120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_1142 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  BAS2818  adenine deaminase  54.96 
 
 
584 aa  680    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  55.3 
 
 
584 aa  682    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2753  adenine deaminase  55.92 
 
 
589 aa  682    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.584086  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3032  adenine deaminase  54.96 
 
 
584 aa  680    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1142  Adenine deaminase  100 
 
 
581 aa  1201    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2823  adenine deaminase  55.44 
 
 
580 aa  674    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3063  putative adenine deaminase  55.83 
 
 
582 aa  686    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154725  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  56.09 
 
 
585 aa  684    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2218  putative adenine deaminase  55.09 
 
 
584 aa  674    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000470713 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3026  putative adenine deaminase  54.96 
 
 
584 aa  680    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0266  Adenine deaminase  73.84 
 
 
581 aa  927    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000208487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0973  Adenine deaminase  36.13 
 
 
592 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.796039  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2826  Adenine deaminase  31.18 
 
 
592 aa  294  3e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1744  adenine deaminase  35.37 
 
 
588 aa  293  6e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.454715  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  29.59 
 
 
594 aa  208  2e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  27.35 
 
 
575 aa  178  2e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  29.76 
 
 
565 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  28.91 
 
 
565 aa  171  4e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  27.26 
 
 
581 aa  166  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  27.96 
 
 
565 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  24.87 
 
 
601 aa  160  4e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  27.24 
 
 
582 aa  158  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  23.41 
 
 
603 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  26.6 
 
 
588 aa  156  8e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  24.91 
 
 
568 aa  156  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  23.85 
 
 
574 aa  155  2e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  25.13 
 
 
571 aa  155  2e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  26.42 
 
 
569 aa  155  2e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  27.46 
 
 
565 aa  155  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  26.25 
 
 
588 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  26.25 
 
 
588 aa  152  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  26.25 
 
 
588 aa  152  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  26.11 
 
 
588 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0272837 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  26.25 
 
 
588 aa  152  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  24.53 
 
 
584 aa  151  3e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  25.7 
 
 
567 aa  151  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  26.58 
 
 
588 aa  151  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  23.86 
 
 
571 aa  151  4e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  24.73 
 
 
551 aa  150  4e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  24.21 
 
 
571 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  27.01 
 
 
581 aa  149  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  22.63 
 
 
597 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  24.65 
 
 
595 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  27.08 
 
 
564 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  26.08 
 
 
588 aa  147  4.0000000000000006e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  23.85 
 
 
601 aa  147  5e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  23.02 
 
 
553 aa  147  8.000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  23.33 
 
 
596 aa  144  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  24.91 
 
 
576 aa  144  4e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  25.21 
 
 
588 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  23.94 
 
 
571 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  26.29 
 
 
573 aa  141  3e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  26.66 
 
 
565 aa  140  4.999999999999999e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  26.35 
 
 
573 aa  140  8.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  25.52 
 
 
563 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  24.56 
 
 
564 aa  139  1e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  26.15 
 
 
573 aa  139  2e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.489657 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  24.66 
 
 
570 aa  138  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  24.65 
 
 
576 aa  138  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  25.86 
 
 
613 aa  137  5e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  25.69 
 
 
581 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  25.34 
 
 
564 aa  134  5e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  25.13 
 
 
565 aa  134  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  24.27 
 
 
608 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  24.96 
 
 
566 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  25.56 
 
 
606 aa  131  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  26.19 
 
 
569 aa  130  8.000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  25.52 
 
 
564 aa  130  9.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  25.31 
 
 
565 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  26.27 
 
 
572 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  24.88 
 
 
600 aa  128  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  22.61 
 
 
568 aa  127  6e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4006  Adenine deaminase  24.48 
 
 
598 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275128  normal  0.23839 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  27.91 
 
 
518 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  25.04 
 
 
601 aa  123  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  22.3 
 
 
548 aa  122  9.999999999999999e-27  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  25 
 
 
558 aa  120  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  24.04 
 
 
599 aa  117  5e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  26.01 
 
 
570 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2220  putative AdeC4 adenine deaminase  30.5 
 
 
318 aa  114  5e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.424398  hitchhiker  0.00429116 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  23.75 
 
 
576 aa  114  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  25.2 
 
 
598 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3431  adenine deaminase  25.04 
 
 
601 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3740  Adenine deaminase  24.87 
 
 
601 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1082  adenine deaminase  24.61 
 
 
600 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  24.33 
 
 
601 aa  109  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  22.61 
 
 
551 aa  108  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1778  adenine deaminase  26.04 
 
 
567 aa  108  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  23.66 
 
 
600 aa  107  8e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  22.86 
 
 
567 aa  106  9e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  22.24 
 
 
545 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  25.23 
 
 
595 aa  105  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  23.3 
 
 
555 aa  103  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0932  adenine deaminase  20.98 
 
 
596 aa  100  7e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  24.18 
 
 
641 aa  100  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  21.2 
 
 
542 aa  98.6  3e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.101601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0420  adenine deaminase  25.39 
 
 
564 aa  97.1  8e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  24.95 
 
 
623 aa  96.7  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  24.14 
 
 
595 aa  95.1  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1471  adenine deaminase  22.15 
 
 
595 aa  94.7  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0104805  normal  0.148633 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>