208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_5340 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_5340  cytosine deaminase  100 
 
 		 398 aa  790    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.916996  normal  0.0339221 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2120  cytosine deaminase  77.84 
 
 		 405 aa  599  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2388  cytosine deaminase  72.63 
 
 		 401 aa  573  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4900  cytosine deaminase  61.64 
 
 		 394 aa  474  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.375518 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5450  cytosine deaminase  61.89 
 
 		 394 aa  455  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.680262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0068  cytosine deaminase  61.38 
 
 		 394 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5236  cytosine deaminase  61.89 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5623  cytosine deaminase  61.89 
 
 		 394 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280185  normal  0.0436616 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4607  cytosine deaminase  61.89 
 
 		 394 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0374534  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3225  cytosine deaminase  61.79 
 
 		 394 aa  419  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.481087 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5791  cytosine deaminase  45.13 
 
 		 397 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.159101  hitchhiker  0.000445304 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0416  cytosine deaminase  42.82 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.156504 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3146  cytosine deaminase  39.85 
 
 		 398 aa  293  3e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0344  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  43.41 
 
 		 413 aa  284  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0274445  normal  0.270951 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7204  cytosine deaminase  41.88 
 
 		 400 aa  280  3e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.964335 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3184  cytosine deaminase  43.24 
 
 		 393 aa  269  8e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.379917  normal  0.0692184 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2101  hydrolase  40.95 
 
 		 399 aa  267  2.9999999999999995e-70  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0538  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  41.94 
 
 		 399 aa  262  6.999999999999999e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00000264228  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3349  Amidohydrolase 3  41.82 
 
 		 401 aa  257  2e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1703  Amidohydrolase 3  39.9 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.152094  normal  0.126006 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1451  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  39.89 
 
 		 395 aa  246  6e-64  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.885919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3600  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  37.06 
 
 		 410 aa  243  3.9999999999999997e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28020  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  38.78 
 
 		 414 aa  242  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.151535  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3228  cytosine deaminase  39.94 
 
 		 405 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00169195  normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3590  cytosine deaminase  39.77 
 
 		 405 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.682581  normal  0.610858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1061  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  37.99 
 
 		 409 aa  232  7.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5235  cytosine deaminase  36.9 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5624  cytosine deaminase  36.9 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.209755  normal  0.0165356 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0067  cytosine deaminase  37.43 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.811575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4606  cytosine deaminase  37.46 
 
 		 399 aa  230  3e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0684595  hitchhiker  0.000388798 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3224  cytosine deaminase  39.09 
 
 		 399 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.717202  normal  0.270868 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2348  cytosine deaminase  38.4 
 
 		 397 aa  222  7e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.10962  normal  0.523388 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4847  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  37.82 
 
 		 376 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.547293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4728  putative deaminase  33.5 
 
 		 414 aa  213  3.9999999999999995e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4389  putative deaminase  34.95 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4230  putative deaminase  34.95 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4242  putative deaminase  34.68 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.796555  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4607  putative deaminase  34.95 
 
 		 416 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4611  putative deaminase  33.15 
 
 		 413 aa  210  4e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4631  putative deaminase  33.74 
 
 		 413 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0624  putative deaminase  32.34 
 
 		 413 aa  203  5e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.693266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4331  putative deaminase  32.32 
 
 		 415 aa  202  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4388  putative deaminase  30.96 
 
 		 421 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4229  putative deaminase  30.94 
 
 		 421 aa  200  3e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4727  putative deaminase  30.96 
 
 		 414 aa  201  3e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4606  putative deaminase  30.96 
 
 		 414 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4824  amidohydrolase 3  39.07 
 
 		 413 aa  199  6e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.783047  normal  0.0849144 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4241  putative deaminase  30.71 
 
 		 421 aa  199  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0096  putative deaminase  33.33 
 
 		 464 aa  180  4e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1057  putative deaminase  33.83 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.938222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3622  amidohydrolase 3  31.5 
 
 		 403 aa  170  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.495832  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4007  amidohydrolase 3  34.63 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0354  putative deaminase  31.78 
 
 		 460 aa  159  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0384  putative deaminase  31.52 
 
 		 414 aa  159  9e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0342  putative deaminase  31.52 
 
 		 414 aa  159  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00279  deaminase  31.27 
 
 		 460 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3282  Amidohydrolase 3  31.27 
 
 		 460 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00283  hypothetical protein  31.27 
 
 		 460 aa  157  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3299  putative deaminase  31.27 
 
 		 460 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0389  putative deaminase  31.07 
 
 		 460 aa  156  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.776675 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3140  putative deaminase  32.39 
 
 		 459 aa  155  9e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0789  Amidohydrolase 3  25.81 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7130  putative deaminase  29.92 
 
 		 445 aa  154  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2105  putative N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.81 
 
 		 409 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2198  putative deaminase  30.11 
 
 		 445 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0098  Amidohydrolase 3  28.96 
 
 		 427 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.494742  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  29.27 
 
 		 413 aa  138  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0224  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.01 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0460  amidohydrolase  28.81 
 
 		 407 aa  137  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000769094  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3603  amidohydrolase 3  32.5 
 
 		 432 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.893721  normal  0.0414709 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0844  cytosine deaminase  29.29 
 
 		 423 aa  129  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0318  cytosine deaminase  29.44 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2788  cytosine deaminase  29.17 
 
 		 440 aa  127  5e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.22354  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3792  cytosine deaminase  28.75 
 
 		 433 aa  127  5e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0183324 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2518  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  31.09 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0236698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2162  amidohydrolase 3  30.37 
 
 		 415 aa  124  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0572515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6176  cytosine deaminase  27.49 
 
 		 429 aa  123  5e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0175267  normal  0.144345 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5704  Cytosine deaminase  30.62 
 
 		 436 aa  123  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.561691  normal  0.731459 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1943  cytosine deaminase  29.14 
 
 		 422 aa  123  6e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.115146  hitchhiker  0.0000891161 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4568  cytosine deaminase  30.32 
 
 		 426 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000171713  normal  0.0375176 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0258  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.23 
 
 		 412 aa  122  9.999999999999999e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000289876  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2084  amidohydrolase  28.68 
 
 		 411 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.680329  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2936  cytosine deaminase  28.24 
 
 		 422 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3632  cytosine deaminase  28.86 
 
 		 426 aa  119  7e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4430  cytosine deaminase  29.73 
 
 		 424 aa  119  7.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.367295  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2102  aminohydrolase protein  27.62 
 
 		 406 aa  119  9e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.927814  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3694  cytosine deaminase  28.86 
 
 		 426 aa  119  9e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00291  cytosine deaminase  27.88 
 
 		 427 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3269  N-isopropylammelide isopropylaminohydrolase  27.88 
 
 		 427 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0368  cytosine deaminase  27.88 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3288  cytosine deaminase  27.88 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3597  cytosine deaminase  28.86 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00295  hypothetical protein  27.88 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3525  cytosine deaminase  28.86 
 
 		 426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0402  cytosine deaminase  27.88 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0361  cytosine deaminase  27.88 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1960  cytosine deaminase  28.5 
 
 		 425 aa  117  3e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6355  cytosine deaminase  26.73 
 
 		 429 aa  117  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.616526  normal  0.149808 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2654  cytosine deaminase  28.99 
 
 		 426 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.689557  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4007  cytosine deaminase  28.92 
 
 		 424 aa  116  6e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0483296  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>