More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0578 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0578  amidohydrolase 3  100 
 
 		 545 aa  1128    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0760  amidohydrolase 3  35.69 
 
 		 592 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  33.21 
 
 		 581 aa  272  9e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  33.75 
 
 		 625 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2185  Amidohydrolase 3  32.6 
 
 		 563 aa  263  6e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  30.92 
 
 		 581 aa  253  5.000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  30.95 
 
 		 585 aa  251  2e-65  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3462  amidohydrolase 3  31.51 
 
 		 650 aa  239  8e-62  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  31.03 
 
 		 604 aa  238  3e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  30.9 
 
 		 601 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1885  Amidohydrolase 3  32.26 
 
 		 587 aa  226  8e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.5166  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1541  putative amidohydrolase 3  29.33 
 
 		 648 aa  206  1e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.260198  normal  0.229672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  27.89 
 
 		 538 aa  179  8e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  28.98 
 
 		 601 aa  169  1e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  27.42 
 
 		 557 aa  163  6e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0597  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.6 
 
 		 575 aa  160  5e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0635  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  28.42 
 
 		 575 aa  159  1e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  26.59 
 
 		 543 aa  159  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  25.41 
 
 		 539 aa  157  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  25.91 
 
 		 539 aa  156  8e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  25.18 
 
 		 546 aa  156  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  25.54 
 
 		 543 aa  155  2e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  27.64 
 
 		 537 aa  155  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  25.75 
 
 		 549 aa  153  8.999999999999999e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  25.8 
 
 		 584 aa  150  6e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  25.22 
 
 		 537 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  25.31 
 
 		 545 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  26.5 
 
 		 541 aa  147  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  26.57 
 
 		 527 aa  145  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2836  amidohydrolase 3  25.62 
 
 		 597 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214714 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  27.36 
 
 		 564 aa  143  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  24.96 
 
 		 536 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3250  amidohydrolase 3  25.41 
 
 		 542 aa  143  8e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.383305  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  24.96 
 
 		 536 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  24.96 
 
 		 536 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4766  amidohydrolase 3  27.02 
 
 		 545 aa  139  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  26.94 
 
 		 526 aa  138  2e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  26.22 
 
 		 556 aa  138  3.0000000000000003e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2245  amidohydrolase 3  24.17 
 
 		 596 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.320188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0108  Amidohydrolase 3  26.81 
 
 		 547 aa  137  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.134206  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0134  amidohydrolase-like  26.69 
 
 		 547 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.900918  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  25.59 
 
 		 520 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  25.91 
 
 		 583 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2078  hypothetical protein  24.18 
 
 		 576 aa  130  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  24.38 
 
 		 603 aa  128  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  24.18 
 
 		 522 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  23.44 
 
 		 522 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  23.44 
 
 		 522 aa  124  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  23.63 
 
 		 522 aa  124  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  23.09 
 
 		 556 aa  124  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  25.91 
 
 		 540 aa  124  6e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  24.3 
 
 		 505 aa  123  7e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  24.23 
 
 		 522 aa  123  8e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  25.46 
 
 		 553 aa  121  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  24.91 
 
 		 548 aa  121  3e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  23.47 
 
 		 522 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  24.23 
 
 		 522 aa  120  7e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  25.13 
 
 		 590 aa  118  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5757  amidohydrolase:amidohydrolase-like  25.22 
 
 		 547 aa  118  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.691063  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6052  amidohydrolase 3  24.55 
 
 		 555 aa  117  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.863749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  23.82 
 
 		 520 aa  117  5e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3053  amidohydrolase family  24.14 
 
 		 574 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  24.82 
 
 		 569 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5666  amidohydrolase 3  24.44 
 
 		 554 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.498872  normal  0.0259745 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  24.34 
 
 		 533 aa  116  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7627  amidohydrolase-like  24.96 
 
 		 555 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.137819 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2000  twin-arginine translocation pathway signal  26.2 
 
 		 638 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4295  amidohydrolase 3  23.77 
 
 		 557 aa  115  2.0000000000000002e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.4347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3513  Amidohydrolase 3  23.4 
 
 		 608 aa  114  3e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  24.01 
 
 		 541 aa  115  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  25.17 
 
 		 564 aa  115  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1028  amidohydrolase 3  24.06 
 
 		 565 aa  115  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.868104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  26.08 
 
 		 525 aa  114  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  23.54 
 
 		 522 aa  114  6e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  22.6 
 
 		 522 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  22.69 
 
 		 530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  24.28 
 
 		 563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3663  Amidohydrolase 3  23.56 
 
 		 613 aa  110  5e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.815309  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  22.24 
 
 		 522 aa  110  6e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4359  Amidohydrolase 3  24.6 
 
 		 552 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.747715 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2060  Amidohydrolase 3  24.05 
 
 		 547 aa  110  1e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000181577  normal  0.134966 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29230  hypothetical protein  24.65 
 
 		 612 aa  109  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3889  Amidohydrolase 3  25.26 
 
 		 624 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0970  Amidohydrolase 3  22.96 
 
 		 616 aa  109  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.31521  hitchhiker  0.000183819 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1172  hypothetical protein  23.58 
 
 		 560 aa  108  3e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0178452  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1985  amidohydrolase 3  24.02 
 
 		 554 aa  108  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4287  amidohydrolase 3  22.81 
 
 		 544 aa  108  3e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.275898  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34970  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  24.49 
 
 		 541 aa  107  5e-22  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134464  normal  0.645084 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5457  Amidohydrolase 3  24.2 
 
 		 593 aa  107  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.330446 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  23.45 
 
 		 548 aa  106  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  23.21 
 
 		 550 aa  106  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  24.83 
 
 		 659 aa  106  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1184  amidohydrolase 3  25.45 
 
 		 544 aa  106  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  24.48 
 
 		 533 aa  105  2e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1075  exoenzymes regulatory protein aepa  23.69 
 
 		 543 aa  105  3e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.00663021  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3404  Amidohydrolase 3  26.62 
 
 		 586 aa  104  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000897209  hitchhiker  0.00001315 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  24.02 
 
 		 560 aa  104  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  23.65 
 
 		 619 aa  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  22.81 
 
 		 569 aa  103  9e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42330  Metallo-dependent hydrolase  23.67 
 
 		 656 aa  103  9e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>