140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4254 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  99.3 
 
 		 588 aa  1163    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  99.3 
 
 		 588 aa  1163    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  99.3 
 
 		 588 aa  1163    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  99.3 
 
 		 588 aa  1164    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  99.12 
 
 		 588 aa  1159    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  99.47 
 
 		 588 aa  1165    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  98.42 
 
 		 588 aa  1153    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  100 
 
 		 569 aa  1171    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  98.59 
 
 		 588 aa  1158    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0272837 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  43.22 
 
 		 581 aa  420  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  42.61 
 
 		 563 aa  412  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  42.38 
 
 		 573 aa  414  1e-114  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  42.58 
 
 		 564 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  41.84 
 
 		 564 aa  402  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  41.99 
 
 		 565 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  41.73 
 
 		 581 aa  397  1e-109  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  41.9 
 
 		 613 aa  398  1e-109  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  42.16 
 
 		 565 aa  395  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  40.54 
 
 		 564 aa  395  1e-108  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  41.61 
 
 		 565 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  40.46 
 
 		 565 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  40.46 
 
 		 565 aa  389  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  39.54 
 
 		 565 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  39.54 
 
 		 565 aa  385  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  39.1 
 
 		 567 aa  380  1e-104  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  34.84 
 
 		 570 aa  362  1e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  39.31 
 
 		 569 aa  357  5e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  37.33 
 
 		 575 aa  342  1e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  36 
 
 		 573 aa  340  5e-92  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.489657 
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  35.59 
 
 		 571 aa  340  5.9999999999999996e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  35.92 
 
 		 571 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  36.28 
 
 		 576 aa  332  2e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  35.54 
 
 		 574 aa  331  2e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  36.43 
 
 		 584 aa  330  6e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  33.97 
 
 		 576 aa  329  8e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  36.72 
 
 		 581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  36.91 
 
 		 558 aa  326  5e-88  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  35.16 
 
 		 568 aa  325  1e-87  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  35.07 
 
 		 571 aa  319  1e-85  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  35.38 
 
 		 596 aa  317  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  36.38 
 
 		 603 aa  310  5e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  38.27 
 
 		 518 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  34.85 
 
 		 576 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  36.54 
 
 		 551 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  34.73 
 
 		 570 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  35.21 
 
 		 566 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  33.93 
 
 		 551 aa  298  2e-79  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  36.4 
 
 		 573 aa  296  8e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  37.52 
 
 		 545 aa  296  9e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  34.33 
 
 		 588 aa  295  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  35.25 
 
 		 572 aa  280  4e-74  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0418  adenine deaminase  34.03 
 
 		 551 aa  280  5e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  32.29 
 
 		 548 aa  279  1e-73  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  33.17 
 
 		 601 aa  275  2.0000000000000002e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0420  adenine deaminase  36.96 
 
 		 564 aa  275  2.0000000000000002e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1778  adenine deaminase  34.4 
 
 		 567 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  32.26 
 
 		 597 aa  274  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  34.48 
 
 		 555 aa  272  1e-71  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  32.58 
 
 		 601 aa  270  4e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  35.41 
 
 		 542 aa  269  8e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.101601 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  31.92 
 
 		 553 aa  267  2.9999999999999995e-70  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  31.81 
 
 		 595 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  33.52 
 
 		 593 aa  256  6e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4610  adenine deaminase  33.84 
 
 		 593 aa  249  6e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  34.11 
 
 		 595 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  32.57 
 
 		 564 aa  242  1e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  34.1 
 
 		 595 aa  234  2.0000000000000002e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  29.11 
 
 		 571 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  29.16 
 
 		 608 aa  234  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0932  adenine deaminase  29.26 
 
 		 596 aa  231  3e-59  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  28.67 
 
 		 568 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  32.04 
 
 		 598 aa  229  1e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  32.59 
 
 		 606 aa  225  2e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  30.17 
 
 		 582 aa  207  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4006  Adenine deaminase  31.51 
 
 		 598 aa  205  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275128  normal  0.23839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  31.14 
 
 		 601 aa  204  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  30.6 
 
 		 601 aa  202  1.9999999999999998e-50  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3740  Adenine deaminase  32.72 
 
 		 601 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  27.43 
 
 		 567 aa  197  4.0000000000000005e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3431  adenine deaminase  32.91 
 
 		 601 aa  196  7e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  30.28 
 
 		 599 aa  193  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  30.78 
 
 		 600 aa  190  5.999999999999999e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1082  adenine deaminase  30.78 
 
 		 600 aa  188  2e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  27.71 
 
 		 594 aa  186  9e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0973  Adenine deaminase  28.27 
 
 		 592 aa  170  7e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.796039  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  25.95 
 
 		 600 aa  163  9e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  28.79 
 
 		 641 aa  162  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1142  Adenine deaminase  25.91 
 
 		 581 aa  151  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2826  Adenine deaminase  26.39 
 
 		 592 aa  150  4e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  29.87 
 
 		 623 aa  150  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0266  Adenine deaminase  25.22 
 
 		 581 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000208487  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1744  adenine deaminase  26.77 
 
 		 588 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.454715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2823  adenine deaminase  23.74 
 
 		 580 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2218  putative adenine deaminase  23.73 
 
 		 584 aa  124  5e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000470713 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2753  adenine deaminase  23.58 
 
 		 589 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.584086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  23.47 
 
 		 585 aa  122  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  23.21 
 
 		 584 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3063  putative adenine deaminase  23.4 
 
 		 582 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2818  adenine deaminase  23.21 
 
 		 584 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3032  adenine deaminase  23.21 
 
 		 584 aa  120  7e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>