243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_2334 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2334  imidazolonepropionase  100 
 
 
395 aa  791    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.35682  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1634  imidazolonepropionase  82.59 
 
 
411 aa  639    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  46.75 
 
 
406 aa  311  2e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2731  imidazolonepropionase  46 
 
 
411 aa  306  5.0000000000000004e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2207  imidazolonepropionase  47.12 
 
 
407 aa  292  6e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1595  imidazolonepropionase  46.54 
 
 
410 aa  292  8e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2084  imidazolonepropionase  46.86 
 
 
407 aa  290  3e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2185  imidazolonepropionase  47.14 
 
 
407 aa  290  4e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721027  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5478  imidazolonepropionase  47.4 
 
 
407 aa  290  4e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.823405  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1102  imidazolonepropionase  47.92 
 
 
407 aa  290  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.238791  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5909  imidazolonepropionase  47.14 
 
 
407 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2168  imidazolonepropionase  47.14 
 
 
407 aa  289  6e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  46.13 
 
 
407 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  46.13 
 
 
407 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  46.13 
 
 
407 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  46.13 
 
 
407 aa  289  7e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  46.13 
 
 
407 aa  289  7e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  45.81 
 
 
407 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  45.81 
 
 
407 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  45.48 
 
 
407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0164  imidazolonepropionase  46.09 
 
 
416 aa  285  1.0000000000000001e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2713  imidazolonepropionase  46.92 
 
 
423 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281626  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2943  imidazolonepropionase  44.7 
 
 
431 aa  278  9e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  43.98 
 
 
425 aa  278  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0929  imidazolonepropionase  41.91 
 
 
405 aa  276  5e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1824  imidazolonepropionase  45.99 
 
 
407 aa  276  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  42.27 
 
 
414 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2852  imidazolonepropionase  44.56 
 
 
415 aa  275  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579633  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4073  imidazolonepropionase  50.46 
 
 
405 aa  273  3e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3900  imidazolonepropionase  44.89 
 
 
406 aa  273  3e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  43.68 
 
 
411 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  45.91 
 
 
400 aa  273  5.000000000000001e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0871  imidazolonepropionase  41.91 
 
 
405 aa  270  2.9999999999999997e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2549  imidazolonepropionase  45.33 
 
 
407 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  42.89 
 
 
410 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  43.39 
 
 
414 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  43.16 
 
 
411 aa  270  4e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  42.41 
 
 
408 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3004  imidazolonepropionase  44.85 
 
 
405 aa  270  5e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.783832  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  41.73 
 
 
408 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  41.73 
 
 
408 aa  269  5e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  42.67 
 
 
408 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1934  imidazolonepropionase  40.36 
 
 
445 aa  269  8e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.754156  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  42.41 
 
 
410 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  41.73 
 
 
408 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  42.41 
 
 
408 aa  268  1e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  42.41 
 
 
408 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  43.67 
 
 
408 aa  268  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  43.13 
 
 
408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  42.01 
 
 
424 aa  266  4e-70  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  40.1 
 
 
418 aa  266  5e-70  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  41.88 
 
 
408 aa  265  8e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1436  imidazolonepropionase  40.32 
 
 
405 aa  265  8.999999999999999e-70  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632671  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  43.62 
 
 
399 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  42.67 
 
 
408 aa  264  3e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0152  imidazolonepropionase  44.02 
 
 
431 aa  263  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1260  imidazolonepropionase  42.26 
 
 
418 aa  263  4.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67250  imidazolonepropionase  45.19 
 
 
402 aa  260  3e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751738  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0705  imidazolonepropionase  40.76 
 
 
407 aa  260  3e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254445  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2113  imidazolonepropionase  42.78 
 
 
406 aa  260  4e-68  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.669841  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2961  imidazolonepropionase  43.54 
 
 
416 aa  259  4e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281832  normal  0.765672 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3648  imidazolonepropionase  42.26 
 
 
456 aa  259  5.0000000000000005e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2222  imidazolonepropionase  42.78 
 
 
406 aa  259  5.0000000000000005e-68  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.201457  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  42.6 
 
 
412 aa  259  6e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  42.06 
 
 
403 aa  258  2e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2986  imidazolonepropionase  43.05 
 
 
417 aa  257  2e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1604  imidazolonepropionase  43.7 
 
 
402 aa  257  2e-67  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.413765  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1253  imidazolonepropionase  44.09 
 
 
404 aa  258  2e-67  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5826  imidazolonepropionase  44.53 
 
 
402 aa  257  2e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2077  imidazolonepropionase  43.68 
 
 
407 aa  256  3e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.819933  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2512  imidazolonepropionase  42.52 
 
 
406 aa  256  3e-67  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0955381 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2644  imidazolonepropionase  42.37 
 
 
408 aa  256  6e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142165  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2160  imidazolonepropionase  42.37 
 
 
424 aa  256  6e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  44.76 
 
 
401 aa  255  8e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  44.92 
 
 
401 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  44.92 
 
 
401 aa  255  8e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003720  imidazolonepropionase  43.64 
 
 
416 aa  254  1.0000000000000001e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  43.91 
 
 
401 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3836  imidazolonepropionase  40.36 
 
 
439 aa  254  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.320819  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  44.36 
 
 
403 aa  254  3e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  44.92 
 
 
401 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2655  imidazolonepropionase  44.24 
 
 
403 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4835  imidazolonepropionase  44.19 
 
 
401 aa  250  3e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246682  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00726  imidazolonepropionase  43.12 
 
 
401 aa  249  4e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15729  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1303  imidazolonepropionase  45.38 
 
 
414 aa  250  4e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  41.65 
 
 
382 aa  249  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  43.79 
 
 
401 aa  249  6e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0825  imidazolonepropionase  41.47 
 
 
402 aa  248  1e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4551  imidazolonepropionase  42.58 
 
 
402 aa  248  1e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3904  imidazolonepropionase  43.12 
 
 
505 aa  248  2e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  42 
 
 
423 aa  247  3e-64  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1039  imidazolonepropionase  42.55 
 
 
400 aa  246  6e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.017849  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5926  imidazolonepropionase  42.59 
 
 
420 aa  246  6e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103117  normal  0.194871 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0851  imidazolonepropionase  40.05 
 
 
420 aa  246  6.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  37.11 
 
 
411 aa  245  9e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  37.17 
 
 
428 aa  245  9.999999999999999e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0937  imidazolonepropionase  40.05 
 
 
407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0823  imidazolonepropionase  39.79 
 
 
407 aa  243  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6452  imidazolonepropionase  42.7 
 
 
404 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0882  imidazolonepropionase  39.53 
 
 
407 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>