190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_3297 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  74.69 
 
 		 581 aa  829    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  62.1 
 
 		 581 aa  708    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  64.82 
 
 		 565 aa  738    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  63.21 
 
 		 564 aa  716    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  86.5 
 
 		 565 aa  975    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  67.26 
 
 		 573 aa  731    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  64.06 
 
 		 565 aa  733    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  65 
 
 		 565 aa  740    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  86.83 
 
 		 565 aa  975    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  65.47 
 
 		 565 aa  735    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  74.69 
 
 		 613 aa  828    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  63.48 
 
 		 564 aa  710    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  85.03 
 
 		 565 aa  969    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  75.4 
 
 		 563 aa  842    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  100 
 
 		 564 aa  1143    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  45.24 
 
 		 573 aa  480  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.489657 
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  39.25 
 
 		 571 aa  437  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  43.46 
 
 		 567 aa  429  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  38.72 
 
 		 571 aa  431  1e-119  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  39.29 
 
 		 570 aa  427  1e-118  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  40.03 
 
 		 576 aa  423  1e-117  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  38.04 
 
 		 568 aa  423  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  39.93 
 
 		 581 aa  417  9.999999999999999e-116  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  41.65 
 
 		 575 aa  412  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  38.69 
 
 		 574 aa  413  1e-114  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  40.71 
 
 		 588 aa  411  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  40.71 
 
 		 588 aa  411  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  40.71 
 
 		 588 aa  411  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  40.71 
 
 		 588 aa  410  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  40.71 
 
 		 588 aa  411  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  38.19 
 
 		 571 aa  410  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  40.43 
 
 		 588 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0272837 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  40.54 
 
 		 569 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  40.36 
 
 		 588 aa  406  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  40.54 
 
 		 588 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  40.8 
 
 		 570 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  41.02 
 
 		 569 aa  405  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  39.96 
 
 		 576 aa  394  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  36.45 
 
 		 566 aa  382  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  42.75 
 
 		 518 aa  381  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  39.05 
 
 		 551 aa  377  1e-103  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  41.42 
 
 		 558 aa  375  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  35.73 
 
 		 576 aa  374  1e-102  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  38.57 
 
 		 584 aa  373  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  37.39 
 
 		 596 aa  356  5e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  37.65 
 
 		 595 aa  348  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  39.18 
 
 		 572 aa  342  9e-93  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1778  adenine deaminase  37.66 
 
 		 567 aa  340  4e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  39.48 
 
 		 545 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  37.17 
 
 		 603 aa  339  9e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  35.15 
 
 		 553 aa  336  7e-91  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  37.74 
 
 		 601 aa  335  1e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  34.22 
 
 		 573 aa  333  6e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  35.04 
 
 		 601 aa  323  4e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  39.15 
 
 		 551 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  35.8 
 
 		 597 aa  317  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  34.62 
 
 		 588 aa  314  2.9999999999999996e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0420  adenine deaminase  35.59 
 
 		 564 aa  308  1.0000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  36.5 
 
 		 555 aa  303  6.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0418  adenine deaminase  35.9 
 
 		 551 aa  303  8.000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  35.75 
 
 		 608 aa  302  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  35.74 
 
 		 542 aa  296  6e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.101601 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  33.33 
 
 		 548 aa  291  2e-77  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0932  adenine deaminase  33.83 
 
 		 596 aa  286  7e-76  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  37.05 
 
 		 564 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  33.45 
 
 		 593 aa  274  3e-72  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  31.32 
 
 		 568 aa  271  2e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4610  adenine deaminase  33.86 
 
 		 593 aa  270  5e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  31.38 
 
 		 571 aa  268  2e-70  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  34.15 
 
 		 595 aa  266  7e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  37.88 
 
 		 606 aa  266  8e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  34.02 
 
 		 600 aa  256  5e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  33.68 
 
 		 601 aa  254  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3431  adenine deaminase  33.33 
 
 		 601 aa  249  1e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4006  Adenine deaminase  33 
 
 		 598 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275128  normal  0.23839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  32.66 
 
 		 601 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3740  Adenine deaminase  33.22 
 
 		 601 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  31.84 
 
 		 598 aa  245  9.999999999999999e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  30.36 
 
 		 567 aa  238  2e-61  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  32.58 
 
 		 582 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1082  adenine deaminase  33.62 
 
 		 600 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  31.83 
 
 		 600 aa  234  3e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  32.02 
 
 		 599 aa  234  4.0000000000000004e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  30.73 
 
 		 595 aa  229  1e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  30.44 
 
 		 623 aa  213  7e-54  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0973  Adenine deaminase  28.57 
 
 		 592 aa  196  7e-49  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.796039  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  26.68 
 
 		 594 aa  193  9e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  29.34 
 
 		 641 aa  192  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2826  Adenine deaminase  27.67 
 
 		 592 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0266  Adenine deaminase  25 
 
 		 581 aa  157  7e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000208487  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1142  Adenine deaminase  24.56 
 
 		 581 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1744  adenine deaminase  27.1 
 
 		 588 aa  140  8.999999999999999e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.454715  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2823  adenine deaminase  23.86 
 
 		 580 aa  130  9.000000000000001e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107403  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  24.69 
 
 		 585 aa  128  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  23.94 
 
 		 584 aa  127  5e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2218  putative adenine deaminase  24.42 
 
 		 584 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000470713 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3063  putative adenine deaminase  23.88 
 
 		 582 aa  125  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2818  adenine deaminase  23.76 
 
 		 584 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3032  adenine deaminase  23.76 
 
 		 584 aa  125  3e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2753  adenine deaminase  24.3 
 
 		 589 aa  124  4e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.584086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>