232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_1712 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_1712  adenine deaminase  100 
 
 
566 aa  1163    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000241505  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1744  adenine deaminase  41.55 
 
 
570 aa  457  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  40.91 
 
 
576 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  41.27 
 
 
575 aa  435  1e-120  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  37.28 
 
 
576 aa  411  1e-113  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0791  adenine deaminase  38.86 
 
 
571 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  38.15 
 
 
568 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_697  adenine deaminase  39.22 
 
 
571 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0967  adenine deaminase  40.62 
 
 
573 aa  396  1e-109  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.489657 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0717  adenine deaminase  39.04 
 
 
571 aa  395  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.8271  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0385  adenine deaminase  40.14 
 
 
565 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  39.93 
 
 
569 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0136  adenine deaminase  38.5 
 
 
570 aa  385  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.213614  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2318  adenine deaminase  37.81 
 
 
565 aa  384  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.793181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2226  adenine deaminase  37.83 
 
 
564 aa  381  1e-104  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.261365  normal  0.153019 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2771  adenine deaminase  39.05 
 
 
588 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00153366  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0653  adenine deaminase  37.66 
 
 
581 aa  374  1e-102  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0998  adenine deaminase  38.12 
 
 
564 aa  370  1e-101  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00442285  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3297  adenine deaminase  36.45 
 
 
564 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0615  adenine deaminase  37.48 
 
 
613 aa  369  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.942349  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0522  adenine deaminase  37.57 
 
 
567 aa  367  1e-100  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0239  adenine deaminase  38.46 
 
 
565 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.747545  normal  0.606049 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0417  adenine deaminase  37.25 
 
 
576 aa  365  1e-99  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3735  adenine deaminase  37.3 
 
 
563 aa  365  1e-99  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1731  adenine deaminase  35.38 
 
 
574 aa  363  3e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.820357  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1575  adenine deaminase  39.5 
 
 
558 aa  363  5.0000000000000005e-99  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.944979 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0985  adenine deaminase  37.19 
 
 
565 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2645  adenine deaminase  37.01 
 
 
565 aa  362  1e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370121  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2831  adenine deaminase  36.46 
 
 
565 aa  360  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.611398  normal  0.396572 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  37.01 
 
 
581 aa  360  5e-98  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2849  adenine deaminase  38.65 
 
 
573 aa  359  6e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3101  adenine deaminase  36.74 
 
 
565 aa  359  7e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.326559 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0733  adenine deaminase  36.9 
 
 
584 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.992989  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0768  adenine deaminase  36.74 
 
 
581 aa  356  5e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1539  adenine deaminase  39.66 
 
 
518 aa  356  7.999999999999999e-97  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196939  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0683  adenine deaminase  37.32 
 
 
551 aa  355  1e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.458453  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0158  adenine deaminase  36.5 
 
 
553 aa  353  5e-96  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  34.66 
 
 
596 aa  349  7e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0428  adenine deaminase  36.49 
 
 
573 aa  348  1e-94  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1778  adenine deaminase  36.61 
 
 
567 aa  340  5e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3359  adenine deaminase  34.83 
 
 
603 aa  339  8e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.234108  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4030  cryptic adenine deaminase  35.19 
 
 
588 aa  309  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.377933 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  33.51 
 
 
601 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.972579 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03549  cryptic adenine deaminase  35.04 
 
 
588 aa  306  7e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0038  adenine deaminase  35.04 
 
 
588 aa  306  7e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03491  hypothetical protein  35.04 
 
 
588 aa  306  7e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0034  cryptic adenine deaminase  35.04 
 
 
588 aa  306  8.000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5095  cryptic adenine deaminase  35.02 
 
 
588 aa  306  8.000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0272837 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3878  cryptic adenine deaminase  35.04 
 
 
588 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4173  cryptic adenine deaminase  35.04 
 
 
588 aa  305  2.0000000000000002e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5277  adenine deaminase  34.08 
 
 
595 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.899857 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4254  cryptic adenine deaminase  35.21 
 
 
569 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  33.51 
 
 
572 aa  296  8e-79  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  31.78 
 
 
597 aa  286  5.999999999999999e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3930  Adenine deaminase  34.35 
 
 
555 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.265205  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0418  adenine deaminase  34.25 
 
 
551 aa  284  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.876595 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1972  adenine deaminase  30.87 
 
 
601 aa  283  6.000000000000001e-75  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.500438  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3342  adenine deaminase  34.85 
 
 
551 aa  283  7.000000000000001e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0903349  decreased coverage  0.00263783 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0420  adenine deaminase  34.57 
 
 
564 aa  281  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1198  adenine deaminase  32.04 
 
 
545 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.132796 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0338  adenine deaminase  31.65 
 
 
608 aa  273  9e-72  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0932  adenine deaminase  31.24 
 
 
596 aa  266  5.999999999999999e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5735  adenine deaminase  32.91 
 
 
542 aa  265  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.101601 
 
 
-
 
NC_011778  BbuZS7_K13  adenine deaminase  30.09 
 
 
548 aa  264  3e-69  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.0000000297334  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  29.96 
 
 
567 aa  263  8e-69  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1928  Adenine deaminase  32.26 
 
 
564 aa  252  1e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.997125 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  30.18 
 
 
571 aa  250  4e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  27.69 
 
 
568 aa  231  3e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3431  adenine deaminase  30.94 
 
 
601 aa  226  1e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.614869 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3740  Adenine deaminase  30.93 
 
 
601 aa  225  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1116  adenine deaminase  32.68 
 
 
595 aa  224  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.535005  hitchhiker  0.000000296634 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2141  Adenine deaminase  30.56 
 
 
582 aa  222  9.999999999999999e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.451104 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1360  Adenine deaminase  30.34 
 
 
598 aa  222  1.9999999999999999e-56  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0377  adenine deaminase  30.6 
 
 
606 aa  221  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3626  Adenine deaminase  31.18 
 
 
601 aa  219  1e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0436104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4006  Adenine deaminase  32.03 
 
 
598 aa  218  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.275128  normal  0.23839 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3584  adenine deaminase  28.19 
 
 
601 aa  218  2e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.94095  normal  0.0653025 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5275  adenine deaminase  30.07 
 
 
600 aa  216  9.999999999999999e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.81891 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3451  Adenine deaminase  29.85 
 
 
593 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1082  adenine deaminase  30.73 
 
 
600 aa  213  9e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4610  adenine deaminase  28.33 
 
 
593 aa  212  1e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.610882  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  30.37 
 
 
599 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3164  Adenine deaminase  30.15 
 
 
595 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3118  adenine deaminase  28.83 
 
 
600 aa  204  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.597443  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  26.86 
 
 
594 aa  194  5e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3233  adenine deaminase  29.94 
 
 
623 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1650  Adenine deaminase  26.91 
 
 
641 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.134631 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2826  Adenine deaminase  25 
 
 
592 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0973  Adenine deaminase  26.11 
 
 
592 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.796039  normal  0.580328 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1471  adenine deaminase  26.68 
 
 
595 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0104805  normal  0.148633 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3029  putative adenine deaminase  26.05 
 
 
585 aa  151  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2823  adenine deaminase  25.65 
 
 
580 aa  148  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.107403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3063  putative adenine deaminase  25.52 
 
 
582 aa  147  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0154725  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2766  adenine deaminase  25.74 
 
 
584 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.103156  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2818  adenine deaminase  25.4 
 
 
584 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.893752  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3026  putative adenine deaminase  25.74 
 
 
584 aa  144  4e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3032  adenine deaminase  25.4 
 
 
584 aa  144  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2753  adenine deaminase  25.74 
 
 
589 aa  144  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.584086  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2218  putative adenine deaminase  25.74 
 
 
584 aa  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000470713 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1744  adenine deaminase  24.17 
 
 
588 aa  136  8e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.454715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>