105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2665 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  100 
 
 
389 aa  778    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  98.46 
 
 
389 aa  768    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0780  isoaspartyl dipeptidase  51.53 
 
 
388 aa  390  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0138983 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1004  isoaspartyl dipeptidase  49.49 
 
 
393 aa  371  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0964  isoaspartyl dipeptidase  49.34 
 
 
376 aa  358  8e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2176  isoaspartyl dipeptidase  49.1 
 
 
391 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2973  isoaspartyl dipeptidase  46.17 
 
 
402 aa  348  7e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1309  isoaspartyl dipeptidase  48.55 
 
 
402 aa  346  4e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  46.13 
 
 
390 aa  346  5e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0598  isoaspartyl dipeptidase  51.19 
 
 
363 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  45.13 
 
 
389 aa  332  9e-90  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  44.87 
 
 
389 aa  329  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  44.87 
 
 
389 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  45.38 
 
 
389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  40.2 
 
 
395 aa  318  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2586  isoaspartyl dipeptidase  47.75 
 
 
376 aa  314  9.999999999999999e-85  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0239245  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  43.96 
 
 
390 aa  312  7.999999999999999e-84  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.298373 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04197  isoaspartyl dipeptidase  40.51 
 
 
390 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0438993  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3668  isoaspartyl dipeptidase  40.51 
 
 
390 aa  300  3e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04159  hypothetical protein  40.51 
 
 
390 aa  300  3e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4777  isoaspartyl dipeptidase  40.51 
 
 
390 aa  299  6e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4927  isoaspartyl dipeptidase  40.26 
 
 
390 aa  298  8e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3736  isoaspartyl dipeptidase  40 
 
 
390 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0121859  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4867  isoaspartyl dipeptidase  41.69 
 
 
390 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.567438 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4556  isoaspartyl dipeptidase  40 
 
 
390 aa  298  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4843  isoaspartyl dipeptidase  41.69 
 
 
390 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4915  isoaspartyl dipeptidase  41.69 
 
 
390 aa  297  2e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.325437 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5836  isoaspartyl dipeptidase  40.26 
 
 
390 aa  297  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4871  isoaspartyl dipeptidase  40 
 
 
390 aa  296  3e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4768  isoaspartyl dipeptidase  41.69 
 
 
390 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4916  isoaspartyl dipeptidase  41.69 
 
 
390 aa  296  5e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  42.64 
 
 
391 aa  295  1e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4096  isoaspartyl dipeptidase  43.48 
 
 
393 aa  292  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982882 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1352  isoaspartyl dipeptidase  39.13 
 
 
377 aa  287  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  41.86 
 
 
377 aa  286  5.999999999999999e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  41.34 
 
 
378 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  39.85 
 
 
379 aa  278  1e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1115  isoaspartyl dipeptidase  43.48 
 
 
393 aa  278  2e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.201525  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  24.07 
 
 
402 aa  60.1  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  23.73 
 
 
402 aa  59.3  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  23.93 
 
 
404 aa  57.4  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  24.17 
 
 
595 aa  53.9  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  34.92 
 
 
480 aa  53.1  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  23.84 
 
 
403 aa  52.8  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1347  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  31.73 
 
 
387 aa  50.4  0.00006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000148831 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  25.45 
 
 
386 aa  50.4  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  39.39 
 
 
420 aa  48.9  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  32.35 
 
 
425 aa  48.1  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3701  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  36.19 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0437627  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  23.2 
 
 
597 aa  48.1  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  37.88 
 
 
413 aa  47.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2434  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  31.25 
 
 
378 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2190  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  40.51 
 
 
393 aa  47  0.0006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  36.46 
 
 
436 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  28.14 
 
 
431 aa  45.8  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1466  dihydroorotase  32.98 
 
 
425 aa  45.8  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0152  imidazolonepropionase  32.65 
 
 
431 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.71 
 
 
432 aa  45.8  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06750  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  22.62 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.0000848059  normal  0.767128 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2154  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  38.89 
 
 
370 aa  45.8  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  36.46 
 
 
427 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  27.34 
 
 
418 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1471  adenine deaminase  22.87 
 
 
595 aa  45.1  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0104805  normal  0.148633 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  37.74 
 
 
405 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1936  beta-lactamase  29.71 
 
 
848 aa  45.4  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.178754  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1260  imidazolonepropionase  27.97 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  32.98 
 
 
425 aa  45.4  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4364  Allantoinase  36.51 
 
 
459 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00228036 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4635  Allantoinase  36.51 
 
 
459 aa  45.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453471  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  27.78 
 
 
522 aa  45.4  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1830  dihydroorotase, multifunctional complex type  25.56 
 
 
428 aa  44.7  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  38.16 
 
 
568 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  37.74 
 
 
413 aa  44.7  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3581  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  37.8 
 
 
377 aa  44.7  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000376481  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  45.24 
 
 
413 aa  44.7  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1253  imidazolonepropionase  30.56 
 
 
404 aa  44.7  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1993  dihydroorotase  31.91 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.15618  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3166  dihydroorotase  31.91 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  29.58 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2739  dihydroorotase  30.88 
 
 
439 aa  44.3  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0920  dihydroorotase  31.91 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2750  dihydroorotase  31.91 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3108  dihydroorotase  31.91 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3144  dihydroorotase  31.91 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1855  dihydroorotase  31.91 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  33.01 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  33.01 
 
 
425 aa  44.3  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  24.17 
 
 
378 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01760  amidohydrolase  23.04 
 
 
385 aa  43.9  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2334  imidazolonepropionase  23.53 
 
 
395 aa  43.9  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.35682  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1934  imidazolonepropionase  25.51 
 
 
445 aa  43.9  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.754156  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0887  urease subunit alpha  40 
 
 
555 aa  43.9  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4659  imidazolonepropionase  29.13 
 
 
415 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563946  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2665  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.3 
 
 
424 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3058  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.3 
 
 
424 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  29.81 
 
 
412 aa  43.5  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2144  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  31.25 
 
 
377 aa  43.5  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3514  allantoinase  26.9 
 
 
460 aa  43.5  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.839381 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  32.53 
 
 
600 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  29.84 
 
 
488 aa  43.5  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>