285 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4333 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007974  Rmet_4333  putative metallo-dependent hydrolase  100 
 
 		 557 aa  1135    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.189362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  33.62 
 
 		 545 aa  187  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  32.27 
 
 		 546 aa  184  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  31.38 
 
 		 549 aa  179  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0239  hypothetical protein  31.12 
 
 		 612 aa  171  2e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  29.88 
 
 		 612 aa  168  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2582  Amidohydrolase 3  30.68 
 
 		 566 aa  166  6.9999999999999995e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.405161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  28.9 
 
 		 612 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  28.77 
 
 		 659 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2383  amidohydrolase 3  28.52 
 
 		 655 aa  160  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.426658  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  29.46 
 
 		 656 aa  159  9e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2664  amidohydrolase 3  29 
 
 		 660 aa  159  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0520  Amidohydrolase 3  29.44 
 
 		 602 aa  156  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.47909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  28 
 
 		 660 aa  154  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5252  amidohydrolase 3  28.27 
 
 		 660 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6132  Amidohydrolase 3  28.3 
 
 		 626 aa  153  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5162  amidohydrolase 3  28 
 
 		 660 aa  152  1e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.264552  normal  0.0989014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5305  amidohydrolase 3  27.83 
 
 		 660 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.683105 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5608  amidohydrolase 3  29.42 
 
 		 626 aa  152  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0446868  normal  0.586515 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2388  hypothetical protein  28.12 
 
 		 626 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5825  amidohydrolase 3  29.42 
 
 		 643 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0321  Amidohydrolase 3  27.23 
 
 		 631 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1344  hypothetical protein  27.83 
 
 		 603 aa  144  4e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  25.04 
 
 		 556 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3972  amidohydrolase 3  27.29 
 
 		 625 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5721  amidohydrolase 3  27.87 
 
 		 626 aa  141  3e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.932631  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3177  amidohydrolase family protein  26.63 
 
 		 611 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  24.2 
 
 		 539 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2919  metal-dependent hydrolase  26.63 
 
 		 613 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  27.05 
 
 		 593 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1668  Amidohydrolase 3  27.19 
 
 		 660 aa  139  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.6106  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3163  hypothetical protein  26.76 
 
 		 611 aa  137  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0639606  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3154  amidohydrolase family protein  26.46 
 
 		 611 aa  137  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5313  hypothetical protein  27.72 
 
 		 621 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.052467  normal  0.69768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  29.06 
 
 		 564 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0066  amidohydrolase 3  25.39 
 
 		 618 aa  134  3.9999999999999996e-30  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4849  hypothetical protein  27.66 
 
 		 622 aa  134  6e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294585  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2086  amidohydrolase family protein  26.28 
 
 		 611 aa  134  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1274  amidohydrolase 3  26.7 
 
 		 658 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  24.91 
 
 		 557 aa  132  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  27.16 
 
 		 564 aa  132  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1273  amidohydrolase 3  27.48 
 
 		 630 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5808  amidohydrolase 3  27.4 
 
 		 630 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.800296 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5592  amidohydrolase 3  27.4 
 
 		 630 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3507  amidohydrolase 3  27.35 
 
 		 619 aa  132  2.0000000000000002e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.379983 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2334  Amidohydrolase 3  25.58 
 
 		 656 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1307  amidohydrolase 3  27.4 
 
 		 630 aa  130  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.318524 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7017  amidohydrolase 3  28.9 
 
 		 629 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0592148 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1374  amidohydrolase 3  26.92 
 
 		 629 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12393  normal  0.0753754 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  26.52 
 
 		 629 aa  129  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0598  amidohydrolase family protein  27.3 
 
 		 632 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3865  Amidohydrolase 3  28.8 
 
 		 535 aa  127  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1987  RC145  27.3 
 
 		 632 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.361708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  25.83 
 
 		 625 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0689  metal-dependent hydrolase  27.3 
 
 		 632 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.342967  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2392  Amidohydrolase 3  26.89 
 
 		 626 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333971  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1336  amidohydrolase 3  26.99 
 
 		 626 aa  127  7e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.370528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  29.69 
 
 		 553 aa  126  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  25.95 
 
 		 583 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6351  amidohydrolase 3  28.72 
 
 		 661 aa  126  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.056207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4539  metal-dependent hydrolase  26.34 
 
 		 629 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.294261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  27.43 
 
 		 556 aa  124  6e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  30.09 
 
 		 522 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1477  amidohydrolase 3  28.55 
 
 		 661 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.272178  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7010  amidohydrolase 3  26.75 
 
 		 629 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0816572 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  26.61 
 
 		 532 aa  123  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0914  amidohydrolase 3  26.92 
 
 		 629 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.523901  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  24.87 
 
 		 539 aa  122  1.9999999999999998e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1396  amidohydrolase 3  26.92 
 
 		 629 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1485  amidohydrolase 3  26.75 
 
 		 629 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6344  amidohydrolase 3  26.75 
 
 		 629 aa  121  3e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.438218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3389  Amidohydrolase 3  25.17 
 
 		 591 aa  120  4.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.436297  normal  0.809006 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  25.83 
 
 		 625 aa  120  7e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  27.89 
 
 		 548 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  27.1 
 
 		 543 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1556  amidohydrolase 3  25.35 
 
 		 632 aa  119  9.999999999999999e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1581  putative amidohydrolase family  27.37 
 
 		 566 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.737211 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1702  putative amidohydrolase family  27 
 
 		 566 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0262541  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  26.19 
 
 		 527 aa  117  5e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1640  putative amidohydrolase family  27.37 
 
 		 566 aa  117  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.376431  normal  0.936326 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4274  amidohydrolase 3  24.31 
 
 		 595 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.209865  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  26.9 
 
 		 549 aa  117  6e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  27.94 
 
 		 537 aa  116  7.999999999999999e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0124  Amidohydrolase 3  27.05 
 
 		 557 aa  117  7.999999999999999e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.194416  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  28.67 
 
 		 539 aa  115  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1571  putative amidohydrolase family  27.19 
 
 		 566 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0884579 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1871  putative amidohydrolase family protein  27.19 
 
 		 566 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0576549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  26.1 
 
 		 601 aa  114  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0184  hypothetical protein  26.32 
 
 		 630 aa  114  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.372497  normal  0.380648 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.69 
 
 		 540 aa  113  1.0000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3142  Amidohydrolase 3  27.13 
 
 		 629 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0760  amidohydrolase 3  27.21 
 
 		 630 aa  111  3e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.478777 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.03 
 
 		 538 aa  110  5e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  25.44 
 
 		 530 aa  110  5e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4811  amidohydrolase 3  25.48 
 
 		 634 aa  110  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  27.3 
 
 		 530 aa  110  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  27.09 
 
 		 537 aa  108  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  25.4 
 
 		 604 aa  109  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  23.48 
 
 		 587 aa  107  4e-22  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  24.29 
 
 		 527 aa  105  3e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>