124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5424 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1082  adenine deaminase  84.92 
 
 		 600 aa  1000    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  81.24 
 
 		 600 aa  964    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3431  adenine deaminase  75.08 
 
 		 601 aa  845    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  68.72 
 
 		 601 aa  840    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  75.59 
 
 		 601 aa  848    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3740  Adenine deaminase  74.75 
 
 		 601 aa  846    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  100 
 
 		 599 aa  1210    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4006  Adenine deaminase  83.36 
 
 		 598 aa  993    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275128  normal  0.23839 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  35.31 
 
 		 596 aa  332  1e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  35.07 
 
 		 603 aa  331  2e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  35.18 
 
 		 595 aa  301  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  32.67 
 
 		 584 aa  286  8e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  33 
 
 		 601 aa  281  2e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  33 
 
 		 588 aa  280  6e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  33.9 
 
 		 571 aa  279  8e-74  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  33.67 
 
 		 601 aa  276  5e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  33.56 
 
 		 597 aa  277  5e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  36.26 
 
 		 606 aa  273  7e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  33.45 
 
 		 571 aa  273  9e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  32.94 
 
 		 571 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  33.33 
 
 		 608 aa  266  5.999999999999999e-70  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  33.73 
 
 		 567 aa  264  3e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  34.92 
 
 		 575 aa  264  4e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  30.09 
 
 		 574 aa  256  6e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  29.03 
 
 		 570 aa  252  1e-65  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  34.52 
 
 		 581 aa  250  4e-65  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  34.89 
 
 		 569 aa  250  4e-65  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  32.45 
 
 		 573 aa  249  8e-65  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.489657 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  31.66 
 
 		 581 aa  244  5e-63  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  32.82 
 
 		 565 aa  242  1e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  30.05 
 
 		 576 aa  241  2.9999999999999997e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  32.21 
 
 		 565 aa  239  1e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  29.23 
 
 		 568 aa  238  2e-61  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  32.04 
 
 		 565 aa  237  4e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  31.76 
 
 		 563 aa  237  4e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  33.16 
 
 		 564 aa  237  4e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  32.83 
 
 		 613 aa  235  1.0000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  32.22 
 
 		 581 aa  235  2.0000000000000002e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  31.33 
 
 		 551 aa  234  3e-60  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  32.02 
 
 		 564 aa  233  5e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  28.64 
 
 		 571 aa  232  1e-59  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  32.01 
 
 		 553 aa  232  2e-59  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4610  adenine deaminase  34.03 
 
 		 593 aa  232  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  34.25 
 
 		 593 aa  230  7e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  34.83 
 
 		 595 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  29.59 
 
 		 576 aa  226  7e-58  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  30.97 
 
 		 598 aa  226  7e-58  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  32.64 
 
 		 570 aa  226  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  31.73 
 
 		 565 aa  225  2e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  32.15 
 
 		 565 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  32.27 
 
 		 565 aa  221  1.9999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  30.96 
 
 		 565 aa  220  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  30.37 
 
 		 566 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  32.6 
 
 		 572 aa  218  4e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  27.65 
 
 		 567 aa  214  3.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  31.74 
 
 		 555 aa  214  4.9999999999999996e-54  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  30.34 
 
 		 545 aa  211  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  30.02 
 
 		 595 aa  208  2e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  31.22 
 
 		 573 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  30.52 
 
 		 588 aa  205  2e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0272837 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  32.35 
 
 		 518 aa  203  7e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  30.19 
 
 		 588 aa  203  9e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  30.28 
 
 		 569 aa  201  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  29.72 
 
 		 551 aa  200  7e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  30.59 
 
 		 573 aa  200  7e-50  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  27.4 
 
 		 548 aa  199  1.0000000000000001e-49  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0420  adenine deaminase  31.28 
 
 		 564 aa  198  2.0000000000000003e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  26.32 
 
 		 568 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  31.02 
 
 		 564 aa  199  2.0000000000000003e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  30.02 
 
 		 588 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  30.02 
 
 		 588 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  30.02 
 
 		 588 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  30.02 
 
 		 588 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  30.02 
 
 		 588 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  30.02 
 
 		 588 aa  197  6e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  31.29 
 
 		 564 aa  190  8e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  32.9 
 
 		 558 aa  189  1e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  29.83 
 
 		 582 aa  189  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  29.95 
 
 		 576 aa  188  3e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0418  adenine deaminase  28.74 
 
 		 551 aa  187  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  29.19 
 
 		 600 aa  184  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  29.28 
 
 		 594 aa  183  7e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  27.27 
 
 		 542 aa  182  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.101601 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  31.98 
 
 		 623 aa  171  5e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1778  adenine deaminase  28.35 
 
 		 567 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  29.79 
 
 		 641 aa  163  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1744  adenine deaminase  29.14 
 
 		 588 aa  137  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.454715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2826  Adenine deaminase  27.12 
 
 		 592 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0973  Adenine deaminase  24.88 
 
 		 592 aa  127  4.0000000000000003e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.796039  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1471  adenine deaminase  23.83 
 
 		 595 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0104805  normal  0.148633 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0932  adenine deaminase  31.71 
 
 		 596 aa  125  2e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1142  Adenine deaminase  23.87 
 
 		 581 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0266  Adenine deaminase  22.08 
 
 		 581 aa  96.3  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000208487  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2219  putative AdeC3 adenine deaminase  36.2 
 
 		 257 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299689  hitchhiker  0.00659238 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2218  putative adenine deaminase  22.3 
 
 		 584 aa  81.6  0.00000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000470713 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  20.72 
 
 		 585 aa  78.6  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2220  putative AdeC4 adenine deaminase  24.7 
 
 		 318 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.424398  hitchhiker  0.00429116 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  21.67 
 
 		 584 aa  70.1  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2753  adenine deaminase  20.97 
 
 		 589 aa  67.8  0.0000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.584086  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3063  putative adenine deaminase  20.33 
 
 		 582 aa  66.6  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154725  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>