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  28.65 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  28.06 
 
 		 536 aa  132  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>