116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1539 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  100 
 
 
518 aa  1024    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  60.62 
 
 
558 aa  588  1e-167  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1778  adenine deaminase  56.78 
 
 
567 aa  533  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  46.98 
 
 
571 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  46.42 
 
 
571 aa  439  9.999999999999999e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  47.38 
 
 
576 aa  430  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  44.69 
 
 
576 aa  422  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  45.28 
 
 
571 aa  417  9.999999999999999e-116  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  44.84 
 
 
573 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.489657 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  43.56 
 
 
570 aa  392  1e-108  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  41.33 
 
 
568 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  45.79 
 
 
575 aa  393  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  44.65 
 
 
569 aa  385  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  39.32 
 
 
570 aa  384  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  45.38 
 
 
564 aa  385  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  44.55 
 
 
613 aa  377  1e-103  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  45.16 
 
 
565 aa  378  1e-103  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  44.17 
 
 
581 aa  375  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  41.79 
 
 
551 aa  375  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  44.51 
 
 
565 aa  372  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  44.78 
 
 
565 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  43.98 
 
 
565 aa  375  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  42.83 
 
 
563 aa  372  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  40.38 
 
 
576 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  42.75 
 
 
564 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  44.99 
 
 
573 aa  367  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  42.83 
 
 
565 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  38.59 
 
 
574 aa  365  1e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  43.18 
 
 
567 aa  363  4e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  44.51 
 
 
565 aa  363  4e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  41.89 
 
 
565 aa  363  4e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  39.66 
 
 
566 aa  356  6.999999999999999e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  44.08 
 
 
564 aa  351  2e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  42.91 
 
 
581 aa  349  5e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  41.17 
 
 
581 aa  350  5e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  39.08 
 
 
553 aa  345  1e-93  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  40.61 
 
 
545 aa  344  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  37.98 
 
 
551 aa  338  9.999999999999999e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0418  adenine deaminase  39.22 
 
 
551 aa  337  3.9999999999999995e-91  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  38.11 
 
 
542 aa  336  5e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.101601 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  38.31 
 
 
584 aa  330  5.0000000000000004e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  39.11 
 
 
573 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  36.93 
 
 
603 aa  318  2e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  38.27 
 
 
588 aa  310  5.9999999999999995e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  38.03 
 
 
588 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  38.03 
 
 
588 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  38.27 
 
 
588 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  38.03 
 
 
588 aa  309  6.999999999999999e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  38.27 
 
 
569 aa  309  9e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  37.73 
 
 
588 aa  308  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0272837 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  36.69 
 
 
596 aa  306  4.0000000000000004e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  40 
 
 
572 aa  305  9.000000000000001e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  38.08 
 
 
588 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  38.1 
 
 
588 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0420  adenine deaminase  40.87 
 
 
564 aa  303  5.000000000000001e-81  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  34.58 
 
 
548 aa  298  2e-79  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  36.47 
 
 
588 aa  293  5e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  35.14 
 
 
601 aa  287  2.9999999999999996e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  37.78 
 
 
555 aa  283  6.000000000000001e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  36.05 
 
 
595 aa  272  9e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0932  adenine deaminase  31.74 
 
 
596 aa  264  3e-69  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  33.81 
 
 
601 aa  263  4.999999999999999e-69  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  34 
 
 
597 aa  263  6.999999999999999e-69  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  33.7 
 
 
608 aa  240  5e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  30.15 
 
 
568 aa  234  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4610  adenine deaminase  36.42 
 
 
593 aa  232  1e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  37.06 
 
 
564 aa  232  2e-59  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  37 
 
 
606 aa  229  9e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  36.26 
 
 
582 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  31.5 
 
 
567 aa  221  3e-56  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  34.2 
 
 
601 aa  220  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  32.23 
 
 
593 aa  216  8e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  33.67 
 
 
595 aa  215  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  34.74 
 
 
598 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  32.5 
 
 
595 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  32.83 
 
 
600 aa  199  1.0000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  27.88 
 
 
571 aa  197  3e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  32.54 
 
 
599 aa  196  8.000000000000001e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4006  Adenine deaminase  32.01 
 
 
598 aa  195  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275128  normal  0.23839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  32.56 
 
 
601 aa  193  8e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1082  adenine deaminase  33.21 
 
 
600 aa  192  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  30.44 
 
 
600 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3740  Adenine deaminase  31.59 
 
 
601 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3431  adenine deaminase  31.59 
 
 
601 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  28.44 
 
 
594 aa  156  8e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  30.66 
 
 
623 aa  155  2e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  29.61 
 
 
641 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0973  Adenine deaminase  27.57 
 
 
592 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.796039  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1744  adenine deaminase  30.13 
 
 
588 aa  131  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.454715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1142  Adenine deaminase  27.91 
 
 
581 aa  120  7e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2818  adenine deaminase  25.19 
 
 
584 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3032  adenine deaminase  25.19 
 
 
584 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  25.19 
 
 
584 aa  117  6e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3026  putative adenine deaminase  25.19 
 
 
584 aa  116  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0266  Adenine deaminase  25.05 
 
 
581 aa  110  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000208487  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2753  adenine deaminase  24.53 
 
 
589 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.584086  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2826  Adenine deaminase  26.32 
 
 
592 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3063  putative adenine deaminase  24.21 
 
 
582 aa  102  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  24.85 
 
 
585 aa  100  4e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1471  adenine deaminase  24.51 
 
 
595 aa  97.8  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0104805  normal  0.148633 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>