120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1778 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1778  adenine deaminase  100 
 
 		 567 aa  1143    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  58.44 
 
 		 558 aa  604  1.0000000000000001e-171  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  56.78 
 
 		 518 aa  533  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  41.84 
 
 		 571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  41.13 
 
 		 571 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  38.27 
 
 		 568 aa  392  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  41.64 
 
 		 573 aa  392  1e-108  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.489657 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  38.81 
 
 		 576 aa  393  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  41.67 
 
 		 571 aa  391  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  41.36 
 
 		 570 aa  384  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  41.16 
 
 		 576 aa  377  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  41.87 
 
 		 567 aa  371  1e-101  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  41.43 
 
 		 575 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  41.89 
 
 		 564 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  42.7 
 
 		 565 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  38.56 
 
 		 563 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  35.15 
 
 		 574 aa  352  8e-96  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  40.99 
 
 		 569 aa  351  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  38.56 
 
 		 613 aa  351  3e-95  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  40.58 
 
 		 581 aa  348  2e-94  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  38.67 
 
 		 581 aa  347  3e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  34.85 
 
 		 570 aa  345  2e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  39.43 
 
 		 565 aa  343  5e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  39.43 
 
 		 565 aa  343  5e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  35.35 
 
 		 576 aa  341  2e-92  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  36.61 
 
 		 566 aa  340  5e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  38.93 
 
 		 565 aa  335  2e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  39.43 
 
 		 581 aa  334  2e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  40 
 
 		 573 aa  333  5e-90  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  37.66 
 
 		 564 aa  331  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  38.04 
 
 		 565 aa  329  9e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  38.08 
 
 		 565 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  37.9 
 
 		 565 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  39.36 
 
 		 564 aa  327  4.0000000000000003e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  39.03 
 
 		 545 aa  326  7e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  35.46 
 
 		 551 aa  325  2e-87  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0418  adenine deaminase  37.5 
 
 		 551 aa  320  3.9999999999999996e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  38.95 
 
 		 573 aa  319  7.999999999999999e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  35.91 
 
 		 548 aa  318  1e-85  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  35.82 
 
 		 553 aa  310  5.9999999999999995e-83  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  37.13 
 
 		 551 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  36.54 
 
 		 572 aa  301  2e-80  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0420  adenine deaminase  38.17 
 
 		 564 aa  301  3e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  35.71 
 
 		 542 aa  298  1e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.101601 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  35.27 
 
 		 584 aa  292  9e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  34.25 
 
 		 596 aa  285  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  33.62 
 
 		 603 aa  284  4.0000000000000003e-75  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  34.16 
 
 		 588 aa  280  7e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  33.99 
 
 		 588 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  33.99 
 
 		 588 aa  278  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  33.99 
 
 		 588 aa  278  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  33.99 
 
 		 588 aa  278  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  34.46 
 
 		 588 aa  278  3e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  33.8 
 
 		 588 aa  277  4e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  34.34 
 
 		 588 aa  276  9e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0272837 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  33.81 
 
 		 588 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  34.4 
 
 		 569 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  34.32 
 
 		 555 aa  256  7e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  35.35 
 
 		 595 aa  244  3.9999999999999997e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  31.61 
 
 		 601 aa  235  2.0000000000000002e-60  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  33.33 
 
 		 597 aa  233  6e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  32.49 
 
 		 593 aa  231  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  29.32 
 
 		 568 aa  225  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  30.96 
 
 		 601 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0932  adenine deaminase  29.25 
 
 		 596 aa  221  3e-56  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  32.52 
 
 		 608 aa  219  1e-55  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  30.27 
 
 		 567 aa  218  2.9999999999999998e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  30.28 
 
 		 595 aa  215  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  34.41 
 
 		 564 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  31.35 
 
 		 595 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  29.64 
 
 		 598 aa  213  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  33.92 
 
 		 582 aa  213  7e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  33.97 
 
 		 606 aa  211  3e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4610  adenine deaminase  32.78 
 
 		 593 aa  201  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  27.04 
 
 		 571 aa  196  7e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4006  Adenine deaminase  30.89 
 
 		 598 aa  180  8e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275128  normal  0.23839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  30.8 
 
 		 600 aa  172  1e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  31.2 
 
 		 601 aa  171  3e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3740  Adenine deaminase  31.24 
 
 		 601 aa  164  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  28.51 
 
 		 623 aa  160  8e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3431  adenine deaminase  31.93 
 
 		 601 aa  159  9e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  28.35 
 
 		 599 aa  159  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  30.86 
 
 		 601 aa  156  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1082  adenine deaminase  30.59 
 
 		 600 aa  153  1e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  26.8 
 
 		 641 aa  150  9e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  27.8 
 
 		 600 aa  145  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  27.57 
 
 		 594 aa  143  8e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1744  adenine deaminase  28.92 
 
 		 588 aa  130  6e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.454715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2826  Adenine deaminase  24.48 
 
 		 592 aa  117  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2220  putative AdeC4 adenine deaminase  29.19 
 
 		 318 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.424398  hitchhiker  0.00429116 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0266  Adenine deaminase  24.8 
 
 		 581 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000208487  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0973  Adenine deaminase  26.34 
 
 		 592 aa  103  6e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.796039  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1142  Adenine deaminase  26.04 
 
 		 581 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2753  adenine deaminase  24.28 
 
 		 589 aa  100  7e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.584086  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1471  adenine deaminase  24.47 
 
 		 595 aa  99  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0104805  normal  0.148633 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  23.87 
 
 		 584 aa  98.2  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3026  putative adenine deaminase  24.09 
 
 		 584 aa  98.6  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  25 
 
 		 585 aa  97.8  4e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3063  putative adenine deaminase  23.78 
 
 		 582 aa  97.1  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154725  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2818  adenine deaminase  23.91 
 
 		 584 aa  96.3  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>