149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1461 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  100 
 
 
581 aa  1145    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  44.06 
 
 
570 aa  452  1.0000000000000001e-126  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  38.9 
 
 
568 aa  454  1.0000000000000001e-126  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  46.3 
 
 
573 aa  455  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.489657 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  43.7 
 
 
567 aa  452  1e-125  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  41.87 
 
 
571 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  41.34 
 
 
571 aa  444  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  44.76 
 
 
575 aa  444  1e-123  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  42.61 
 
 
576 aa  431  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  40.99 
 
 
571 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  38.35 
 
 
574 aa  432  1e-119  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  43.34 
 
 
581 aa  431  1e-119  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  43.01 
 
 
565 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  40.98 
 
 
581 aa  413  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  41.95 
 
 
565 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  40.81 
 
 
613 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  43.76 
 
 
569 aa  415  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  41.77 
 
 
565 aa  412  1e-113  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  40 
 
 
563 aa  410  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  41.64 
 
 
565 aa  404  1e-111  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  39.93 
 
 
564 aa  404  1e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  41.72 
 
 
573 aa  404  1e-111  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  40.14 
 
 
565 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  39.37 
 
 
576 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  39.65 
 
 
588 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  40.97 
 
 
564 aa  396  1e-109  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  40.94 
 
 
565 aa  399  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  38.18 
 
 
584 aa  395  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  40.42 
 
 
564 aa  393  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  35.31 
 
 
570 aa  394  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  42.44 
 
 
596 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  39.58 
 
 
565 aa  392  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  40.35 
 
 
603 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  41.52 
 
 
573 aa  386  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  39.86 
 
 
601 aa  382  1e-104  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  33.5 
 
 
576 aa  364  3e-99  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  37.01 
 
 
566 aa  360  5e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  40.29 
 
 
558 aa  357  3.9999999999999996e-97  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  42.91 
 
 
518 aa  349  6e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  37.95 
 
 
595 aa  345  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  37.5 
 
 
551 aa  343  4e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  35.64 
 
 
551 aa  342  1e-92  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  37.54 
 
 
601 aa  340  4e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  40.77 
 
 
572 aa  338  1.9999999999999998e-91  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1778  adenine deaminase  39.43 
 
 
567 aa  334  2e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  35.34 
 
 
553 aa  333  7.000000000000001e-90  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  39.89 
 
 
555 aa  332  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  36.72 
 
 
588 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0272837 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0420  adenine deaminase  41.56 
 
 
564 aa  328  1.0000000000000001e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  35.23 
 
 
588 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  36.72 
 
 
588 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  36.72 
 
 
569 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  36.53 
 
 
588 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  36.53 
 
 
588 aa  327  3e-88  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  36.53 
 
 
588 aa  327  3e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  36.53 
 
 
588 aa  327  4.0000000000000003e-88  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  32.75 
 
 
568 aa  327  5e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  36.53 
 
 
588 aa  326  7e-88  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0418  adenine deaminase  36.27 
 
 
551 aa  325  1e-87  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  37.33 
 
 
545 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  36.02 
 
 
597 aa  315  1.9999999999999998e-84  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  34.85 
 
 
542 aa  312  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.101601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  36.06 
 
 
608 aa  311  2e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  36.65 
 
 
593 aa  304  4.0000000000000003e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  36.17 
 
 
595 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4610  adenine deaminase  36.83 
 
 
593 aa  291  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  30.27 
 
 
548 aa  291  2e-77  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  38.3 
 
 
606 aa  287  4e-76  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  38.07 
 
 
595 aa  286  9e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0932  adenine deaminase  32.17 
 
 
596 aa  283  5.000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  36.84 
 
 
598 aa  281  3e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  28.25 
 
 
571 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  30.7 
 
 
567 aa  274  3e-72  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  34.3 
 
 
601 aa  271  2.9999999999999997e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  35.3 
 
 
582 aa  262  2e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3431  adenine deaminase  35.56 
 
 
601 aa  256  8e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  36.05 
 
 
601 aa  254  3e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  32.82 
 
 
600 aa  254  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3740  Adenine deaminase  35.04 
 
 
601 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  34.52 
 
 
599 aa  246  9.999999999999999e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  33.33 
 
 
600 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  34.7 
 
 
564 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1082  adenine deaminase  33.11 
 
 
600 aa  234  3e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4006  Adenine deaminase  32.32 
 
 
598 aa  231  3e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275128  normal  0.23839 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  33.33 
 
 
623 aa  225  1e-57  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  31.83 
 
 
594 aa  224  3e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  32.72 
 
 
641 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2826  Adenine deaminase  28.67 
 
 
592 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0973  Adenine deaminase  28.4 
 
 
592 aa  178  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.796039  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1744  adenine deaminase  29.62 
 
 
588 aa  160  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.454715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1142  Adenine deaminase  27.01 
 
 
581 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2818  adenine deaminase  25.89 
 
 
584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3032  adenine deaminase  25.89 
 
 
584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3026  putative adenine deaminase  26.07 
 
 
584 aa  142  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  25.9 
 
 
584 aa  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2753  adenine deaminase  25.73 
 
 
589 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.584086  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0266  Adenine deaminase  25.59 
 
 
581 aa  140  7e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000208487  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  25.48 
 
 
585 aa  140  7e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2823  adenine deaminase  25.39 
 
 
580 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107403  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2218  putative adenine deaminase  25.87 
 
 
584 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000470713 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>