105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_5090 on replicon NC_011988
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  84.86 
 
 		 402 aa  708    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  84.08 
 
 		 404 aa  708    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  100 
 
 		 403 aa  820    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  84.67 
 
 		 402 aa  700    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  37.24 
 
 		 370 aa  243  6e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  40.31 
 
 		 395 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  37.54 
 
 		 395 aa  229  5e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  37.03 
 
 		 377 aa  213  5.999999999999999e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  36.07 
 
 		 377 aa  212  1e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  37.22 
 
 		 379 aa  209  8e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  35.87 
 
 		 379 aa  207  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  36.26 
 
 		 377 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  36.26 
 
 		 377 aa  206  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  35.67 
 
 		 377 aa  206  7e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  36.26 
 
 		 377 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  35.96 
 
 		 377 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  35.56 
 
 		 379 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  34.34 
 
 		 378 aa  196  6e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  35.69 
 
 		 377 aa  194  3e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  34.81 
 
 		 366 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  35.4 
 
 		 366 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  34.83 
 
 		 366 aa  189  1e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  35.4 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  35.69 
 
 		 366 aa  188  1e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  35.4 
 
 		 366 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  35.1 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  35.1 
 
 		 366 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  36.29 
 
 		 426 aa  188  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  33.43 
 
 		 383 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  35.1 
 
 		 366 aa  187  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  35.1 
 
 		 366 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  34.96 
 
 		 425 aa  177  2e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  32.76 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  32.76 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  32.76 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  32.76 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  32.76 
 
 		 387 aa  174  2.9999999999999996e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  33.07 
 
 		 399 aa  164  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  32.17 
 
 		 427 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  28.06 
 
 		 424 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  32.56 
 
 		 423 aa  163  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  31.35 
 
 		 417 aa  162  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  30.93 
 
 		 414 aa  162  9e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  31.85 
 
 		 431 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  32.22 
 
 		 412 aa  159  9e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  27.89 
 
 		 427 aa  157  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  26.48 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  27.12 
 
 		 420 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  31.04 
 
 		 412 aa  147  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  27.51 
 
 		 425 aa  145  9e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  23.86 
 
 		 379 aa  55.1  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  22.32 
 
 		 444 aa  50.8  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2337  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.89 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  33.33 
 
 		 432 aa  49.7  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  34.72 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  34.72 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  34.72 
 
 		 431 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  40 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11410  dihydroorotase  34.72 
 
 		 430 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.578109  normal  0.21222 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  40 
 
 		 425 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  30.25 
 
 		 400 aa  48.9  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2537  dihydroorotase  47.76 
 
 		 428 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.246477  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  23.84 
 
 		 389 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3630  amidohydrolase family protein  50 
 
 		 525 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2584  dihydroorotase, multifunctional complex type  40 
 
 		 437 aa  47.4  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  34.25 
 
 		 442 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2075  amidohydrolase  41.1 
 
 		 389 aa  47  0.0006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.526521  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5244  dihydroorotase  36.84 
 
 		 433 aa  46.6  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937093  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3739  dihydroorotase  46.27 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.170477  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3630  dihydroorotase  46.27 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0903342  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4027  dihydroorotase  46.27 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.010656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3986  dihydroorotase  46.27 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000655429  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3902  dihydroorotase  46.27 
 
 		 428 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000925562 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3933  dihydroorotase  46.27 
 
 		 428 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00841625  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3647  dihydroorotase  46.27 
 
 		 428 aa  46.6  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.482567  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1619  dihydroorotase  38.64 
 
 		 433 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2190  N-acetylglucosamine 6-phosphate deacetylase  37.33 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2192  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.64 
 
 		 433 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.402118 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3715  dihydroorotase  52 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0388724  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0184  N-acetylglucosamine-6-phosphate deacetylase  44.62 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0749437  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2323  dihydroorotase  25.4 
 
 		 425 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.769688  normal  0.0470654 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  29.41 
 
 		 396 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3937  dihydroorotase  52 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00122495  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  30.48 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  39.13 
 
 		 461 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  52.27 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  39.71 
 
 		 423 aa  45.4  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2329  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.36 
 
 		 433 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2241  dihydroorotase, multifunctional complex type  36.36 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4435  amidohydrolase  42.55 
 
 		 451 aa  44.7  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1255  dihydroorotase  44.78 
 
 		 428 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.329387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.81 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1641  amidohydrolase 3  39.74 
 
 		 590 aa  44.3  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0757893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  32.93 
 
 		 403 aa  43.9  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  23.55 
 
 		 389 aa  43.9  0.005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17580  amidohydrolase, imidazolonepropionase  34.72 
 
 		 402 aa  43.9  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.621112  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1462  adenine deaminase  24.17 
 
 		 567 aa  43.5  0.007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  29.13 
 
 		 411 aa  43.1  0.008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6922  imidazolonepropionase  32.94 
 
 		 420 aa  43.1  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386795  normal  0.926184 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  39.47 
 
 		 451 aa  43.1  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>