141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3736 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_04197  isoaspartyl dipeptidase  99.23 
 
 		 390 aa  784    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0438993  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3668  isoaspartyl dipeptidase  99.23 
 
 		 390 aa  784    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04159  hypothetical protein  99.23 
 
 		 390 aa  784    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4556  isoaspartyl dipeptidase  99.74 
 
 		 390 aa  786    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4927  isoaspartyl dipeptidase  99.49 
 
 		 390 aa  784    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3736  isoaspartyl dipeptidase  100 
 
 		 390 aa  789    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0121859  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4871  isoaspartyl dipeptidase  99.23 
 
 		 390 aa  783    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4777  isoaspartyl dipeptidase  98.72 
 
 		 390 aa  781    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4867  isoaspartyl dipeptidase  81.28 
 
 		 390 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.567438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4916  isoaspartyl dipeptidase  81.28 
 
 		 390 aa  646    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4768  isoaspartyl dipeptidase  80.77 
 
 		 390 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4843  isoaspartyl dipeptidase  81.03 
 
 		 390 aa  645    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4915  isoaspartyl dipeptidase  80.77 
 
 		 390 aa  644    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.325437 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5836  isoaspartyl dipeptidase  99.23 
 
 		 390 aa  783    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4096  isoaspartyl dipeptidase  47.8 
 
 		 393 aa  351  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982882 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2176  isoaspartyl dipeptidase  46.79 
 
 		 391 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0780  isoaspartyl dipeptidase  45.22 
 
 		 388 aa  327  3e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0138983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2973  isoaspartyl dipeptidase  44.56 
 
 		 402 aa  323  4e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1352  isoaspartyl dipeptidase  43.23 
 
 		 377 aa  312  6.999999999999999e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  43.65 
 
 		 379 aa  309  4e-83  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  43.8 
 
 		 377 aa  302  8.000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  43.8 
 
 		 378 aa  296  4e-79  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  43.38 
 
 		 391 aa  292  9e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  43.15 
 
 		 395 aa  290  3e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  42.6 
 
 		 390 aa  288  2e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  40 
 
 		 389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  40 
 
 		 389 aa  281  1e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  39.69 
 
 		 389 aa  272  7e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  40.62 
 
 		 390 aa  271  2e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1004  isoaspartyl dipeptidase  40.92 
 
 		 393 aa  270  2e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  39.43 
 
 		 389 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  39.69 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  39.43 
 
 		 389 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0598  isoaspartyl dipeptidase  40.82 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1309  isoaspartyl dipeptidase  40.48 
 
 		 402 aa  265  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0964  isoaspartyl dipeptidase  37.8 
 
 		 376 aa  265  1e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1115  isoaspartyl dipeptidase  40.11 
 
 		 393 aa  250  2e-65  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.201525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2586  isoaspartyl dipeptidase  36.63 
 
 		 376 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0239245  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3402  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  38.82 
 
 		 374 aa  56.6  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000022034  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.48 
 
 		 430 aa  56.6  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2190  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  25.39 
 
 		 393 aa  53.5  0.000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  53.33 
 
 		 386 aa  53.1  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  33.67 
 
 		 428 aa  53.5  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  53.33 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  33.67 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  33.67 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  33.67 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  33.67 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  33.67 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  33.67 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  34.38 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  33.67 
 
 		 428 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  30 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  43.94 
 
 		 426 aa  50.8  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  32.65 
 
 		 428 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  35.94 
 
 		 388 aa  50.1  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5176  amidohydrolase  30.38 
 
 		 686 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.167618  normal  0.830849 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11860  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.64 
 
 		 430 aa  49.7  0.00009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0270101  normal  0.0379723 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.53 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1877  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.51 
 
 		 439 aa  49.3  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  42.62 
 
 		 496 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  41.67 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  40.91 
 
 		 431 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  40.32 
 
 		 457 aa  48.1  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  41.67 
 
 		 436 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2999  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.3 
 
 		 494 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.680809  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  35.8 
 
 		 908 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.82 
 
 		 429 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0184  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  31.36 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0749437  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  34.52 
 
 		 1005 aa  47  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  33.33 
 
 		 412 aa  47.4  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0289  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  35.21 
 
 		 362 aa  47.4  0.0005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  50 
 
 		 585 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0206  hypothetical protein  34.9 
 
 		 466 aa  46.2  0.0009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.166385  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  28.33 
 
 		 541 aa  46.2  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  25.63 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0543  phenylhydantoinase  42.62 
 
 		 499 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3425  Amidohydrolase 3  40.38 
 
 		 491 aa  46.2  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0036735  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3638  phenylhydantoinase  40.98 
 
 		 479 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5168  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.3 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.642723  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  35.21 
 
 		 379 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  32.53 
 
 		 413 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  47.73 
 
 		 403 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  30.51 
 
 		 434 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  34.52 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  41.51 
 
 		 412 aa  45.4  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1045  dihydroorotase  30.3 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0592  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  35.45 
 
 		 392 aa  45.1  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4435  amidohydrolase  30.33 
 
 		 451 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3746  dihydroorotase  32 
 
 		 427 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378515  normal  0.0302761 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11410  dihydroorotase  31.73 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.578109  normal  0.21222 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  46.67 
 
 		 556 aa  45.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2383  amidohydrolase 3  39.34 
 
 		 521 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0177444  hitchhiker  0.000308014 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.84 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  34.21 
 
 		 429 aa  45.4  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2473  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  35.38 
 
 		 385 aa  44.3  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05770  phenylhydantoinase  40.98 
 
 		 479 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3862  amidohydrolase 3  36.11 
 
 		 563 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3987  amidohydrolase 3  36.11 
 
 		 563 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3492  urease domain protein  37.31 
 
 		 256 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>