214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_0598 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009616  Tmel_0598  isoaspartyl dipeptidase  100 
 
 
363 aa  723    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1309  isoaspartyl dipeptidase  55.28 
 
 
402 aa  377  1e-103  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2973  isoaspartyl dipeptidase  47.86 
 
 
402 aa  344  1e-93  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  51.19 
 
 
389 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  50.92 
 
 
389 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2176  isoaspartyl dipeptidase  51.46 
 
 
391 aa  324  1e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0780  isoaspartyl dipeptidase  46.93 
 
 
388 aa  317  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0138983 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1004  isoaspartyl dipeptidase  45.38 
 
 
393 aa  312  4.999999999999999e-84  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0964  isoaspartyl dipeptidase  48.81 
 
 
376 aa  311  1e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  44.54 
 
 
379 aa  306  4.0000000000000004e-82  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2586  isoaspartyl dipeptidase  46.01 
 
 
376 aa  301  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0239245  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  40.74 
 
 
395 aa  297  2e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4915  isoaspartyl dipeptidase  43.68 
 
 
390 aa  294  1e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.325437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4843  isoaspartyl dipeptidase  43.68 
 
 
390 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  42.67 
 
 
389 aa  294  2e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4867  isoaspartyl dipeptidase  43.68 
 
 
390 aa  294  2e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.567438 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  41.38 
 
 
390 aa  293  3e-78  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  42.67 
 
 
389 aa  293  3e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4768  isoaspartyl dipeptidase  43.41 
 
 
390 aa  292  5e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  42.4 
 
 
389 aa  292  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4916  isoaspartyl dipeptidase  43.41 
 
 
390 aa  291  9e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  42.4 
 
 
389 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5836  isoaspartyl dipeptidase  40.76 
 
 
390 aa  285  5.999999999999999e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.978701 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04197  isoaspartyl dipeptidase  40.82 
 
 
390 aa  285  9e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0438993  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3668  isoaspartyl dipeptidase  40.82 
 
 
390 aa  285  9e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1352  isoaspartyl dipeptidase  43.13 
 
 
377 aa  285  9e-76  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04159  hypothetical protein  40.82 
 
 
390 aa  285  9e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4927  isoaspartyl dipeptidase  40.82 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3736  isoaspartyl dipeptidase  40.82 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0121859  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4556  isoaspartyl dipeptidase  40.82 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4871  isoaspartyl dipeptidase  40.82 
 
 
390 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4777  isoaspartyl dipeptidase  40.55 
 
 
390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  43.62 
 
 
390 aa  279  5e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  44.68 
 
 
391 aa  272  6e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  42.08 
 
 
377 aa  261  2e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4096  isoaspartyl dipeptidase  42.36 
 
 
393 aa  258  1e-67  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982882 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  41.53 
 
 
378 aa  258  2e-67  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1115  isoaspartyl dipeptidase  39.35 
 
 
393 aa  256  4e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.201525  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1019  amidohydrolase  28.84 
 
 
386 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.18735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1111  amidohydrolase  28.84 
 
 
384 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0184  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  26.05 
 
 
382 aa  61.2  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0749437  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6924  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  23.54 
 
 
385 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0482  amidohydrolase  25.3 
 
 
383 aa  58.5  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000129466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0443  amidohydrolase  24.94 
 
 
388 aa  58.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2663  dihydroorotase, multifunctional complex type  26.03 
 
 
418 aa  55.8  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0404  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  38.55 
 
 
400 aa  53.5  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  24.79 
 
 
370 aa  53.1  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6209  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  32.43 
 
 
369 aa  53.1  0.000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.323289 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  23.12 
 
 
461 aa  52.8  0.000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1113  dihydroorotase  22.28 
 
 
432 aa  53.1  0.000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0480  dihydroorotase  21.5 
 
 
441 aa  53.1  0.000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0289  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  36.25 
 
 
362 aa  53.1  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0592  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  21.13 
 
 
392 aa  53.1  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5427  amidohydrolase  23.71 
 
 
432 aa  52.8  0.000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.726254  normal  0.0808338 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0498  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  43.18 
 
 
654 aa  52.8  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2434  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  24.49 
 
 
378 aa  52.8  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  33.33 
 
 
433 aa  52.4  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3004  imidazolonepropionase  20.95 
 
 
405 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.783832  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  28.4 
 
 
431 aa  51.2  0.00003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  46.03 
 
 
418 aa  50.8  0.00004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1600  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  34.15 
 
 
390 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1650  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.44 
 
 
418 aa  50.4  0.00005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.549095  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  29.63 
 
 
413 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3714  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  33.88 
 
 
377 aa  49.7  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1247  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  25.86 
 
 
383 aa  49.3  0.00009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0336  dihydroorotase, multifunctional complex type  22.91 
 
 
420 aa  49.3  0.00009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0276673  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  22.22 
 
 
453 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2144  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  24.68 
 
 
377 aa  48.9  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  22.22 
 
 
453 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  22.22 
 
 
453 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  22.22 
 
 
453 aa  49.3  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4198  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  36.26 
 
 
405 aa  48.9  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0589061  normal  0.780011 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2217  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  40.74 
 
 
390 aa  48.5  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  29.63 
 
 
420 aa  48.5  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3491  Pro-Hyp dipeptidase  43.14 
 
 
426 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163826  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2190  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  25.13 
 
 
393 aa  48.9  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  37.1 
 
 
383 aa  48.5  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0338  amidohydrolase  32.73 
 
 
386 aa  48.5  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0599299  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  23.11 
 
 
425 aa  48.5  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.78 
 
 
429 aa  47.8  0.0003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0494  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  32.14 
 
 
387 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000235914 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0084  adenine deaminase  23.62 
 
 
572 aa  48.1  0.0003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2621  dihydroorotase  22.92 
 
 
444 aa  47.8  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5642  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  41.67 
 
 
411 aa  47.8  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1477  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  36.21 
 
 
419 aa  47.4  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.783308  normal  0.808264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2780  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  38.27 
 
 
389 aa  47.4  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.382216  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1042  hypothetical protein  33.96 
 
 
451 aa  47.4  0.0004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.289988  normal  0.0665058 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1476  dihydroorotase  50 
 
 
426 aa  47.4  0.0004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.379941  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00640  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  32.86 
 
 
409 aa  47.4  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.2787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4100  amidohydrolase  35.16 
 
 
466 aa  47.4  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.169858 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  23.36 
 
 
418 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2473  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  22.22 
 
 
385 aa  47  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.206638  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  28.7 
 
 
413 aa  47  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  25.93 
 
 
428 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  28.7 
 
 
405 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  28.7 
 
 
413 aa  47  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2851  amidohydrolase  32.94 
 
 
763 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.877616  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  23.1 
 
 
425 aa  46.6  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2134  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  36.36 
 
 
380 aa  46.6  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000732825  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0778  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  32.88 
 
 
395 aa  46.6  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>