68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0185 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  100 
 
 
378 aa  761    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  75.86 
 
 
377 aa  587  1e-166  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4915  isoaspartyl dipeptidase  45.91 
 
 
390 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.325437 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4867  isoaspartyl dipeptidase  45.91 
 
 
390 aa  333  3e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.567438 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4843  isoaspartyl dipeptidase  45.91 
 
 
390 aa  332  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4768  isoaspartyl dipeptidase  45.65 
 
 
390 aa  331  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4916  isoaspartyl dipeptidase  45.65 
 
 
390 aa  330  2e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  45 
 
 
379 aa  323  4e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4777  isoaspartyl dipeptidase  44.06 
 
 
390 aa  317  3e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3668  isoaspartyl dipeptidase  43.8 
 
 
390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4927  isoaspartyl dipeptidase  43.8 
 
 
390 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04197  isoaspartyl dipeptidase  43.8 
 
 
390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0438993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04159  hypothetical protein  43.8 
 
 
390 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4556  isoaspartyl dipeptidase  43.8 
 
 
390 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4871  isoaspartyl dipeptidase  43.8 
 
 
390 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3736  isoaspartyl dipeptidase  43.8 
 
 
390 aa  312  5.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0121859  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5836  isoaspartyl dipeptidase  43.54 
 
 
390 aa  311  7.999999999999999e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0780  isoaspartyl dipeptidase  42.78 
 
 
388 aa  301  2e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0138983 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4096  isoaspartyl dipeptidase  42.49 
 
 
393 aa  300  4e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982882 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2176  isoaspartyl dipeptidase  42.27 
 
 
391 aa  300  4e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2973  isoaspartyl dipeptidase  40.73 
 
 
402 aa  289  5.0000000000000004e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  40.36 
 
 
395 aa  289  7e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1352  isoaspartyl dipeptidase  41.99 
 
 
377 aa  286  2.9999999999999996e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  41.6 
 
 
389 aa  285  1.0000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  41.34 
 
 
389 aa  283  3.0000000000000004e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  39.28 
 
 
389 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  39.28 
 
 
389 aa  282  7.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1309  isoaspartyl dipeptidase  43.08 
 
 
402 aa  282  8.000000000000001e-75  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  39.28 
 
 
389 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  43.6 
 
 
391 aa  280  2e-74  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  38.76 
 
 
389 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0964  isoaspartyl dipeptidase  42.97 
 
 
376 aa  277  2e-73  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  39.69 
 
 
390 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  38.02 
 
 
390 aa  264  2e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1115  isoaspartyl dipeptidase  40.32 
 
 
393 aa  258  1e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.201525  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0598  isoaspartyl dipeptidase  41.53 
 
 
363 aa  256  4e-67  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1004  isoaspartyl dipeptidase  39.39 
 
 
393 aa  255  1.0000000000000001e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2586  isoaspartyl dipeptidase  38.71 
 
 
376 aa  243  3.9999999999999997e-63  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0239245  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2144  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  22.39 
 
 
377 aa  62  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2434  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  24.43 
 
 
378 aa  58.5  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2190  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  25.87 
 
 
393 aa  56.6  0.0000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  25.13 
 
 
389 aa  55.1  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.64 
 
 
432 aa  53.1  0.000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1698  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  41.54 
 
 
408 aa  49.7  0.00009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140517  normal  0.0310593 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1514  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  25.06 
 
 
391 aa  48.9  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  25.41 
 
 
370 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  36.04 
 
 
908 aa  47.8  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1040  dihydroorotase  38.24 
 
 
422 aa  46.6  0.0007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  21.68 
 
 
425 aa  46.2  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  39 
 
 
407 aa  46.2  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0346  amidohydrolase  23.39 
 
 
416 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2103  dihydroorotase  36.23 
 
 
424 aa  45.1  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  39.13 
 
 
431 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1785  allantoinase  36.92 
 
 
461 aa  44.3  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.827785  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0778  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  30.56 
 
 
395 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  37.5 
 
 
597 aa  44.7  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  32.98 
 
 
412 aa  43.9  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0767  dihydroorotase  31.11 
 
 
425 aa  43.9  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  29.55 
 
 
403 aa  43.5  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5642  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  24.71 
 
 
411 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  32.08 
 
 
433 aa  43.5  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3945  amidohydrolase  23.64 
 
 
385 aa  43.1  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464542  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  22.56 
 
 
378 aa  43.1  0.008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2475  amidohydrolase  30.21 
 
 
397 aa  43.1  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2610  urease  31.07 
 
 
562 aa  43.1  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183786 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4704  amidohydrolase  41.51 
 
 
424 aa  42.7  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0167174 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  36.49 
 
 
388 aa  42.7  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  39.06 
 
 
1005 aa  42.7  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>