143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0385 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  63.44 
 
 		 581 aa  688    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  65.02 
 
 		 565 aa  709    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  100 
 
 		 565 aa  1108    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  65.19 
 
 		 565 aa  711    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  65.95 
 
 		 565 aa  700    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  65.19 
 
 		 565 aa  717    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  63.44 
 
 		 613 aa  690    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  65.19 
 
 		 565 aa  713    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  61.74 
 
 		 563 aa  689    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  64.06 
 
 		 564 aa  718    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  63.83 
 
 		 564 aa  674    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  68.62 
 
 		 573 aa  735    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  87.06 
 
 		 564 aa  948    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  68.02 
 
 		 581 aa  751    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  64.96 
 
 		 565 aa  714    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  48.41 
 
 		 573 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.489657 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  41.54 
 
 		 576 aa  437  1e-121  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  40.77 
 
 		 571 aa  434  1e-120  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  40.77 
 
 		 571 aa  433  1e-120  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  39.44 
 
 		 568 aa  423  1e-117  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  43.77 
 
 		 570 aa  415  9.999999999999999e-116  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  45.62 
 
 		 575 aa  415  1e-114  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  40.14 
 
 		 571 aa  411  1e-113  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  37.35 
 
 		 574 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  41.64 
 
 		 581 aa  404  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  37.55 
 
 		 570 aa  404  1e-111  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  41.23 
 
 		 588 aa  402  1e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0272837 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  41.93 
 
 		 588 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  41.93 
 
 		 588 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  41.93 
 
 		 588 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  45.11 
 
 		 569 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  41.93 
 
 		 588 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  41.93 
 
 		 588 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  41.75 
 
 		 588 aa  399  9.999999999999999e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  43.19 
 
 		 567 aa  397  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  41.75 
 
 		 588 aa  397  1e-109  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  40.14 
 
 		 566 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  42.16 
 
 		 569 aa  395  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  43.29 
 
 		 576 aa  389  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  45.16 
 
 		 518 aa  378  1e-103  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  39.72 
 
 		 584 aa  375  1e-102  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  40.38 
 
 		 603 aa  375  1e-102  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  42.01 
 
 		 558 aa  368  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  36.93 
 
 		 551 aa  363  4e-99  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  39.22 
 
 		 596 aa  363  5.0000000000000005e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  36.43 
 
 		 576 aa  360  3e-98  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1778  adenine deaminase  42.7 
 
 		 567 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  40.65 
 
 		 595 aa  353  4e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  36.66 
 
 		 553 aa  347  3e-94  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  38.38 
 
 		 573 aa  342  1e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  37.27 
 
 		 601 aa  341  2e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  39.07 
 
 		 601 aa  333  6e-90  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  37.04 
 
 		 545 aa  330  3e-89  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  41.78 
 
 		 572 aa  329  7e-89  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  35.57 
 
 		 588 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  38.21 
 
 		 597 aa  322  1.9999999999999998e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  37.52 
 
 		 551 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  38.75 
 
 		 608 aa  302  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0420  adenine deaminase  38.86 
 
 		 564 aa  302  1e-80  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  37.23 
 
 		 555 aa  298  2e-79  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  37.54 
 
 		 593 aa  294  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0418  adenine deaminase  36.36 
 
 		 551 aa  292  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  37.61 
 
 		 595 aa  291  1e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  35.56 
 
 		 542 aa  281  2e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.101601 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  32.68 
 
 		 571 aa  280  6e-74  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4610  adenine deaminase  36.56 
 
 		 593 aa  279  9e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  39.09 
 
 		 606 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  31.14 
 
 		 548 aa  271  2e-71  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  28.87 
 
 		 568 aa  270  2.9999999999999997e-71  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  36.18 
 
 		 598 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0932  adenine deaminase  30.78 
 
 		 596 aa  270  7e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  36.28 
 
 		 564 aa  261  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  34.57 
 
 		 582 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3740  Adenine deaminase  35.84 
 
 		 601 aa  254  3e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  35.24 
 
 		 600 aa  252  1e-65  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  34.54 
 
 		 595 aa  252  1e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3431  adenine deaminase  35.84 
 
 		 601 aa  251  3e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  35.21 
 
 		 601 aa  241  2e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  32.82 
 
 		 599 aa  237  3e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  32.99 
 
 		 601 aa  235  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4006  Adenine deaminase  33.61 
 
 		 598 aa  234  4.0000000000000004e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275128  normal  0.23839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  33.22 
 
 		 600 aa  233  5e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1082  adenine deaminase  32.99 
 
 		 600 aa  233  6e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  26.98 
 
 		 567 aa  214  3.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  32.62 
 
 		 641 aa  209  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  30.48 
 
 		 594 aa  202  9.999999999999999e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  32.71 
 
 		 623 aa  192  1e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0973  Adenine deaminase  28.72 
 
 		 592 aa  190  7e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.796039  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2826  Adenine deaminase  28.1 
 
 		 592 aa  177  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1744  adenine deaminase  30.96 
 
 		 588 aa  152  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.454715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1142  Adenine deaminase  27.46 
 
 		 581 aa  151  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  26.02 
 
 		 584 aa  144  4e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2818  adenine deaminase  26.06 
 
 		 584 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3032  adenine deaminase  26.06 
 
 		 584 aa  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3026  putative adenine deaminase  26.06 
 
 		 584 aa  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0266  Adenine deaminase  25.52 
 
 		 581 aa  140  6e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000208487  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3063  putative adenine deaminase  25.71 
 
 		 582 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154725  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2753  adenine deaminase  25.48 
 
 		 589 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.584086  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  25.04 
 
 		 585 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2823  adenine deaminase  25.87 
 
 		 580 aa  136  8e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107403  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>