192 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2973 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2973  isoaspartyl dipeptidase  100 
 
 
402 aa  816    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2176  isoaspartyl dipeptidase  49.11 
 
 
391 aa  364  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0780  isoaspartyl dipeptidase  48.45 
 
 
388 aa  349  5e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0138983 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  46.17 
 
 
389 aa  333  4e-90  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  45.92 
 
 
389 aa  330  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0964  isoaspartyl dipeptidase  45.48 
 
 
376 aa  330  3e-89  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4867  isoaspartyl dipeptidase  46.75 
 
 
390 aa  329  6e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.567438 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0598  isoaspartyl dipeptidase  47.86 
 
 
363 aa  328  7e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4768  isoaspartyl dipeptidase  46.75 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4843  isoaspartyl dipeptidase  46.75 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4915  isoaspartyl dipeptidase  46.75 
 
 
390 aa  328  1.0000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.325437 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4916  isoaspartyl dipeptidase  46.75 
 
 
390 aa  327  3e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4777  isoaspartyl dipeptidase  44.82 
 
 
390 aa  325  1e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04197  isoaspartyl dipeptidase  44.82 
 
 
390 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0438993  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3668  isoaspartyl dipeptidase  44.82 
 
 
390 aa  323  2e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5836  isoaspartyl dipeptidase  44.82 
 
 
390 aa  324  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04159  hypothetical protein  44.82 
 
 
390 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4927  isoaspartyl dipeptidase  44.56 
 
 
390 aa  323  4e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3736  isoaspartyl dipeptidase  44.56 
 
 
390 aa  323  5e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0121859  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4556  isoaspartyl dipeptidase  44.56 
 
 
390 aa  322  5e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4871  isoaspartyl dipeptidase  44.56 
 
 
390 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1352  isoaspartyl dipeptidase  44.85 
 
 
377 aa  317  3e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1004  isoaspartyl dipeptidase  43.77 
 
 
393 aa  315  9.999999999999999e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1309  isoaspartyl dipeptidase  43.83 
 
 
402 aa  310  2e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  44.19 
 
 
391 aa  304  2.0000000000000002e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  42.49 
 
 
390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  42.16 
 
 
389 aa  298  2e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  45.04 
 
 
390 aa  296  3e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  42.16 
 
 
389 aa  296  3e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  42.38 
 
 
379 aa  296  6e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  41.9 
 
 
389 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  41.65 
 
 
389 aa  292  6e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  41.28 
 
 
395 aa  288  9e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4096  isoaspartyl dipeptidase  40.87 
 
 
393 aa  288  1e-76  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982882 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  40.73 
 
 
378 aa  274  3e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  39.69 
 
 
377 aa  272  7e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1115  isoaspartyl dipeptidase  42.59 
 
 
393 aa  271  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.201525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2586  isoaspartyl dipeptidase  38.67 
 
 
376 aa  256  4e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0239245  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2473  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  26.57 
 
 
385 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6924  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  28.01 
 
 
385 aa  60.1  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3714  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  26.95 
 
 
377 aa  57.4  0.0000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  33.03 
 
 
425 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  33.03 
 
 
425 aa  56.6  0.0000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6922  imidazolonepropionase  33.33 
 
 
420 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386795  normal  0.926184 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5926  imidazolonepropionase  32.89 
 
 
420 aa  52.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103117  normal  0.194871 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  24.94 
 
 
431 aa  51.6  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2134  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  24.33 
 
 
380 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000732825  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  22.49 
 
 
418 aa  51.2  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  31.13 
 
 
425 aa  50.1  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  25.66 
 
 
419 aa  49.7  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0404  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  29.37 
 
 
400 aa  49.7  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  35.51 
 
 
620 aa  49.7  0.0001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0778  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  24.15 
 
 
395 aa  49.7  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1565  amidohydrolase  24.2 
 
 
386 aa  48.9  0.0002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000482588  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  40.62 
 
 
459 aa  48.9  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1477  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  31.5 
 
 
419 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.783308  normal  0.808264 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3701  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  36.36 
 
 
382 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0437627  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  21.37 
 
 
418 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3900  imidazolonepropionase  30.97 
 
 
406 aa  48.1  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1496  phenylhydantoinase  23.24 
 
 
457 aa  48.9  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  25.91 
 
 
419 aa  47.8  0.0003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1771  amidohydrolase  23.99 
 
 
1020 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246166  normal  0.859172 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  39.71 
 
 
384 aa  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2932  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  34.78 
 
 
389 aa  47.8  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.76093  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2190  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  31.58 
 
 
393 aa  47.8  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0610  dihydroorotase  43.75 
 
 
445 aa  47.4  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4421  phosphonate metabolism protein PhnM  21.41 
 
 
380 aa  47.8  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2154  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  37.35 
 
 
370 aa  47.4  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14740  dihydroorotase  40 
 
 
446 aa  47.4  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.696719  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.82 
 
 
418 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1901  amidohydrolase  25.29 
 
 
1084 aa  47  0.0005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1508  amidohydrolase  37.8 
 
 
839 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0438  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  28.7 
 
 
385 aa  47  0.0005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  decreased coverage  0.00333124  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  37.8 
 
 
763 aa  47.4  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  24.05 
 
 
420 aa  47.4  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2868  amidohydrolase  37.8 
 
 
1029 aa  47  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0316742  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  40 
 
 
532 aa  46.6  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2513  amidohydrolase  37.8 
 
 
1029 aa  47  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.1394  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  40 
 
 
386 aa  46.6  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22190  amidohydrolase, imidazolonepropionase  50 
 
 
390 aa  46.6  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  43.4 
 
 
1062 aa  46.6  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2997  amidohydrolase  36.59 
 
 
1029 aa  46.6  0.0008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1253  imidazolonepropionase  30.4 
 
 
404 aa  46.6  0.0009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1303  imidazolonepropionase  28.68 
 
 
414 aa  46.6  0.0009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1415  amidohydrolase  36.59 
 
 
1024 aa  46.6  0.0009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.42132  normal  0.197349 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1997  dihydropyrimidinase  23.04 
 
 
454 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  36.99 
 
 
556 aa  46.2  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1698  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  38.89 
 
 
408 aa  46.2  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140517  normal  0.0310593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22930  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  24.02 
 
 
379 aa  45.8  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1350  amidohydrolase  36.59 
 
 
1024 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.535703  normal  0.023067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  39.33 
 
 
580 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  22.56 
 
 
432 aa  46.2  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1403  amidohydrolase  36.59 
 
 
1024 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.843275  normal  0.933941 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  31.86 
 
 
412 aa  46.2  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0819  phosphonate metabolism protein PhnM  23.86 
 
 
380 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.793377  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  24.05 
 
 
418 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1461  adenine deaminase  45.31 
 
 
581 aa  46.2  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.223433  normal  0.788122 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06413  dihydroorotase  28.47 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0033  amidohydrolase  29.17 
 
 
430 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000020802  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  32.74 
 
 
414 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>