240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_0998 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  65.01 
 
 		 581 aa  707    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  61.06 
 
 		 573 aa  650    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  73.74 
 
 		 565 aa  803    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  63.81 
 
 		 564 aa  684    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  64.17 
 
 		 565 aa  704    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  100 
 
 		 564 aa  1118    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  64.77 
 
 		 565 aa  712    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  63.48 
 
 		 564 aa  710    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  63.83 
 
 		 565 aa  689    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  64.53 
 
 		 565 aa  706    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  73.74 
 
 		 565 aa  802    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  73.75 
 
 		 565 aa  787    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  65.01 
 
 		 613 aa  708    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  63.99 
 
 		 563 aa  706    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  61.18 
 
 		 581 aa  663    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  47.36 
 
 		 573 aa  503  1e-141  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.489657 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  41.75 
 
 		 588 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  41.75 
 
 		 588 aa  425  1e-118  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  40.78 
 
 		 571 aa  426  1e-118  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  43.34 
 
 		 570 aa  428  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  41.93 
 
 		 588 aa  427  1e-118  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0272837 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  40.78 
 
 		 571 aa  427  1e-118  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  41.75 
 
 		 588 aa  425  1e-118  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  41.75 
 
 		 588 aa  424  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  41.75 
 
 		 588 aa  425  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  41.58 
 
 		 588 aa  420  1e-116  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  41.84 
 
 		 569 aa  419  1e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  42.06 
 
 		 588 aa  417  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  41.31 
 
 		 571 aa  414  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  39.34 
 
 		 568 aa  412  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  40.42 
 
 		 581 aa  408  1.0000000000000001e-112  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  41.7 
 
 		 567 aa  402  1e-111  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  40.42 
 
 		 576 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  38.29 
 
 		 570 aa  393  1e-108  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  41.53 
 
 		 576 aa  389  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  42.7 
 
 		 569 aa  387  1e-106  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  42.81 
 
 		 558 aa  381  1e-104  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  38.12 
 
 		 566 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  41.4 
 
 		 575 aa  377  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  36.11 
 
 		 574 aa  369  1e-101  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  39.62 
 
 		 596 aa  367  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  36.74 
 
 		 584 aa  365  1e-99  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  44.08 
 
 		 518 aa  365  1e-99  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  39.11 
 
 		 573 aa  363  3e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  36.09 
 
 		 576 aa  355  1e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  36.2 
 
 		 551 aa  342  8e-93  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  38.82 
 
 		 595 aa  338  9.999999999999999e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  38.1 
 
 		 601 aa  332  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1778  adenine deaminase  39.43 
 
 		 567 aa  332  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  37.7 
 
 		 597 aa  331  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  35.37 
 
 		 553 aa  330  4e-89  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  35.68 
 
 		 601 aa  328  1.0000000000000001e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  40.11 
 
 		 572 aa  326  9e-88  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  38.62 
 
 		 555 aa  325  1e-87  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  37.95 
 
 		 608 aa  325  1e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  36.01 
 
 		 603 aa  324  3e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0420  adenine deaminase  39.1 
 
 		 564 aa  321  1.9999999999999998e-86  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  36.28 
 
 		 545 aa  312  9e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  33.28 
 
 		 588 aa  303  7.000000000000001e-81  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  35.04 
 
 		 551 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  38.25 
 
 		 593 aa  300  5e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0418  adenine deaminase  36.04 
 
 		 551 aa  298  2e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  31.01 
 
 		 568 aa  286  8e-76  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  35.09 
 
 		 542 aa  286  8e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.101601 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  32.13 
 
 		 548 aa  280  4e-74  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  36.36 
 
 		 595 aa  280  5e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  36.25 
 
 		 564 aa  272  1e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  36.13 
 
 		 606 aa  262  1e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  33.05 
 
 		 598 aa  249  9e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  29.68 
 
 		 567 aa  249  1e-64  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0932  adenine deaminase  30.65 
 
 		 596 aa  246  8e-64  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4610  adenine deaminase  34.69 
 
 		 593 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  32.21 
 
 		 600 aa  238  3e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  30 
 
 		 571 aa  236  6e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3740  Adenine deaminase  33.84 
 
 		 601 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  33.84 
 
 		 601 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  33.33 
 
 		 595 aa  230  4e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3431  adenine deaminase  33.67 
 
 		 601 aa  229  9e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  32.87 
 
 		 582 aa  229  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  31.54 
 
 		 601 aa  217  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4006  Adenine deaminase  31.66 
 
 		 598 aa  209  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275128  normal  0.23839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  31.47 
 
 		 600 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1082  adenine deaminase  31.86 
 
 		 600 aa  201  3e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  30.85 
 
 		 599 aa  201  3e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  29.04 
 
 		 594 aa  193  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0973  Adenine deaminase  27.09 
 
 		 592 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.796039  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  29.36 
 
 		 641 aa  168  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2826  Adenine deaminase  27.37 
 
 		 592 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1744  adenine deaminase  28.06 
 
 		 588 aa  156  8e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.454715  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  26.47 
 
 		 623 aa  154  5.9999999999999996e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1142  Adenine deaminase  25.68 
 
 		 581 aa  133  9e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  24.6 
 
 		 584 aa  126  8.000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0266  Adenine deaminase  24.49 
 
 		 581 aa  127  8.000000000000001e-28  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000208487  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2818  adenine deaminase  24.37 
 
 		 584 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3032  adenine deaminase  24.37 
 
 		 584 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3026  putative adenine deaminase  24.37 
 
 		 584 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2218  putative adenine deaminase  24.52 
 
 		 584 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000470713 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  24.65 
 
 		 585 aa  120  6e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1471  adenine deaminase  24.54 
 
 		 595 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0104805  normal  0.148633 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2753  adenine deaminase  24.19 
 
 		 589 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.584086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>