84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5803 on replicon NC_011366
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011366  Rleg2_5803  dihydroorotase  100 
 
 
404 aa  820    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.306417  normal  0.050491 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6703  dihydroorotase  94.28 
 
 
402 aa  778    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.235788 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5090  dihydroorotase  84.08 
 
 
403 aa  708    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  86.07 
 
 
402 aa  711    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0675  amidohydrolase  36.89 
 
 
370 aa  241  2e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4254  dihydroorotase  39.58 
 
 
395 aa  236  4e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0916  dihydroorotase  37.61 
 
 
395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4371  dihydroorotase  38.72 
 
 
379 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0429  dihydroorotase  38.14 
 
 
377 aa  213  7e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634096  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0919  dihydroorotase  37.03 
 
 
377 aa  211  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4376  dihydroorotase  37.46 
 
 
379 aa  209  6e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.430681  normal  0.791891 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4846  dihydroorotase  36.71 
 
 
377 aa  207  3e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4825  dihydroorotase  36.42 
 
 
377 aa  206  8e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4791  dihydroorotase  36.42 
 
 
377 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4696  dihydroorotase  35.84 
 
 
377 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.531695 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4727  dihydroorotase  36.13 
 
 
377 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0106  dihydroorotase  36.42 
 
 
378 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3154  dihydroorotase  34.66 
 
 
377 aa  198  1.0000000000000001e-49  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3928  dihydroorotase  36.09 
 
 
379 aa  194  2e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0785792  normal  0.0338469 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0177  amidohydrolase  34.94 
 
 
383 aa  192  8e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2448  aminohydrolase domain-containing protein  36.42 
 
 
426 aa  192  1e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5003  dihydroorotase  34.56 
 
 
366 aa  190  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4975  dihydroorotase  33.71 
 
 
366 aa  189  7e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4988  dihydroorotase  33.71 
 
 
366 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0260  dihydroorotase  34.28 
 
 
366 aa  188  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0312532  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4960  dihydroorotase  33.71 
 
 
366 aa  188  2e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4580  dihydroorotase  33.99 
 
 
366 aa  188  2e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5100  dihydroorotase  33.43 
 
 
366 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4740  dihydroorotase  33.43 
 
 
366 aa  187  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.185439  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4599  dihydroorotase  33.71 
 
 
366 aa  186  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231727  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4689  dihydroorotase  33.71 
 
 
366 aa  186  7e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0558  amidohydrolase 3  34.67 
 
 
425 aa  181  1e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4812  putative metallo-dependent hydrolase  33.05 
 
 
387 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4693  putative metallo-dependent hydrolase  33.05 
 
 
387 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4682  putative metallo-dependent hydrolase  33.05 
 
 
387 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0195401  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4833  putative metallo-dependent hydrolase  33.05 
 
 
387 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.489997  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4778  putative metallo-dependent hydrolase  33.05 
 
 
387 aa  172  1e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.336327  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3969  amidohydrolase  31.53 
 
 
427 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.209336  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3134  amidohydrolase  34.38 
 
 
399 aa  166  5e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3965  amidohydrolase  30.93 
 
 
414 aa  163  6e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.690591  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2453  dihydroorotase  32.56 
 
 
423 aa  162  9e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0512688  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3350  dihydroorotase  32.44 
 
 
431 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000731035  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1052  dihydroorotase  26.56 
 
 
420 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0770373  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2441  dihydroorotase  31.47 
 
 
417 aa  155  9e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.214517  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5700  dihydroorotase  27.93 
 
 
424 aa  155  2e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.187758  hitchhiker  0.00402648 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4546  dihydroorotase  26.75 
 
 
420 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.225827 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5828  dihydroorotase  25.93 
 
 
427 aa  149  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000105478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6462  dihydroorotase  31.13 
 
 
412 aa  147  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815548  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  25.97 
 
 
425 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  30.95 
 
 
412 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0552  isoaspartyl dipeptidase  25.28 
 
 
379 aa  58.9  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00201012  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  33.87 
 
 
411 aa  53.9  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2665  isoaspartyl dipeptidase  23.93 
 
 
389 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2337  dihydroorotase, multifunctional complex type  44.59 
 
 
436 aa  52.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  37.93 
 
 
432 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2584  dihydroorotase, multifunctional complex type  42.86 
 
 
437 aa  49.7  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1260  dihydroorotase  52.08 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1285  dihydroorotase  52.08 
 
 
425 aa  49.3  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11410  dihydroorotase  40.28 
 
 
430 aa  48.9  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.578109  normal  0.21222 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09430  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  40.58 
 
 
506 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.392423  normal  0.26761 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2411  dihydroorotase  38.89 
 
 
431 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.232694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2405  dihydroorotase  38.89 
 
 
431 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329959  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2351  isoaspartyl dipeptidase  23.65 
 
 
389 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2364  dihydroorotase  38.89 
 
 
431 aa  48.1  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0882743  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  30.77 
 
 
400 aa  47.4  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  42.19 
 
 
394 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  31.85 
 
 
411 aa  46.6  0.0009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5244  dihydroorotase  39.47 
 
 
433 aa  46.6  0.0009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.937093  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2276  amidohydrolase  31.43 
 
 
396 aa  45.8  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  35.63 
 
 
412 aa  45.8  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2661  dihydroorotase  38.36 
 
 
442 aa  46.2  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2899  amidohydrolase  26.83 
 
 
482 aa  45.1  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.996179  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2549  imidazolonepropionase  46 
 
 
407 aa  45.1  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2025  amidohydrolase  46.81 
 
 
504 aa  44.7  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2365  amidohydrolase  39.29 
 
 
470 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  43.48 
 
 
461 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1348  hypothetical protein  35 
 
 
629 aa  44.7  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0997  dihydroorotase, multifunctional complex type  44 
 
 
434 aa  44.3  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3381  amidohydrolase  47.5 
 
 
455 aa  44.3  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.936479  normal  0.571146 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  39.71 
 
 
398 aa  44.3  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0061  amidohydrolase  22.25 
 
 
444 aa  43.9  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0182363 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4896  N-acyl-D-amino-acid deacylase family protein  37.07 
 
 
480 aa  43.9  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.591808  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2471  amidohydrolase  46.81 
 
 
480 aa  43.9  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.356182  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3373  amidohydrolase  36.92 
 
 
469 aa  42.7  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.510677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>