68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeAg_B4727 on replicon NC_011149
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  97.88 
 
 
377 aa  754    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  100 
 
 
377 aa  769    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  97.88 
 
 
377 aa  757    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  97.88 
 
 
377 aa  753    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  97.35 
 
 
377 aa  750    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  83.55 
 
 
377 aa  660    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  79.31 
 
 
377 aa  619  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  66.49 
 
 
379 aa  518  1e-146  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  67.02 
 
 
377 aa  508  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  58.09 
 
 
378 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  48.13 
 
 
366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  47.55 
 
 
366 aa  302  7.000000000000001e-81  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  47.26 
 
 
366 aa  301  2e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  47.26 
 
 
366 aa  300  2e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  47.26 
 
 
366 aa  301  2e-80  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  47.26 
 
 
366 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  47.26 
 
 
366 aa  300  4e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  46.97 
 
 
366 aa  298  8e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  46.69 
 
 
366 aa  298  1e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  46.69 
 
 
366 aa  298  1e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  37.03 
 
 
370 aa  233  3e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  40.34 
 
 
395 aa  223  3e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  38.65 
 
 
395 aa  220  3.9999999999999997e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  35.8 
 
 
402 aa  206  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  35.96 
 
 
403 aa  204  2e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  36.13 
 
 
404 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  34.52 
 
 
402 aa  202  6e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  36.16 
 
 
383 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  34.47 
 
 
379 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  31.75 
 
 
379 aa  171  1e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  34.18 
 
 
426 aa  171  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  33.16 
 
 
425 aa  167  2e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  32.73 
 
 
431 aa  160  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  29.82 
 
 
412 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  32.49 
 
 
387 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  32.49 
 
 
387 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  32.49 
 
 
387 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  32.49 
 
 
387 aa  156  6e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  32.49 
 
 
387 aa  156  7e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  31.05 
 
 
425 aa  155  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  31.64 
 
 
427 aa  151  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  28.64 
 
 
427 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  29.83 
 
 
424 aa  150  4e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  31.41 
 
 
412 aa  148  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  31.52 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  29.08 
 
 
423 aa  145  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  27.7 
 
 
420 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  27.7 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  27.13 
 
 
414 aa  125  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  27.46 
 
 
417 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1735  amidohydrolase 3  35.23 
 
 
587 aa  50.1  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2091  amidohydrolase 3  38.14 
 
 
560 aa  49.3  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.211257  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3660  N-acyl-D-amino-acid deacylase  42.65 
 
 
532 aa  48.1  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0822791  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1302  dihydroorotase  40.45 
 
 
533 aa  47.8  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0050942  normal  0.521882 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0261  dihydropyrimidinase  24.44 
 
 
474 aa  47.4  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1555  adenine deaminase  32.5 
 
 
568 aa  45.4  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1984  isoaspartyl dipeptidase  41.79 
 
 
389 aa  46.2  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0882  amidohydrolase 3  32.95 
 
 
579 aa  45.1  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.480099  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5093  N-acyl-D-amino-acid deacylase  38.71 
 
 
494 aa  45.1  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00480971  normal  0.666286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2047  isoaspartyl dipeptidase  28.09 
 
 
389 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.508278  normal  0.0331163 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2108  dihydropyrimidinase  31.71 
 
 
489 aa  44.3  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7538  allantoinase protein  35.16 
 
 
458 aa  44.3  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2391  isoaspartyl dipeptidase  28.41 
 
 
390 aa  43.9  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.298373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0356  amidohydrolase 3  37.1 
 
 
577 aa  43.9  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4426  phosphonate metabolism protein PhnM  24.8 
 
 
374 aa  43.5  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0848  imidazolonepropionase  46.51 
 
 
446 aa  43.5  0.006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0633495 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6703  D-glutamate deacylase  40.32 
 
 
497 aa  43.1  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.103433 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6029  N-acyl-D-amino-acid deacylase  37.89 
 
 
491 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.140081  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>