53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_1984 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  96.66 
 
 
389 aa  751    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  96.66 
 
 
389 aa  751    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  100 
 
 
389 aa  787    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  96.4 
 
 
389 aa  747    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  61.34 
 
 
390 aa  456  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0780  isoaspartyl dipeptidase  45.01 
 
 
388 aa  328  8e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0138983 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  45.38 
 
 
389 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  45.38 
 
 
389 aa  327  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0964  isoaspartyl dipeptidase  47.61 
 
 
376 aa  326  5e-88  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2176  isoaspartyl dipeptidase  42.46 
 
 
391 aa  309  4e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2973  isoaspartyl dipeptidase  41.65 
 
 
402 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1309  isoaspartyl dipeptidase  43.67 
 
 
402 aa  304  2.0000000000000002e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1004  isoaspartyl dipeptidase  40.2 
 
 
393 aa  292  6e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4096  isoaspartyl dipeptidase  42.56 
 
 
393 aa  292  6e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00982882 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  40.57 
 
 
379 aa  292  8e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4867  isoaspartyl dipeptidase  41.09 
 
 
390 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.567438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4916  isoaspartyl dipeptidase  41.34 
 
 
390 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4768  isoaspartyl dipeptidase  41.09 
 
 
390 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4843  isoaspartyl dipeptidase  41.09 
 
 
390 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4915  isoaspartyl dipeptidase  41.09 
 
 
390 aa  290  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.325437 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0598  isoaspartyl dipeptidase  42.4 
 
 
363 aa  289  6e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  39.28 
 
 
377 aa  286  4e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  41.39 
 
 
390 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4927  isoaspartyl dipeptidase  39.43 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04197  isoaspartyl dipeptidase  39.43 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0438993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04159  hypothetical protein  39.43 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3668  isoaspartyl dipeptidase  39.43 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  38.32 
 
 
395 aa  285  1.0000000000000001e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3736  isoaspartyl dipeptidase  39.43 
 
 
390 aa  285  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0121859  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4556  isoaspartyl dipeptidase  39.43 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5836  isoaspartyl dipeptidase  39.43 
 
 
390 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4777  isoaspartyl dipeptidase  39.18 
 
 
390 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  41.03 
 
 
391 aa  282  8.000000000000001e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4871  isoaspartyl dipeptidase  39.18 
 
 
390 aa  281  1e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  38.76 
 
 
378 aa  278  1e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1352  isoaspartyl dipeptidase  39.64 
 
 
377 aa  275  9e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2586  isoaspartyl dipeptidase  38.67 
 
 
376 aa  247  3e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0239245  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1115  isoaspartyl dipeptidase  38.3 
 
 
393 aa  241  1e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.201525  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4483  dihydroorotase  23.02 
 
 
437 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0939327 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4419  dihydroorotase  23.02 
 
 
437 aa  50.1  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  28.03 
 
 
377 aa  46.6  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  41.79 
 
 
377 aa  46.2  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  41.79 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  41.79 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4692  dihydroorotase  23.02 
 
 
439 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  41.79 
 
 
377 aa  46.2  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  40.91 
 
 
379 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3853  hypothetical protein  62.5 
 
 
34 aa  43.5  0.006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  31.09 
 
 
377 aa  43.5  0.006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  34.44 
 
 
428 aa  43.1  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  36.78 
 
 
377 aa  43.1  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  23.39 
 
 
425 aa  43.1  0.008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0813  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  32.69 
 
 
373 aa  43.1  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0482974  normal  0.113643 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>