152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeHA_C4916 on replicon NC_011083
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04197  isoaspartyl dipeptidase  81.28 
 
 
390 aa  649    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0438993  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3668  isoaspartyl dipeptidase  81.28 
 
 
390 aa  649    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04159  hypothetical protein  81.28 
 
 
390 aa  649    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4556  isoaspartyl dipeptidase  81.54 
 
 
390 aa  650    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4927  isoaspartyl dipeptidase  81.54 
 
 
390 aa  650    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3736  isoaspartyl dipeptidase  81.28 
 
 
390 aa  646    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0121859  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4871  isoaspartyl dipeptidase  81.28 
 
 
390 aa  649    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4777  isoaspartyl dipeptidase  81.03 
 
 
390 aa  647    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4867  isoaspartyl dipeptidase  99.23 
 
 
390 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.567438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4916  isoaspartyl dipeptidase  100 
 
 
390 aa  782    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4768  isoaspartyl dipeptidase  99.49 
 
 
390 aa  778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4843  isoaspartyl dipeptidase  99.49 
 
 
390 aa  778    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4915  isoaspartyl dipeptidase  99.23 
 
 
390 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.325437 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5836  isoaspartyl dipeptidase  81.28 
 
 
390 aa  649    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4096  isoaspartyl dipeptidase  48.32 
 
 
393 aa  349  6e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982882 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2176  isoaspartyl dipeptidase  46.02 
 
 
391 aa  328  7e-89  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0780  isoaspartyl dipeptidase  46.25 
 
 
388 aa  328  1.0000000000000001e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0138983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2973  isoaspartyl dipeptidase  46.75 
 
 
402 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  45.65 
 
 
378 aa  316  5e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1352  isoaspartyl dipeptidase  43.86 
 
 
377 aa  305  1.0000000000000001e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  43.54 
 
 
377 aa  303  3.0000000000000004e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  45.45 
 
 
390 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  44.16 
 
 
391 aa  300  2e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  42.33 
 
 
379 aa  300  3e-80  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  43.48 
 
 
390 aa  288  2e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  41.69 
 
 
389 aa  282  7.000000000000001e-75  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  41.69 
 
 
389 aa  281  2e-74  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  41.34 
 
 
389 aa  280  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  41.09 
 
 
389 aa  278  2e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  41.34 
 
 
389 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0598  isoaspartyl dipeptidase  43.41 
 
 
363 aa  276  4e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  41.34 
 
 
389 aa  276  6e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  41.22 
 
 
395 aa  272  9e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0964  isoaspartyl dipeptidase  38.67 
 
 
376 aa  267  2e-70  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1004  isoaspartyl dipeptidase  41.43 
 
 
393 aa  266  2.9999999999999995e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1309  isoaspartyl dipeptidase  39.26 
 
 
402 aa  265  1e-69  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1115  isoaspartyl dipeptidase  41.49 
 
 
393 aa  261  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.201525  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2586  isoaspartyl dipeptidase  35.92 
 
 
376 aa  225  9e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0239245  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2190  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  25.97 
 
 
393 aa  58.5  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07850  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.93 
 
 
430 aa  57.4  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0172955  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0289  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  36.11 
 
 
362 aa  57  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3402  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  37.65 
 
 
374 aa  55.1  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000022034  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  32.4 
 
 
412 aa  54.3  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  24.27 
 
 
370 aa  51.6  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00900  amidohydrolase, imidazolonepropionase  45.28 
 
 
412 aa  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1421  amidohydrolase  21.79 
 
 
429 aa  49.7  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1877  dihydroorotase, multifunctional complex type  34.58 
 
 
439 aa  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.766772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4174  amidohydrolase  29.73 
 
 
908 aa  48.9  0.0001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.000537254  hitchhiker  0.0000013548 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_983  dihydroorotase  34.21 
 
 
436 aa  48.9  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1200  dihydroorotase  34.94 
 
 
427 aa  48.9  0.0002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0100135  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  31.19 
 
 
434 aa  48.1  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  34.69 
 
 
431 aa  48.5  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  33.73 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  33.73 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  33.73 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  33.73 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.33 
 
 
429 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  33.73 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  33.73 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  34.25 
 
 
552 aa  47.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  33.73 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  33.73 
 
 
428 aa  47.8  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  33.73 
 
 
428 aa  48.1  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  38.71 
 
 
386 aa  47.4  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6837  amidohydrolase 3  46.81 
 
 
556 aa  47.4  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0874953  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  38.71 
 
 
384 aa  47.4  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5926  imidazolonepropionase  28.7 
 
 
420 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103117  normal  0.194871 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0463  adenine deaminase  46.67 
 
 
596 aa  47.4  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0688218  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5937  allantoinase  35.06 
 
 
569 aa  47.4  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6922  imidazolonepropionase  29.77 
 
 
420 aa  47  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386795  normal  0.926184 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  35.21 
 
 
379 aa  47  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  37.5 
 
 
585 aa  47  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2434  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  22.96 
 
 
378 aa  47  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1504  amidohydrolase  33.33 
 
 
1005 aa  46.6  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000736153  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0219  dihydropyrimidinase  37.7 
 
 
467 aa  46.6  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  25.93 
 
 
520 aa  46.6  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.53 
 
 
432 aa  46.6  0.0008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0952  dihydroorotase  29.25 
 
 
426 aa  46.2  0.0009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0556673  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  26.09 
 
 
377 aa  46.2  0.0009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06721  amidohydrolase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G01480)  30 
 
 
541 aa  45.8  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0498  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  23.86 
 
 
654 aa  46.2  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  47.73 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3425  Amidohydrolase 3  42.31 
 
 
491 aa  45.4  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.0036735  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  31.33 
 
 
428 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  33.73 
 
 
428 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  24.24 
 
 
403 aa  45.8  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.91 
 
 
426 aa  45.8  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1293  Amidohydrolase 3  32 
 
 
541 aa  45.8  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.958478  normal  0.919928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  33.73 
 
 
413 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0366  N-acyl-D-amino-acid deacylase  36.61 
 
 
495 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04600  N-acyl-D-aspartate/D-glutamate deacylase  30.25 
 
 
620 aa  45.8  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1693  hypothetical protein  45.1 
 
 
533 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.0357056 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1010  dihydroorotase  38.33 
 
 
428 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1802  phenylhydantoinase  39.34 
 
 
496 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0952934  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1836  phenylhydantoinase  37.7 
 
 
479 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.682514  normal  0.127421 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3492  urease domain protein  37.31 
 
 
256 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2144  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  22.43 
 
 
377 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1283  dihydroorotase  39.68 
 
 
431 aa  44.7  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  38.89 
 
 
541 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1313  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  36.51 
 
 
375 aa  44.3  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000163531  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>