250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_2799 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  76.48 
 
 		 608 aa  924    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  100 
 
 		 601 aa  1231    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  68.98 
 
 		 595 aa  841    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  71.94 
 
 		 597 aa  883    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  48.81 
 
 		 596 aa  544  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  44.98 
 
 		 603 aa  514  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  43.43 
 
 		 601 aa  477  1e-133  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  47.92 
 
 		 606 aa  475  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  39.28 
 
 		 571 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  39.45 
 
 		 571 aa  379  1e-103  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  40.99 
 
 		 575 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  38.7 
 
 		 576 aa  371  1e-101  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  38.77 
 
 		 571 aa  371  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  36.6 
 
 		 588 aa  362  9e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  36.22 
 
 		 584 aa  362  1e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  40.27 
 
 		 573 aa  360  4e-98  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.489657 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  39.93 
 
 		 567 aa  360  6e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  39.07 
 
 		 581 aa  355  1e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  38.9 
 
 		 563 aa  354  2e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  39.07 
 
 		 613 aa  353  5e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  40.55 
 
 		 564 aa  351  2e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  37.21 
 
 		 581 aa  348  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  36.08 
 
 		 574 aa  347  4e-94  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  39.63 
 
 		 565 aa  343  5.999999999999999e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  38.16 
 
 		 565 aa  342  2e-92  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  38.16 
 
 		 565 aa  341  2e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  39.06 
 
 		 569 aa  340  4e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  37.54 
 
 		 581 aa  340  5e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  39.49 
 
 		 565 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  38.97 
 
 		 565 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  39.07 
 
 		 565 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  38.4 
 
 		 570 aa  332  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  37.41 
 
 		 564 aa  328  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  38.03 
 
 		 565 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  35 
 
 		 570 aa  326  8.000000000000001e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  38.1 
 
 		 564 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  36.01 
 
 		 576 aa  318  1e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  34.41 
 
 		 576 aa  308  1.0000000000000001e-82  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  33.51 
 
 		 566 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  36.61 
 
 		 573 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  32.13 
 
 		 568 aa  303  6.000000000000001e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  37.06 
 
 		 582 aa  300  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  35.36 
 
 		 558 aa  296  6e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  36.99 
 
 		 564 aa  295  1e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  33.33 
 
 		 573 aa  295  2e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  38.39 
 
 		 572 aa  293  6e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  34.68 
 
 		 551 aa  290  7e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  34.52 
 
 		 545 aa  289  9e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0418  adenine deaminase  34.93 
 
 		 551 aa  281  2e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  33.95 
 
 		 601 aa  281  2e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4006  Adenine deaminase  35.23 
 
 		 598 aa  281  2e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275128  normal  0.23839 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  35.89 
 
 		 555 aa  280  4e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  33.4 
 
 		 551 aa  278  2e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  33.04 
 
 		 588 aa  277  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  35.85 
 
 		 595 aa  277  3e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  35.41 
 
 		 593 aa  277  4e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  33.04 
 
 		 588 aa  276  6e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0272837 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  28.74 
 
 		 571 aa  274  4.0000000000000004e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  31.52 
 
 		 594 aa  273  5.000000000000001e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1082  adenine deaminase  34.83 
 
 		 600 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  32.7 
 
 		 588 aa  271  2e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  32.7 
 
 		 588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  32.7 
 
 		 588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  32.7 
 
 		 588 aa  271  2.9999999999999997e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  34.34 
 
 		 542 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.101601 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  32.58 
 
 		 569 aa  270  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  32.7 
 
 		 588 aa  270  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3431  adenine deaminase  34.83 
 
 		 601 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3740  Adenine deaminase  34.66 
 
 		 601 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0420  adenine deaminase  34.29 
 
 		 564 aa  269  8.999999999999999e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  32.21 
 
 		 600 aa  269  8.999999999999999e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  34.78 
 
 		 601 aa  269  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  33.67 
 
 		 599 aa  268  2e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  33.5 
 
 		 600 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  32.53 
 
 		 588 aa  267  4e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  33.62 
 
 		 567 aa  266  5e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  31.17 
 
 		 548 aa  266  1e-69  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  33.81 
 
 		 518 aa  263  6e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4610  adenine deaminase  36.36 
 
 		 593 aa  261  4e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  32.51 
 
 		 553 aa  254  3e-66  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0932  adenine deaminase  29.87 
 
 		 596 aa  244  3e-63  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  32.23 
 
 		 623 aa  242  1e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  34.08 
 
 		 595 aa  241  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  32.86 
 
 		 641 aa  241  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  32.65 
 
 		 598 aa  236  1.0000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  30.33 
 
 		 568 aa  232  1e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1778  adenine deaminase  30.96 
 
 		 567 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0973  Adenine deaminase  29.22 
 
 		 592 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.796039  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2826  Adenine deaminase  29.41 
 
 		 592 aa  213  1e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1744  adenine deaminase  31.34 
 
 		 588 aa  211  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.454715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2218  putative adenine deaminase  27.85 
 
 		 584 aa  181  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000470713 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  27.71 
 
 		 584 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2753  adenine deaminase  27.19 
 
 		 589 aa  178  3e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.584086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2818  adenine deaminase  27.83 
 
 		 584 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3026  putative adenine deaminase  27.83 
 
 		 584 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3032  adenine deaminase  27.83 
 
 		 584 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3063  putative adenine deaminase  25.86 
 
 		 582 aa  172  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  25.78 
 
 		 585 aa  170  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2823  adenine deaminase  26.87 
 
 		 580 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107403  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0266  Adenine deaminase  25.13 
 
 		 581 aa  168  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000208487  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>