110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2220 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_2220  putative AdeC4 adenine deaminase  100 
 
 		 318 aa  649    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.424398  hitchhiker  0.00429116 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  56.29 
 
 		 594 aa  377  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  36.45 
 
 		 596 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  28.25 
 
 		 571 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  29.88 
 
 		 603 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  30.09 
 
 		 588 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0973  Adenine deaminase  33.84 
 
 		 592 aa  149  7e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.796039  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  27.91 
 
 		 601 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  26.75 
 
 		 571 aa  132  7.999999999999999e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  25.8 
 
 		 571 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  26.46 
 
 		 584 aa  130  3e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1744  adenine deaminase  32.08 
 
 		 588 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.454715  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  28.71 
 
 		 597 aa  127  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  30.52 
 
 		 581 aa  127  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  28.06 
 
 		 601 aa  127  2.0000000000000002e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  28.09 
 
 		 570 aa  125  7e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  31.96 
 
 		 565 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  30.06 
 
 		 567 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  26.43 
 
 		 571 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  27.81 
 
 		 595 aa  124  2e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  29.65 
 
 		 564 aa  123  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  28.57 
 
 		 613 aa  118  9.999999999999999e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  27.71 
 
 		 563 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  28.57 
 
 		 581 aa  117  3e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  30.57 
 
 		 565 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  27.81 
 
 		 585 aa  117  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  27.62 
 
 		 573 aa  117  3e-25  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2753  adenine deaminase  27.1 
 
 		 589 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.584086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3063  putative adenine deaminase  27.45 
 
 		 582 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154725  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  30.57 
 
 		 565 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3026  putative adenine deaminase  27.78 
 
 		 584 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  27.78 
 
 		 584 aa  115  7.999999999999999e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  28.66 
 
 		 573 aa  115  8.999999999999998e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.489657 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  27.96 
 
 		 608 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1142  Adenine deaminase  30.5 
 
 		 581 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2823  adenine deaminase  28.25 
 
 		 580 aa  113  5e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107403  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  33.72 
 
 		 595 aa  113  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2218  putative adenine deaminase  28.44 
 
 		 584 aa  112  6e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000470713 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  28.48 
 
 		 582 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  29.56 
 
 		 600 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  26.63 
 
 		 576 aa  112  9e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2818  adenine deaminase  27.45 
 
 		 584 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3032  adenine deaminase  27.45 
 
 		 584 aa  112  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  22.98 
 
 		 574 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  29.81 
 
 		 575 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  28.75 
 
 		 606 aa  110  3e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1778  adenine deaminase  29.19 
 
 		 567 aa  110  3e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  27.74 
 
 		 570 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  31.06 
 
 		 564 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  29.71 
 
 		 565 aa  107  2e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  26.42 
 
 		 566 aa  107  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  26.43 
 
 		 588 aa  106  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  26.43 
 
 		 588 aa  106  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  26.43 
 
 		 588 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  26.43 
 
 		 588 aa  106  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  28.26 
 
 		 576 aa  106  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  26.43 
 
 		 588 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  33.98 
 
 		 593 aa  105  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  26.11 
 
 		 588 aa  105  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  26.43 
 
 		 588 aa  104  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  25.8 
 
 		 588 aa  104  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0272837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  27.04 
 
 		 565 aa  104  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  29.87 
 
 		 573 aa  104  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  26.11 
 
 		 569 aa  103  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2826  Adenine deaminase  27.85 
 
 		 592 aa  102  9e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  26.18 
 
 		 581 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0266  Adenine deaminase  27.9 
 
 		 581 aa  100  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000208487  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  25.48 
 
 		 564 aa  100  4e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  27.6 
 
 		 564 aa  99.8  5e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4610  adenine deaminase  30.88 
 
 		 593 aa  99.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  28.43 
 
 		 565 aa  99.8  6e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  26.42 
 
 		 565 aa  99.4  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  22.47 
 
 		 548 aa  97.1  3e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  29.24 
 
 		 569 aa  97.1  3e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  31.33 
 
 		 572 aa  94  3e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  24.84 
 
 		 576 aa  92.4  8e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  27.18 
 
 		 558 aa  90.9  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  25.15 
 
 		 598 aa  89.4  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  23.82 
 
 		 551 aa  88.2  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  21.09 
 
 		 568 aa  88.2  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  27.3 
 
 		 623 aa  86.3  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  26.25 
 
 		 567 aa  84.3  0.000000000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  26.79 
 
 		 555 aa  83.6  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  28.95 
 
 		 518 aa  83.2  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  25.16 
 
 		 545 aa  83.2  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0418  adenine deaminase  24.84 
 
 		 551 aa  80.5  0.00000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  23.1 
 
 		 568 aa  79  0.00000000000009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  24.22 
 
 		 551 aa  77.4  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  21.63 
 
 		 553 aa  76.3  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5687  adenine deaminase  28.81 
 
 		 667 aa  73.9  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.354832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  25.45 
 
 		 641 aa  73.6  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  21.81 
 
 		 542 aa  73.2  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.101601 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0932  adenine deaminase  22.85 
 
 		 596 aa  72  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  26.3 
 
 		 595 aa  71.2  0.00000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0835  amidohydrolase  34.68 
 
 		 628 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  24.7 
 
 		 599 aa  67.4  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1471  adenine deaminase  22.3 
 
 		 595 aa  65.9  0.0000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0104805  normal  0.148633 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  24.63 
 
 		 600 aa  65.9  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  30.88 
 
 		 601 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  25.33 
 
 		 601 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>