277 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_3004 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008044  TM1040_3004  imidazolonepropionase  100 
 
 
405 aa  812    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.783832  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  64.74 
 
 
400 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2986  imidazolonepropionase  61.81 
 
 
417 aa  475  1e-133  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1578  imidazolonepropionase  64 
 
 
410 aa  478  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0729988  normal  0.0660872 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1436  imidazolonepropionase  60.79 
 
 
405 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632671  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0929  imidazolonepropionase  60.55 
 
 
405 aa  468  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2934  imidazolonepropionase  63.64 
 
 
395 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.277878  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4659  imidazolonepropionase  63.75 
 
 
415 aa  466  9.999999999999999e-131  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563946  normal  0.0326494 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0871  imidazolonepropionase  60.55 
 
 
405 aa  459  9.999999999999999e-129  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1039  imidazolonepropionase  63.68 
 
 
400 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.017849  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5926  imidazolonepropionase  60.55 
 
 
420 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103117  normal  0.194871 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  60.75 
 
 
399 aa  453  1.0000000000000001e-126  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5959  imidazolonepropionase  59.8 
 
 
406 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1934  imidazolonepropionase  53.23 
 
 
445 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.754156  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  58.29 
 
 
411 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6922  imidazolonepropionase  61.31 
 
 
420 aa  447  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386795  normal  0.926184 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1303  imidazolonepropionase  61.35 
 
 
414 aa  443  1e-123  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6452  imidazolonepropionase  59.6 
 
 
404 aa  444  1e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1654  imidazolonepropionase  65.74 
 
 
400 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0408106  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  57.29 
 
 
411 aa  439  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0848  imidazolonepropionase  53.92 
 
 
446 aa  432  1e-120  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0633495 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2644  imidazolonepropionase  58.6 
 
 
408 aa  431  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142165  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2852  imidazolonepropionase  59.37 
 
 
415 aa  432  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579633  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  60.85 
 
 
401 aa  432  1e-120  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  53.77 
 
 
418 aa  430  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  60.16 
 
 
407 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  60.16 
 
 
407 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67250  imidazolonepropionase  58.66 
 
 
402 aa  425  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751738  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  60.16 
 
 
407 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  60.16 
 
 
407 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  60.16 
 
 
407 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  60.16 
 
 
407 aa  425  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2084  imidazolonepropionase  60.85 
 
 
407 aa  424  1e-117  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4835  imidazolonepropionase  57.92 
 
 
401 aa  422  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246682  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  60.16 
 
 
407 aa  424  1e-117  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5478  imidazolonepropionase  60.47 
 
 
407 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.823405  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  55.44 
 
 
408 aa  422  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5826  imidazolonepropionase  57.99 
 
 
402 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  55.44 
 
 
408 aa  421  1e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2113  imidazolonepropionase  56.69 
 
 
406 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.669841  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  54.86 
 
 
414 aa  419  1e-116  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3900  imidazolonepropionase  54.34 
 
 
406 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  57.43 
 
 
403 aa  419  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  55.19 
 
 
408 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  55.19 
 
 
408 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2207  imidazolonepropionase  60.58 
 
 
407 aa  421  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  55.19 
 
 
408 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2222  imidazolonepropionase  56.69 
 
 
406 aa  418  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.201457  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1102  imidazolonepropionase  59.42 
 
 
407 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.238791  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  54.18 
 
 
408 aa  418  1e-116  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0164  imidazolonepropionase  57 
 
 
416 aa  419  1e-116  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  53.92 
 
 
408 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  54.18 
 
 
408 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  54.18 
 
 
410 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0152  imidazolonepropionase  57.65 
 
 
431 aa  416  9.999999999999999e-116  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2512  imidazolonepropionase  56.43 
 
 
406 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0955381 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5909  imidazolonepropionase  60.26 
 
 
407 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  59.25 
 
 
407 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2168  imidazolonepropionase  60.26 
 
 
407 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2185  imidazolonepropionase  60 
 
 
407 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721027  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  56.39 
 
 
412 aa  415  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  54.43 
 
 
408 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  57.37 
 
 
401 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  59.62 
 
 
425 aa  414  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2943  imidazolonepropionase  59.25 
 
 
431 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  58.36 
 
 
406 aa  412  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  57.07 
 
 
403 aa  413  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1253  imidazolonepropionase  57.48 
 
 
404 aa  411  1e-113  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2077  imidazolonepropionase  58.79 
 
 
407 aa  408  1e-113  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.819933  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  53.42 
 
 
410 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  57.94 
 
 
401 aa  409  1e-113  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  53.42 
 
 
408 aa  410  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  56.76 
 
 
408 aa  410  1e-113  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4551  imidazolonepropionase  55.41 
 
 
402 aa  410  1e-113  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  57.78 
 
 
401 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  58.05 
 
 
401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  57.94 
 
 
401 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1824  imidazolonepropionase  59.69 
 
 
407 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2713  imidazolonepropionase  57.96 
 
 
423 aa  402  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281626  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  56.32 
 
 
401 aa  404  1e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2655  imidazolonepropionase  55.91 
 
 
403 aa  402  1e-111  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  53.23 
 
 
414 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003720  imidazolonepropionase  49.51 
 
 
416 aa  396  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4073  imidazolonepropionase  55.25 
 
 
405 aa  395  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  50.51 
 
 
403 aa  395  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2961  imidazolonepropionase  58.09 
 
 
416 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281832  normal  0.765672 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0825  imidazolonepropionase  51.38 
 
 
402 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02075  imidazolonepropionase  53.65 
 
 
416 aa  392  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1260  imidazolonepropionase  50.75 
 
 
418 aa  391  1e-107  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00726  imidazolonepropionase  53.85 
 
 
401 aa  390  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1604  imidazolonepropionase  52.72 
 
 
402 aa  390  1e-107  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.413765  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0705  imidazolonepropionase  48.64 
 
 
407 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254445  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2549  imidazolonepropionase  54.3 
 
 
407 aa  386  1e-106  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03129  imidazolonepropionase  50.74 
 
 
419 aa  373  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0766  imidazolonepropionase  51.46 
 
 
403 aa  373  1e-102  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3648  imidazolonepropionase  52.7 
 
 
456 aa  372  1e-102  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0748  imidazolonepropionase  51.2 
 
 
403 aa  369  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0937  imidazolonepropionase  48.87 
 
 
407 aa  361  1e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1019  imidazolonepropionase  47.56 
 
 
407 aa  361  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0851  imidazolonepropionase  48.27 
 
 
420 aa  360  3e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>