88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2391 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  100 
 
 		 390 aa  772    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  62.11 
 
 		 389 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2340  isoaspartyl dipeptidase  62.11 
 
 		 389 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00129575  normal  0.0423808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1999  isoaspartyl dipeptidase  61.86 
 
 		 389 aa  461  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.879236  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  61.34 
 
 		 389 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0780  isoaspartyl dipeptidase  45.78 
 
 		 388 aa  324  2e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0138983 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2973  isoaspartyl dipeptidase  45.04 
 
 		 402 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  43.96 
 
 		 389 aa  313  2.9999999999999996e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  43.7 
 
 		 389 aa  313  3.9999999999999997e-84  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1309  isoaspartyl dipeptidase  44.36 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4915  isoaspartyl dipeptidase  43.73 
 
 		 390 aa  305  6e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.518108  normal  0.325437 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4843  isoaspartyl dipeptidase  43.73 
 
 		 390 aa  305  7e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4768  isoaspartyl dipeptidase  43.48 
 
 		 390 aa  305  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4867  isoaspartyl dipeptidase  43.44 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.567438 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4916  isoaspartyl dipeptidase  43.48 
 
 		 390 aa  303  3.0000000000000004e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0201  isoaspartyl dipeptidase  45.71 
 
 		 390 aa  302  5.000000000000001e-81  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0964  isoaspartyl dipeptidase  44.88 
 
 		 376 aa  302  7.000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2176  isoaspartyl dipeptidase  42.68 
 
 		 391 aa  301  1e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4096  isoaspartyl dipeptidase  41.03 
 
 		 393 aa  291  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00982882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1869  isoaspartyl dipeptidase  38.87 
 
 		 395 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  40.87 
 
 		 379 aa  289  7e-77  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1115  isoaspartyl dipeptidase  45.21 
 
 		 393 aa  288  9e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.201525  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3668  isoaspartyl dipeptidase  40.62 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000150012  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4927  isoaspartyl dipeptidase  40.62 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04197  isoaspartyl dipeptidase  40.62 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0438993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04159  hypothetical protein  40.62 
 
 		 390 aa  288  1e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0357546  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5836  isoaspartyl dipeptidase  40.62 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.978701 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3736  isoaspartyl dipeptidase  40.62 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0121859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4556  isoaspartyl dipeptidase  40.62 
 
 		 390 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4871  isoaspartyl dipeptidase  40.62 
 
 		 390 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4777  isoaspartyl dipeptidase  40.36 
 
 		 390 aa  286  4e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1004  isoaspartyl dipeptidase  41.22 
 
 		 393 aa  285  1.0000000000000001e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0178  isoaspartyl dipeptidase  39.18 
 
 		 377 aa  282  8.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.621823  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0598  isoaspartyl dipeptidase  43.62 
 
 		 363 aa  280  3e-74  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0185  isoaspartyl dipeptidase  39.69 
 
 		 378 aa  276  4e-73  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00384392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2207  isoaspartyl dipeptidase  40.82 
 
 		 391 aa  261  1e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1352  isoaspartyl dipeptidase  38.32 
 
 		 377 aa  256  6e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2586  isoaspartyl dipeptidase  39.5 
 
 		 376 aa  231  2e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0239245  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4274  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  41.56 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4075  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  41.56 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00225057 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1074  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  41.56 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.124394  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3811  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  41.56 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3796  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  41.56 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3965  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  41.56 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0539791  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4164  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  41.56 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0127002  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4186  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  41.56 
 
 		 380 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00649823  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4122  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  40.26 
 
 		 380 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.60852  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2754  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  41.56 
 
 		 383 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3884  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  37.97 
 
 		 382 aa  51.6  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.590798  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2391  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  35.71 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0404  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  39.24 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2730  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  37.37 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.517185  normal  0.993805 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2414  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  37.5 
 
 		 380 aa  48.5  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2495  adenine deaminase  26.29 
 
 		 575 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0813  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  36.84 
 
 		 373 aa  48.1  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0482974  normal  0.113643 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  27.89 
 
 		 377 aa  48.1  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  28.57 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1296  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  38.37 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.414356  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  28.57 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2957  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  38.37 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0539049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0149  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  31.51 
 
 		 401 aa  47  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2217  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  40 
 
 		 390 aa  47.4  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5663  dihydroorotase  31.45 
 
 		 445 aa  47  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.359505 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0425  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  34.41 
 
 		 388 aa  47  0.0006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.393659  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0289  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  34.57 
 
 		 362 aa  47  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4174  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  42.42 
 
 		 376 aa  46.6  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0223  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  35.71 
 
 		 380 aa  45.8  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6234  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  36.96 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1216  adenine deaminase  32.53 
 
 		 576 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1419  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  38.04 
 
 		 743 aa  45.1  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  28.04 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6343  dihydroorotase  31.2 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10670  guanine deaminase  32.99 
 
 		 431 aa  45.4  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  28.04 
 
 		 377 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0120  dihydroorotase  30.89 
 
 		 439 aa  44.3  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1063  adenine deaminase  43.64 
 
 		 569 aa  44.7  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.833113  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1698  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  33.72 
 
 		 408 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.140517  normal  0.0310593 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0778  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  29.73 
 
 		 395 aa  44.7  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  28.41 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1870  dihydroorotase, multifunctional complex type  25.38 
 
 		 420 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0154  dihydroorotase (DHOase)  23.56 
 
 		 425 aa  43.5  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0741809  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5424  adenine deaminase  27.44 
 
 		 599 aa  43.5  0.006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.851483  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2201  adenine deaminase  37.88 
 
 		 594 aa  43.5  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000218331  normal  0.0229297 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0561  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  33.33 
 
 		 367 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.213636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0286  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  44.64 
 
 		 370 aa  43.5  0.007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.494242 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4155  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  33.33 
 
 		 367 aa  43.5  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1578  adenine deaminase  26.77 
 
 		 571 aa  43.1  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4842  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  42.11 
 
 		 413 aa  42.7  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.625043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>