181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_1744 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_1744  adenine deaminase  100 
 
 
588 aa  1144    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.454715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2826  Adenine deaminase  51.22 
 
 
592 aa  568  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0973  Adenine deaminase  41.16 
 
 
592 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.796039  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0266  Adenine deaminase  34.87 
 
 
581 aa  335  1e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000208487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2218  putative adenine deaminase  32.19 
 
 
584 aa  309  8e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000470713 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  32.08 
 
 
584 aa  307  4.0000000000000004e-82  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2753  adenine deaminase  32.08 
 
 
589 aa  306  8.000000000000001e-82  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.584086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3063  putative adenine deaminase  32.19 
 
 
582 aa  305  1.0000000000000001e-81  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2823  adenine deaminase  32.94 
 
 
580 aa  306  1.0000000000000001e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3026  putative adenine deaminase  31.9 
 
 
584 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1142  Adenine deaminase  35.37 
 
 
581 aa  302  9e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2818  adenine deaminase  31.73 
 
 
584 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3032  adenine deaminase  31.73 
 
 
584 aa  301  2e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  31.97 
 
 
585 aa  301  3e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  35.4 
 
 
594 aa  284  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  35.45 
 
 
606 aa  253  8.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  31.97 
 
 
596 aa  246  9.999999999999999e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  32.01 
 
 
597 aa  243  5e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  28.96 
 
 
603 aa  241  4e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  26.69 
 
 
571 aa  236  6e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  31.34 
 
 
601 aa  235  2.0000000000000002e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  31.9 
 
 
595 aa  229  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  31.24 
 
 
567 aa  214  4.9999999999999996e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  28.72 
 
 
571 aa  211  2e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  28.65 
 
 
571 aa  209  8e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  30.1 
 
 
608 aa  209  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  28.06 
 
 
576 aa  208  3e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4610  adenine deaminase  33.28 
 
 
593 aa  207  3e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  31.33 
 
 
573 aa  207  5e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.489657 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  31.78 
 
 
575 aa  206  8e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  28.81 
 
 
588 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  27.66 
 
 
584 aa  201  3e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  27.93 
 
 
601 aa  200  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  25.13 
 
 
574 aa  195  2e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  28.06 
 
 
571 aa  193  7e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  30.52 
 
 
581 aa  189  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  25.17 
 
 
570 aa  187  6e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  29.61 
 
 
593 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  31.39 
 
 
582 aa  181  4.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  28.96 
 
 
600 aa  177  4e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  24.11 
 
 
576 aa  175  1.9999999999999998e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  29.32 
 
 
573 aa  173  7.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  32.09 
 
 
564 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  30.87 
 
 
598 aa  173  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  29.62 
 
 
581 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  28.06 
 
 
564 aa  172  2e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  29.06 
 
 
565 aa  170  6e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  29.06 
 
 
565 aa  169  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  29.6 
 
 
595 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  29.08 
 
 
572 aa  168  2e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  29.66 
 
 
569 aa  168  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  29.56 
 
 
595 aa  168  2.9999999999999998e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  29.4 
 
 
570 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  30.96 
 
 
565 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  29.31 
 
 
564 aa  165  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0420  adenine deaminase  33.96 
 
 
564 aa  164  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  30.03 
 
 
558 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  23.33 
 
 
568 aa  160  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  27.7 
 
 
613 aa  159  9e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  26.79 
 
 
563 aa  160  9e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  27.26 
 
 
588 aa  159  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  27.26 
 
 
588 aa  158  3e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0272837 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  28.05 
 
 
581 aa  157  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  28.67 
 
 
565 aa  156  8e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  27.94 
 
 
565 aa  156  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  23.61 
 
 
553 aa  156  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  24.78 
 
 
551 aa  156  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  24.17 
 
 
566 aa  156  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  27.97 
 
 
565 aa  155  2e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  26.87 
 
 
588 aa  155  2e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  26.7 
 
 
588 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  26.7 
 
 
588 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  26.7 
 
 
588 aa  155  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  26.7 
 
 
588 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  28.14 
 
 
601 aa  152  1e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  30.4 
 
 
555 aa  152  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  26.77 
 
 
569 aa  151  3e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  26.53 
 
 
588 aa  150  5e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  27.8 
 
 
565 aa  150  6e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  26.8 
 
 
564 aa  149  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  30.13 
 
 
518 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1778  adenine deaminase  28.92 
 
 
567 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  28.24 
 
 
573 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  24.52 
 
 
551 aa  147  6e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  27.13 
 
 
576 aa  144  5e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  28.97 
 
 
623 aa  142  1.9999999999999998e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1082  adenine deaminase  29.12 
 
 
600 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  27.64 
 
 
600 aa  141  3e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  29.14 
 
 
599 aa  140  7.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4006  Adenine deaminase  26.89 
 
 
598 aa  138  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275128  normal  0.23839 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3740  Adenine deaminase  29.98 
 
 
601 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2220  putative AdeC4 adenine deaminase  32.08 
 
 
318 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.424398  hitchhiker  0.00429116 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3431  adenine deaminase  29.98 
 
 
601 aa  137  7.000000000000001e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1471  adenine deaminase  25.13 
 
 
595 aa  125  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0104805  normal  0.148633 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  26.53 
 
 
641 aa  125  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0932  adenine deaminase  21.18 
 
 
596 aa  124  4e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  27.9 
 
 
601 aa  123  7e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  23.72 
 
 
545 aa  118  3.9999999999999997e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  19.44 
 
 
548 aa  117  3.9999999999999997e-25  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  22.27 
 
 
542 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.101601 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>