88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0780 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0780  isoaspartyl dipeptidase  100 
 
 
388 aa  777    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0138983 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  51.53 
 
 
389 aa  390  1e-107  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1004  isoaspartyl dipeptidase  51.91 
 
 
393 aa  389  1e-107  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  50.77 
 
 
389 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0964  isoaspartyl dipeptidase  53.33 
 
 
376 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2176  isoaspartyl dipeptidase  52.3 
 
 
391 aa  381  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2973  isoaspartyl dipeptidase  48.45 
 
 
402 aa  364  1e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4867  isoaspartyl dipeptidase  46.25 
 
 
390 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.567438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4915  isoaspartyl dipeptidase  46.25 
 
 
390 aa  345  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.325437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4843  isoaspartyl dipeptidase  46.25 
 
 
390 aa  344  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4768  isoaspartyl dipeptidase  46.25 
 
 
390 aa  343  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4927  isoaspartyl dipeptidase  45.22 
 
 
390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4556  isoaspartyl dipeptidase  45.22 
 
 
390 aa  342  4e-93  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4916  isoaspartyl dipeptidase  46.25 
 
 
390 aa  342  5e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04197  isoaspartyl dipeptidase  45.22 
 
 
390 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0438993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04159  hypothetical protein  45.22 
 
 
390 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3668  isoaspartyl dipeptidase  45.22 
 
 
390 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3736  isoaspartyl dipeptidase  45.22 
 
 
390 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0121859  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5836  isoaspartyl dipeptidase  45.22 
 
 
390 aa  342  5.999999999999999e-93  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4871  isoaspartyl dipeptidase  44.96 
 
 
390 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4777  isoaspartyl dipeptidase  44.96 
 
 
390 aa  340  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  44.7 
 
 
390 aa  340  2e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1352  isoaspartyl dipeptidase  46.79 
 
 
377 aa  338  7e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  46.53 
 
 
391 aa  332  5e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4096  isoaspartyl dipeptidase  46.45 
 
 
393 aa  331  2e-89  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982882 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  45.01 
 
 
389 aa  329  6e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1309  isoaspartyl dipeptidase  46.02 
 
 
402 aa  328  8e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  44.5 
 
 
389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  44.5 
 
 
389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  44.5 
 
 
389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  45.78 
 
 
390 aa  322  7e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0598  isoaspartyl dipeptidase  46.93 
 
 
363 aa  316  4e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  42.78 
 
 
378 aa  301  2e-80  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  40.72 
 
 
379 aa  299  6e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2586  isoaspartyl dipeptidase  44.85 
 
 
376 aa  295  9e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0239245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  38.42 
 
 
395 aa  286  5e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  42.27 
 
 
377 aa  285  9e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1115  isoaspartyl dipeptidase  40.93 
 
 
393 aa  268  1e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.201525  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  25 
 
 
596 aa  56.6  0.0000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  35 
 
 
425 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  32.09 
 
 
425 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  32.09 
 
 
425 aa  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  25.49 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2190  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  32.54 
 
 
393 aa  50.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4132  hypothetical protein  29.49 
 
 
451 aa  50.1  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  40 
 
 
457 aa  48.9  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5926  imidazolonepropionase  22.36 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103117  normal  0.194871 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1376  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.34 
 
 
430 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  29.91 
 
 
620 aa  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  40 
 
 
432 aa  46.6  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6922  imidazolonepropionase  33.7 
 
 
420 aa  46.6  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386795  normal  0.926184 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  43.48 
 
 
388 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  21.33 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  21.97 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  24.38 
 
 
571 aa  45.4  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  24.31 
 
 
571 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1654  imidazolonepropionase  25.5 
 
 
400 aa  45.4  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0408106  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5642  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  55.88 
 
 
411 aa  45.1  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3211  amidohydrolase  26.22 
 
 
680 aa  45.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.361649  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  22.92 
 
 
576 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  33.68 
 
 
401 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.64 
 
 
418 aa  45.1  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22930  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  31.21 
 
 
379 aa  44.7  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1951  amidohydrolase, putative  42.42 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.140573  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2434  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  37.84 
 
 
378 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3129  amidohydrolase 3  34.72 
 
 
568 aa  44.3  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2239  putative amidohydrolase  42.42 
 
 
385 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0161054  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  31.43 
 
 
556 aa  44.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73070  dihydroorotase  28.23 
 
 
445 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297271  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  34.62 
 
 
436 aa  43.9  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1039  imidazolonepropionase  28.43 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.017849  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.38 
 
 
426 aa  43.9  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2549  imidazolonepropionase  30.68 
 
 
407 aa  43.9  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2764  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.49 
 
 
441 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.09 
 
 
418 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1089  dihydroorotase  36.92 
 
 
425 aa  43.9  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.54 
 
 
495 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  28.16 
 
 
412 aa  43.5  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4659  imidazolonepropionase  26.03 
 
 
415 aa  43.5  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563946  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4541  dihydroorotase  29.2 
 
 
446 aa  43.5  0.006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  28 
 
 
445 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  40.91 
 
 
459 aa  43.5  0.006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  30.77 
 
 
558 aa  43.1  0.009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2646  amidohydrolase  35.51 
 
 
407 aa  42.7  0.01  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  25.2 
 
 
413 aa  42.7  0.01  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  32.86 
 
 
601 aa  42.7  0.01  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  34.62 
 
 
427 aa  42.7  0.01  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2106  dihydropyrimidinase  36.36 
 
 
459 aa  42.7  0.01  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.645482  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>