116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3431 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1082  adenine deaminase  75.59 
 
 		 600 aa  853    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  73.58 
 
 		 600 aa  868    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3431  adenine deaminase  100 
 
 		 601 aa  1192    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  66.22 
 
 		 601 aa  798    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  91.51 
 
 		 601 aa  1054    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3740  Adenine deaminase  99 
 
 		 601 aa  1181    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  75.08 
 
 		 599 aa  875    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4006  Adenine deaminase  75.17 
 
 		 598 aa  871    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275128  normal  0.23839 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  36.38 
 
 		 596 aa  327  4.0000000000000003e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  35.02 
 
 		 603 aa  325  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  36.2 
 
 		 595 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  34.43 
 
 		 601 aa  298  2e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  32.71 
 
 		 584 aa  295  2e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  34.83 
 
 		 601 aa  293  7e-78  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  35.46 
 
 		 567 aa  291  3e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  33.5 
 
 		 571 aa  288  2.9999999999999996e-76  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  33.33 
 
 		 571 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  34.88 
 
 		 597 aa  284  3.0000000000000004e-75  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  33 
 
 		 571 aa  283  5.000000000000001e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  33.28 
 
 		 588 aa  283  9e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  30.63 
 
 		 574 aa  283  9e-75  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  37.41 
 
 		 564 aa  281  3e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  38.66 
 
 		 606 aa  280  5e-74  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  35.9 
 
 		 581 aa  276  7e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  36.01 
 
 		 565 aa  273  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  33 
 
 		 581 aa  271  2.9999999999999997e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  35.31 
 
 		 573 aa  270  5e-71  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.489657 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  33.5 
 
 		 564 aa  265  2e-69  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  33.45 
 
 		 608 aa  262  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  34.01 
 
 		 565 aa  261  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  33.89 
 
 		 565 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  29.36 
 
 		 570 aa  260  5.0000000000000005e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  34.31 
 
 		 565 aa  259  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  32.77 
 
 		 565 aa  259  1e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  34.66 
 
 		 575 aa  256  6e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  32.65 
 
 		 563 aa  256  7e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  32.78 
 
 		 613 aa  256  8e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  35.57 
 
 		 573 aa  256  9e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  33.56 
 
 		 565 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  35.19 
 
 		 569 aa  255  2.0000000000000002e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  31.3 
 
 		 576 aa  255  2.0000000000000002e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  33.39 
 
 		 565 aa  254  3e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  32.26 
 
 		 581 aa  254  4.0000000000000004e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  31.11 
 
 		 566 aa  248  3e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  28.23 
 
 		 568 aa  247  4.9999999999999997e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  31.61 
 
 		 553 aa  244  3.9999999999999997e-63  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  28.38 
 
 		 576 aa  243  7.999999999999999e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  33.84 
 
 		 564 aa  240  5.999999999999999e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  33.75 
 
 		 555 aa  239  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  32.76 
 
 		 598 aa  236  9e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  33.45 
 
 		 570 aa  235  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  31.82 
 
 		 551 aa  234  5e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4610  adenine deaminase  35.32 
 
 		 593 aa  229  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  32.61 
 
 		 576 aa  226  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  31.78 
 
 		 588 aa  224  4e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  34.23 
 
 		 572 aa  223  7e-57  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  34.39 
 
 		 595 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  34.66 
 
 		 593 aa  223  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  30.85 
 
 		 588 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0272837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  33.09 
 
 		 569 aa  219  1e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  30.89 
 
 		 545 aa  218  2.9999999999999998e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  32.08 
 
 		 588 aa  217  4e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  31.73 
 
 		 588 aa  217  5e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  31.73 
 
 		 588 aa  217  5e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  32.08 
 
 		 588 aa  217  5e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  31.73 
 
 		 588 aa  217  5e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  32.85 
 
 		 588 aa  217  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  31.71 
 
 		 595 aa  217  5.9999999999999996e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  28.74 
 
 		 567 aa  211  3e-53  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  31.95 
 
 		 518 aa  210  6e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  26.56 
 
 		 571 aa  209  1e-52  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  32.93 
 
 		 558 aa  206  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  30.3 
 
 		 551 aa  204  3e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  26.36 
 
 		 548 aa  203  9e-51  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  31.15 
 
 		 573 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  27.26 
 
 		 568 aa  201  5e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  33.04 
 
 		 564 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0932  adenine deaminase  27.96 
 
 		 596 aa  195  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  30.34 
 
 		 582 aa  190  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0418  adenine deaminase  29.31 
 
 		 551 aa  189  1e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  29.03 
 
 		 542 aa  189  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.101601 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  30.38 
 
 		 600 aa  188  3e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0420  adenine deaminase  32.66 
 
 		 564 aa  184  4.0000000000000006e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  29.05 
 
 		 594 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1778  adenine deaminase  32.12 
 
 		 567 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  29.98 
 
 		 623 aa  166  2.0000000000000002e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  31.35 
 
 		 641 aa  163  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1744  adenine deaminase  29.98 
 
 		 588 aa  141  3.9999999999999997e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.454715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2826  Adenine deaminase  26.97 
 
 		 592 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0973  Adenine deaminase  24.71 
 
 		 592 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.796039  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1142  Adenine deaminase  24.87 
 
 		 581 aa  118  3.9999999999999997e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1471  adenine deaminase  24.55 
 
 		 595 aa  106  1e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0104805  normal  0.148633 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0266  Adenine deaminase  22.95 
 
 		 581 aa  92  3e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000208487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2219  putative AdeC3 adenine deaminase  35.44 
 
 		 257 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299689  hitchhiker  0.00659238 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2218  putative adenine deaminase  21.38 
 
 		 584 aa  81.3  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000470713 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2823  adenine deaminase  21.11 
 
 		 580 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107403  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0835  amidohydrolase  30.74 
 
 		 628 aa  73.2  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  20 
 
 		 585 aa  71.6  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  20.95 
 
 		 584 aa  71.2  0.00000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3063  putative adenine deaminase  20.1 
 
 		 582 aa  68.2  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>