292 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6351 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  57.39 
 
 		 602 aa  657    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  58.93 
 
 		 603 aa  635    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7017  amidohydrolase 3  97.14 
 
 		 629 aa  1132    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0592148 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  56.37 
 
 		 660 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  60.42 
 
 		 626 aa  741    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  70.59 
 
 		 626 aa  829    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1477  amidohydrolase 3  99.85 
 
 		 661 aa  1303    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272178  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  63.62 
 
 		 626 aa  767    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  70.65 
 
 		 643 aa  844    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  53.71 
 
 		 612 aa  640    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6351  amidohydrolase 3  100 
 
 		 661 aa  1306    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  60.74 
 
 		 626 aa  739    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  53.86 
 
 		 659 aa  635  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  55.56 
 
 		 660 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  57.94 
 
 		 660 aa  634  1e-180  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  56.08 
 
 		 656 aa  635  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  55.22 
 
 		 612 aa  631  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  55.3 
 
 		 660 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  53.42 
 
 		 631 aa  631  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  54.94 
 
 		 660 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  51.8 
 
 		 611 aa  623  1e-177  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  52.35 
 
 		 613 aa  624  1e-177  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  52.1 
 
 		 612 aa  620  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  52.75 
 
 		 611 aa  619  1e-176  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  52.17 
 
 		 611 aa  621  1e-176  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  51.46 
 
 		 611 aa  618  1e-175  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  53.51 
 
 		 658 aa  609  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  52.69 
 
 		 619 aa  605  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  53.38 
 
 		 634 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  50.4 
 
 		 622 aa  601  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  48.71 
 
 		 621 aa  598  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  55.94 
 
 		 656 aa  594  1e-168  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  52.99 
 
 		 626 aa  591  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  53.48 
 
 		 655 aa  590  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  52.48 
 
 		 625 aa  580  1e-164  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  52.52 
 
 		 625 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  51.53 
 
 		 625 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  52.94 
 
 		 630 aa  573  1.0000000000000001e-162  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  51.61 
 
 		 626 aa  572  1e-161  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  49.49 
 
 		 660 aa  566  1e-160  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  51.95 
 
 		 632 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  51.95 
 
 		 632 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  52.01 
 
 		 632 aa  566  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  49.21 
 
 		 629 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  51.07 
 
 		 629 aa  560  1e-158  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  50.6 
 
 		 629 aa  559  1e-158  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  49.44 
 
 		 630 aa  555  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  49.44 
 
 		 630 aa  556  1e-157  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  50.89 
 
 		 629 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  51.42 
 
 		 629 aa  555  1e-156  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  48.39 
 
 		 629 aa  555  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  50.89 
 
 		 629 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  51.72 
 
 		 630 aa  553  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  51.43 
 
 		 630 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  48.39 
 
 		 629 aa  554  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  50.89 
 
 		 629 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  50.5 
 
 		 632 aa  546  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  48.67 
 
 		 593 aa  545  1e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  48.24 
 
 		 630 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  43.55 
 
 		 591 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  43.94 
 
 		 595 aa  516  1.0000000000000001e-145  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  43.53 
 
 		 618 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2946  metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold, C-terminus  52.98 
 
 		 487 aa  493  9.999999999999999e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1515  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6793  Amidohydrolase 3  48.6 
 
 		 546 aa  451  1e-125  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.548795 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0124  Amidohydrolase 3  39.44 
 
 		 557 aa  322  9.999999999999999e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194416  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1702  putative amidohydrolase family  34.69 
 
 		 566 aa  263  8.999999999999999e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0262541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1581  putative amidohydrolase family  34.5 
 
 		 566 aa  262  1e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737211 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1640  putative amidohydrolase family  34.5 
 
 		 566 aa  260  6e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  0.936326 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1571  putative amidohydrolase family  34.32 
 
 		 566 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0884579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1871  putative amidohydrolase family protein  34.32 
 
 		 566 aa  258  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0576549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  31.41 
 
 		 546 aa  183  9.000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  26.94 
 
 		 557 aa  179  1e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  30.16 
 
 		 545 aa  177  5e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.81 
 
 		 549 aa  174  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  24.73 
 
 		 539 aa  167  6.9999999999999995e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  29.28 
 
 		 532 aa  160  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  29.27 
 
 		 530 aa  159  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.24 
 
 		 556 aa  157  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4281  Amidohydrolase 3  30.22 
 
 		 601 aa  151  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.240414  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  25.5 
 
 		 520 aa  147  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  27.6 
 
 		 556 aa  147  5e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  25.41 
 
 		 522 aa  146  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  27.81 
 
 		 543 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  28.25 
 
 		 564 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  25.6 
 
 		 522 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  25.6 
 
 		 522 aa  145  3e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  24.86 
 
 		 522 aa  144  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  25.6 
 
 		 522 aa  143  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  25.05 
 
 		 522 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  25.18 
 
 		 522 aa  140  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  27.99 
 
 		 560 aa  140  7.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  25.33 
 
 		 522 aa  139  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  27.36 
 
 		 583 aa  139  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  24.49 
 
 		 522 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  28.65 
 
 		 553 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  24.45 
 
 		 520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  27.64 
 
 		 543 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  27.14 
 
 		 527 aa  134  5e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3242  amidohydrolase 3  26.83 
 
 		 573 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.077662  normal  0.0113117 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  29.41 
 
 		 548 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>