208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_3359 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  53.67 
 
 
601 aa  667    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  65.87 
 
 
596 aa  799    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  100 
 
 
603 aa  1235    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  48.99 
 
 
595 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  46.35 
 
 
597 aa  515  1.0000000000000001e-145  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  44.98 
 
 
601 aa  514  1e-144  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  46.82 
 
 
606 aa  501  1e-140  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  44.09 
 
 
608 aa  491  1e-137  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  42.81 
 
 
571 aa  432  1e-119  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  41.17 
 
 
584 aa  424  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  42.11 
 
 
571 aa  424  1e-117  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  41.91 
 
 
571 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  40.55 
 
 
576 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  40.59 
 
 
575 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  37.48 
 
 
588 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  40.52 
 
 
567 aa  390  1e-107  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  40.35 
 
 
581 aa  386  1e-106  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  38.02 
 
 
581 aa  384  1e-105  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  39.65 
 
 
573 aa  376  1e-103  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  42.19 
 
 
569 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  40.38 
 
 
565 aa  375  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  36.8 
 
 
570 aa  371  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  38.66 
 
 
564 aa  366  1e-100  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  39.48 
 
 
573 aa  367  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.489657 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  36.81 
 
 
576 aa  366  1e-100  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  39.52 
 
 
576 aa  365  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  40.38 
 
 
570 aa  363  7.0000000000000005e-99  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  38.35 
 
 
581 aa  357  2.9999999999999997e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  38.53 
 
 
563 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  38.92 
 
 
565 aa  353  4e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  38.18 
 
 
613 aa  353  4e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  38.94 
 
 
565 aa  352  2e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  38.24 
 
 
573 aa  350  6e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  38.74 
 
 
565 aa  350  6e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  35.16 
 
 
574 aa  342  1e-92  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  34.83 
 
 
566 aa  339  8e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  37.17 
 
 
564 aa  333  7.000000000000001e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  37.17 
 
 
545 aa  330  6e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  36.1 
 
 
551 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  34.07 
 
 
568 aa  327  3e-88  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  37.35 
 
 
565 aa  327  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  35.22 
 
 
551 aa  325  2e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  32.17 
 
 
571 aa  325  2e-87  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  37.24 
 
 
555 aa  324  3e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  36.76 
 
 
565 aa  323  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  35.07 
 
 
599 aa  323  5e-87  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  37.17 
 
 
565 aa  323  8e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  35.08 
 
 
600 aa  322  9.999999999999999e-87  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  35.88 
 
 
582 aa  320  7e-86  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  36.93 
 
 
518 aa  318  2e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  36.63 
 
 
588 aa  318  2e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0272837 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  36.69 
 
 
588 aa  317  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4006  Adenine deaminase  36.16 
 
 
598 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275128  normal  0.23839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  34.79 
 
 
600 aa  317  4e-85  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  36.46 
 
 
588 aa  316  7e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  36.46 
 
 
588 aa  316  7e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  36.46 
 
 
588 aa  316  7e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1082  adenine deaminase  35.41 
 
 
600 aa  314  2.9999999999999996e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  36.29 
 
 
588 aa  314  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  36.29 
 
 
588 aa  313  4.999999999999999e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  36.01 
 
 
564 aa  313  5.999999999999999e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  37.13 
 
 
572 aa  311  2e-83  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  33.61 
 
 
601 aa  311  2.9999999999999997e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  36.38 
 
 
569 aa  310  5e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  36.18 
 
 
588 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0420  adenine deaminase  37.59 
 
 
564 aa  309  9e-83  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  37.61 
 
 
593 aa  305  1.0000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3431  adenine deaminase  35.02 
 
 
601 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3740  Adenine deaminase  34.85 
 
 
601 aa  303  6.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0418  adenine deaminase  35.58 
 
 
551 aa  301  3e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  36.77 
 
 
595 aa  300  7e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  35.04 
 
 
601 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  36.24 
 
 
542 aa  294  3e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.101601 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4610  adenine deaminase  36.9 
 
 
593 aa  294  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  34.42 
 
 
558 aa  293  7e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  30.38 
 
 
548 aa  293  8e-78  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  34.01 
 
 
598 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  31.5 
 
 
594 aa  283  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1778  adenine deaminase  33.62 
 
 
567 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  33.15 
 
 
553 aa  281  2e-74  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  35.14 
 
 
595 aa  281  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  30.07 
 
 
568 aa  269  1e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  33.33 
 
 
564 aa  265  1e-69  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0932  adenine deaminase  32.12 
 
 
596 aa  257  4e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0973  Adenine deaminase  31.9 
 
 
592 aa  251  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.796039  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  32.03 
 
 
623 aa  247  6e-64  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  31.4 
 
 
641 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2826  Adenine deaminase  29.86 
 
 
592 aa  244  3.9999999999999997e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1744  adenine deaminase  28.89 
 
 
588 aa  226  1e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.454715  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  31.52 
 
 
567 aa  220  7e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0266  Adenine deaminase  24.04 
 
 
581 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000208487  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1471  adenine deaminase  25.5 
 
 
595 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0104805  normal  0.148633 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1142  Adenine deaminase  23.41 
 
 
581 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2220  putative AdeC4 adenine deaminase  29.88 
 
 
318 aa  153  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.424398  hitchhiker  0.00429116 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5687  adenine deaminase  27.93 
 
 
667 aa  151  4e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3063  putative adenine deaminase  22.93 
 
 
582 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154725  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  23.08 
 
 
584 aa  140  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2753  adenine deaminase  23.59 
 
 
589 aa  140  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.584086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  22.88 
 
 
585 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2218  putative adenine deaminase  23.5 
 
 
584 aa  138  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000470713 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>