176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2201 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  100 
 
 		 594 aa  1202    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2220  putative AdeC4 adenine deaminase  56.29 
 
 		 318 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.424398  hitchhiker  0.00429116 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0973  Adenine deaminase  35.22 
 
 		 592 aa  312  1e-83  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.796039  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2826  Adenine deaminase  33.33 
 
 		 592 aa  293  4e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  31.5 
 
 		 603 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  34.3 
 
 		 596 aa  281  3e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  29.11 
 
 		 571 aa  279  9e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  32.54 
 
 		 597 aa  276  9e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  31.52 
 
 		 601 aa  273  5.000000000000001e-72  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  32.42 
 
 		 595 aa  266  8.999999999999999e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1744  adenine deaminase  35.4 
 
 		 588 aa  265  2e-69  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.454715  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  29.61 
 
 		 588 aa  257  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  31.01 
 
 		 601 aa  247  4.9999999999999997e-64  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  31.93 
 
 		 606 aa  238  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2219  putative AdeC3 adenine deaminase  57.73 
 
 		 257 aa  237  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299689  hitchhiker  0.00659238 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0266  Adenine deaminase  30.42 
 
 		 581 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000208487  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  30.38 
 
 		 608 aa  235  2.0000000000000002e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  30.58 
 
 		 567 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  28.99 
 
 		 571 aa  232  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  29.97 
 
 		 576 aa  231  4e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  28.23 
 
 		 571 aa  226  7e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  31.83 
 
 		 581 aa  224  3e-57  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  31.6 
 
 		 581 aa  223  6e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  28.45 
 
 		 585 aa  217  5e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  26.11 
 
 		 574 aa  217  5.9999999999999996e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  31.49 
 
 		 573 aa  215  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.489657 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  28.06 
 
 		 571 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  27.52 
 
 		 584 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2753  adenine deaminase  28.98 
 
 		 589 aa  211  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.584086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2218  putative adenine deaminase  29.73 
 
 		 584 aa  211  3e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000470713 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3063  putative adenine deaminase  28.6 
 
 		 582 aa  210  5e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154725  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  24.46 
 
 		 570 aa  210  5e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  28.6 
 
 		 584 aa  210  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  30.74 
 
 		 575 aa  209  1e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  31.83 
 
 		 582 aa  208  2e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3026  putative adenine deaminase  28.62 
 
 		 584 aa  208  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2818  adenine deaminase  28.45 
 
 		 584 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3032  adenine deaminase  28.45 
 
 		 584 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  30.67 
 
 		 565 aa  203  8e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  30.48 
 
 		 565 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  31.18 
 
 		 565 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  31 
 
 		 565 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  30.94 
 
 		 564 aa  201  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  30.29 
 
 		 570 aa  200  7.999999999999999e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2823  adenine deaminase  27.9 
 
 		 580 aa  199  9e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1142  Adenine deaminase  29.54 
 
 		 581 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  29.04 
 
 		 581 aa  195  2e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  28.35 
 
 		 588 aa  195  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  29.28 
 
 		 613 aa  195  2e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  29.02 
 
 		 563 aa  194  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  26.86 
 
 		 566 aa  194  6e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  28.18 
 
 		 588 aa  193  9e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0272837 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  29.55 
 
 		 576 aa  192  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  29.62 
 
 		 600 aa  192  2e-47  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  23.91 
 
 		 576 aa  192  2e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  28.01 
 
 		 588 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  28.01 
 
 		 588 aa  191  4e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  28.01 
 
 		 588 aa  191  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  28.01 
 
 		 588 aa  190  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  28.01 
 
 		 588 aa  190  5.999999999999999e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  28.01 
 
 		 588 aa  190  8e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  27.71 
 
 		 569 aa  186  9e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  29.04 
 
 		 564 aa  186  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  28.79 
 
 		 573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  29.28 
 
 		 569 aa  183  7e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  26.68 
 
 		 564 aa  181  4e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  28.11 
 
 		 565 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  27.44 
 
 		 565 aa  176  9.999999999999999e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  27.72 
 
 		 565 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  26.05 
 
 		 545 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  29.37 
 
 		 573 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4006  Adenine deaminase  29.14 
 
 		 598 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275128  normal  0.23839 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  30.65 
 
 		 572 aa  174  5e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0420  adenine deaminase  31.73 
 
 		 564 aa  173  7.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  31.26 
 
 		 593 aa  173  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  31.89 
 
 		 595 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  22.86 
 
 		 548 aa  172  2e-41  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  29.28 
 
 		 599 aa  172  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  26.48 
 
 		 551 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  28.52 
 
 		 601 aa  167  4e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0418  adenine deaminase  25.35 
 
 		 551 aa  167  5e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  25.04 
 
 		 551 aa  167  5.9999999999999996e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  27.57 
 
 		 564 aa  166  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  29.02 
 
 		 555 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  28.24 
 
 		 623 aa  163  9e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1082  adenine deaminase  29.1 
 
 		 600 aa  162  1e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3740  Adenine deaminase  29.22 
 
 		 601 aa  162  1e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  30.07 
 
 		 601 aa  162  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3431  adenine deaminase  29.05 
 
 		 601 aa  160  8e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  23.92 
 
 		 568 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  29.51 
 
 		 595 aa  159  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  24.48 
 
 		 553 aa  157  4e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4610  adenine deaminase  30 
 
 		 593 aa  156  9e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  28.44 
 
 		 518 aa  156  1e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  28.36 
 
 		 641 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  26.58 
 
 		 558 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  28.43 
 
 		 600 aa  153  7e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  28.22 
 
 		 598 aa  153  7e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  25.05 
 
 		 542 aa  152  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.101601 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  24.22 
 
 		 567 aa  149  1.0000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>