148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4006 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_1082  adenine deaminase  86.96 
 
 		 600 aa  1022    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4006  Adenine deaminase  100 
 
 		 598 aa  1213    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275128  normal  0.23839 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  80.83 
 
 		 600 aa  959    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  83.36 
 
 		 599 aa  1000    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3431  adenine deaminase  75.17 
 
 		 601 aa  849    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  67.72 
 
 		 601 aa  830    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  75.34 
 
 		 601 aa  848    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3740  Adenine deaminase  75 
 
 		 601 aa  850    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  36.27 
 
 		 596 aa  343  4e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  37.31 
 
 		 595 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  36.16 
 
 		 603 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  35.23 
 
 		 601 aa  297  4e-79  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  34.11 
 
 		 601 aa  297  4e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  34.88 
 
 		 597 aa  290  4e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  36.21 
 
 		 606 aa  290  5.0000000000000004e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  35.24 
 
 		 608 aa  287  2.9999999999999996e-76  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  31.46 
 
 		 584 aa  286  5e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  33.61 
 
 		 571 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  34.29 
 
 		 571 aa  285  2.0000000000000002e-75  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  33.17 
 
 		 571 aa  280  7e-74  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  33.9 
 
 		 567 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  32.71 
 
 		 588 aa  274  3e-72  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  30.8 
 
 		 574 aa  270  8e-71  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  35.26 
 
 		 575 aa  269  1e-70  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  33.17 
 
 		 564 aa  253  5.000000000000001e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  33.86 
 
 		 551 aa  253  5.000000000000001e-66  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  32.98 
 
 		 553 aa  251  2e-65  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  31.66 
 
 		 581 aa  251  2e-65  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  34.85 
 
 		 564 aa  251  2e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  33.62 
 
 		 563 aa  249  1e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  30.08 
 
 		 570 aa  248  3e-64  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  33.5 
 
 		 565 aa  247  4e-64  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  33.39 
 
 		 573 aa  246  6.999999999999999e-64  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.489657 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  29.25 
 
 		 568 aa  245  9.999999999999999e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  32.15 
 
 		 565 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  33.78 
 
 		 565 aa  243  6e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4610  adenine deaminase  34.04 
 
 		 593 aa  243  9e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610882  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  33.5 
 
 		 581 aa  242  1e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  31.99 
 
 		 565 aa  242  1e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  32.94 
 
 		 613 aa  241  2e-62  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  34.94 
 
 		 569 aa  241  2.9999999999999997e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  29.65 
 
 		 576 aa  239  6.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  33.5 
 
 		 565 aa  239  8e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  30.32 
 
 		 576 aa  238  2e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  32.49 
 
 		 581 aa  236  6e-61  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  33.05 
 
 		 565 aa  237  6e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  33.58 
 
 		 593 aa  235  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  32.98 
 
 		 555 aa  235  2.0000000000000002e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  29.52 
 
 		 571 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  31.55 
 
 		 598 aa  233  9e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  31.09 
 
 		 565 aa  231  4e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  34.7 
 
 		 595 aa  229  9e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  31.86 
 
 		 566 aa  226  8e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  31.27 
 
 		 570 aa  223  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  32.11 
 
 		 588 aa  219  1e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  32.66 
 
 		 573 aa  219  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  31.69 
 
 		 588 aa  218  2e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0272837 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  28.35 
 
 		 568 aa  217  5e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  31.87 
 
 		 569 aa  217  5e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  31.69 
 
 		 588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  31.69 
 
 		 588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  32.23 
 
 		 588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  31.69 
 
 		 588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  31.69 
 
 		 588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  31.69 
 
 		 588 aa  215  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  31.83 
 
 		 564 aa  209  1e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  28.47 
 
 		 567 aa  207  4e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  33.1 
 
 		 572 aa  207  5e-52  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  32.19 
 
 		 518 aa  206  8e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  31.86 
 
 		 595 aa  203  8e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  31.35 
 
 		 573 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  30.45 
 
 		 576 aa  199  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  30.74 
 
 		 545 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  30.87 
 
 		 582 aa  197  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  32.57 
 
 		 558 aa  193  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  31.97 
 
 		 564 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  26.33 
 
 		 548 aa  192  2e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  28.72 
 
 		 551 aa  189  9e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  29.14 
 
 		 594 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0420  adenine deaminase  30.74 
 
 		 564 aa  187  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1778  adenine deaminase  30.89 
 
 		 567 aa  187  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0932  adenine deaminase  27.24 
 
 		 596 aa  187  6e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  28.98 
 
 		 600 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0418  adenine deaminase  28.75 
 
 		 551 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  28.34 
 
 		 542 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.101601 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  29.62 
 
 		 641 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  31.04 
 
 		 623 aa  174  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2826  Adenine deaminase  27.63 
 
 		 592 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0973  Adenine deaminase  25 
 
 		 592 aa  139  1e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.796039  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1744  adenine deaminase  26.89 
 
 		 588 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.454715  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1142  Adenine deaminase  24.48 
 
 		 581 aa  130  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1471  adenine deaminase  24.54 
 
 		 595 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0104805  normal  0.148633 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0266  Adenine deaminase  22.93 
 
 		 581 aa  107  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000208487  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2218  putative adenine deaminase  22.64 
 
 		 584 aa  90.5  9e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000470713 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  22.95 
 
 		 585 aa  87  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2753  adenine deaminase  22.61 
 
 		 589 aa  82.4  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.584086  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2823  adenine deaminase  22.74 
 
 		 580 aa  80.9  0.00000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  23.04 
 
 		 584 aa  80.9  0.00000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2219  putative AdeC3 adenine deaminase  36.73 
 
 		 257 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.299689  hitchhiker  0.00659238 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3026  putative adenine deaminase  22.7 
 
 		 584 aa  77.4  0.0000000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>